🧬 生物学

Explainable Protein Language Model Embeddings for Rapid Antibiotic Resistance Gene Classification

本論文では、ESM2タンパク質埋め込みとロジスティック回帰を活用することで、抗生物質耐性遺伝子を5つの主要なクラスに迅速かつ正確に分類し、99.25%の精度を達成するとともに、SHAP分析による解釈可能な洞察とアクセシブルなウェブインターフェースを提供する、説明可能な機械学習フレームワークであるResiScanを紹介する。

M. Deepthi, S. Muthukumar, D. Vijayakumar2026-10-29
🧬 生物学

Genome-wide association study in Arabidopsis reveals IAN genes regulate pollen heatwave tolerance

本研究は、新規の機械学習を用いた表現型解析およびゲノムワイド関連解析を通じて、免疫関連ヌクレオチド結合(IAN)遺伝子のクラスターがシロイヌナズナにおける花粉の熱波耐性の負の調節因子であることを特定しており、これらが気候変動に強い作物の育種における潜在的な標的となることを示唆している。

Max Frencken, Daan M. van den Brink, Jeroen van den Hurk, Lotte van der Krabben, Elise A.R. Serin, Ivo Rieu2026-10-29
🧬 生物学

A five-gene risk model based on carnitine-related genes for predicting prognosis in ovarian cancer

本研究では、カルニチン関連遺伝子(ALPL、RAB38、SLC4A8、ZMAT4、および IGLON5)に基づく5遺伝子の予後リスクモデルを構築して卵巣がん患者を高リスク群と低リスク群に層別化し、生存アウトカム、免疫浸潤、および薬物感受性との有意な関連性を明らかにした。

Lan Liu, Xinfang Liu, Ping Luo, Xinyan Fu, Yanhui Ding, Fanfan Li, Yue Wu, Yongcang Zhang2026-10-29
🧬 生物学

Habitat heterogeneity drives the community assembly of Caridina spp. in Lake Poso, Sulawesi, with implications for lake conservation

本研究は、微細生息地の異質性、特に鉗(はさみ)の形態といった機能的形質が、ポソ湖における固有種であるテッポウエビ属(*Carina*)のコミュニティ形成を駆動していることを実証しており、高い生息適性と人間活動による撹乱との間に重要な重複が存在することを明らかにしており、この古 lakes 生態系に対する標的を絞った保全計画が必要であることを示している。

Diky Dwiyanto, Mihwan Sataral, Kurniawan P. Bandjolu, Daisy Wowor, Annawaty Annawaty, Achmad Farajallah, Dyah Perwitasar (…)2026-10-29
🧬 生物学

Effect of Metformin on tau pathology and proteostasis in cellular and a Drosophila model of Tauopathy

本研究は、メトホルミンがAKTおよびAMPKシグナル伝達を調節し、ホスファターゼ活性を維持することによって、特定のタウオパチーモデルにおけるタウの過リン酸化を抑制し神経変性を改善することを実証するとともに、これらの治療効果が総タウ量やオートファジーの状態とは独立しており、それらについては食事や性別が影響を与えることを明らかにしている。

Srinithya Paruchuri, Lovesha Sivanantharajah, Amritpal Mudher, Shreyasi Chatterjee2026-10-29
🧬 生物学

Pre-symptomatic biophysical profiling as a candidate approach for early screening of cowpea mild mottle virus tolerance in common bean

本研究は、OJIPクロロフィルa蛍光プロファイリングが、コウテイマメモザイクウイルス接種後わずか1日でインゲンマメにおける発症前の光合成障害を検出できることを示しており、育種プログラムにおいて耐性遺伝子型と感受性遺伝子型の判別を行うための、迅速かつ非破壊的なツールを提供するものである。

William Rafael Ribeiro, Leonardo José Motta Campos, Amanda Lopes Ferreira, Matheus Costa Moura, Paula Arielle M. Ribeiro (…)2026-10-29
🧬 生物学

CsMIEL1-CsMYB113 regulatory module mediates temperature-dependent anthocyanin accumulation in blood orange

本研究は、高温がユビキチンリガーゼCsMIEL1を誘導して転写因子CsMYB113をユビキチン化および分解させることで、色素生成に必要な主要な生合成遺伝子の発現を抑制し、それによってブラッドオレンジにおけるアントシアニン蓄積を阻害することを明らかにしている。

Haijian Yang, Lixin Wang, Hao Chen, Juxun Wu, Liqing Lu2026-10-29
🧬 生物学

Nervous system mediated cardiac arrest in mangrove killifish

本研究は、マングローブ・キルフィッシュの胚が物理的な刺激に対して、神経系を介した特有かつ可逆的な心停止を示すことを明らかにしており、保存された神経心臓メカニズムに関する新たな知見を提供するとともに、心拍リズム調節の研究におけるモデルとしての本種の地位を確立するものである。

Tetsuhiro Kudoh, Rosalie Herbert, Alexander Corbett2026-10-29
🧬 生物学

The 67-bp Variable Duplication in the Bovine ADIPOQ Promoter Is Associated with Fat-Related Carcass Traits and Modulates Promoter Activity through a HES5-Responsive Motif

本研究は、ウシの*ADIPOQ*プロモーターにおける67-bpの可変的な重複が、HES5応答モチーフを介して遺伝子発現のコピー数依存的な抑制因子として機能すること、および高青種黒牛における脂肪関連の枝肉形質における変異と有意に関連していることを示している。

Yufu Li, Qunli Li, Peidong Qu, Aixin Li, Chuanying Pan, Ningbo Chen, Enhui Jiang, Xianyong Lan2026-10-29