🧬 生物学

Rhizobacterial genetic diversity associated with Paspalum atratum and Paspalum notatum by metagenomic analysis

*Paspalum atratum*および*Paspalum notatum*の根圏のメタゲノム解析は、土壌pHによって駆動される、種特異的な細菌コミュニティ組成の違いを明らかにしており、*P. atratum*では*Acidobacteriaceae*が優占し、*P. notatum*では*Nitrosomonadaceae*が特徴となっている。

Ailton Ferreira de Paula, Paulo Henrique Marques de Andrade, Euclides Matheucci, Marcelo Falsarella Carazzolle, Lucas Mi (…)2026-10-28
🧬 生物学

Accessory-genome diversity and contrasting genotype–phenotype relationships in ten porcine Streptococcus suis isolates representing five serotypes

本研究は、10株の*Streptococcus suis*分離株の比較ゲノミクスと実験的表現型解析を統合することで、特定の耐性遺伝子が薬剤感受性を強く予測する一方で、古典的な病原性マーカーは病原性を正確に順位付けできないことを明らかにし、ゲノムデータと表現型アッセイの組み合わせの必要性と、セロタイプ2を超えた病原性評価の拡大の重要性を強調している。

Hongqiao Lai, Hengzhi Zhu, Zenghao Xiang, Na Li, Jingze Song, Yonghong Qu, Kongwang He, Jiaqiang Niu, Libin Wen, Qi Xiao2026-10-28
🧬 生物学

Drivers of variation in nocturnal insect prey mass and quality

本研究は、空中捕食者にとっての夜行性昆虫の栄養価が分類、成虫の摂食戦略、および幼虫の生息環境によって決定されるものの、その実際の生態学的収益性は、最終的には捕食者の取り扱い能力とサイズ選択性によって制約されることを明らかにしている。

Alexandria E. Cosby, Genevieve B. Kleefisch, Andrew D. Young, Liam P. McGuire, Quinn M.R. Webber2026-10-28
🧬 生物学

Host taxonomy and temperature differentially shape gut microbiome assembly in tropical moths across an Andean-Amazonian Mountain gradient

本研究は、ペルーのアデス・アマゾン昇昇高度勾配における6つの熱帯蛾属の腸内マイクロバイオームの集合において、宿主の分類群と温度が異なる影響を与えていること、そして微生物の多様性が高標高で予想に反して増加していることを明らかにしている。

Andrea Pinos, Yenny Correa-Carmona, Kim L. Holzmann, Pedro Alonso-Alonso, Andreas Brachmann, Felipe Yon, Gunnar Brehm, I (…)2026-10-28
🧬 生物学

Metabolic engineering of Escherichia coli to enhance L-serine biosynthesis

本研究は、親株H5の再取り込み遺伝子の欠失および生合成、輸送、補酵素モジュールの最適化を系統的に行うことにより、菌株H8-abcと培地最適化を通じて、大腸菌における工業用L-セリン生産を向上させ、最終的に0.48 g/gへと71.84%の収率向上を達成した。

Kaitai Xiao, Yamin Huang, Meijuan Xu, Guoqiang Xu, Xiaojuan Zhang, Hui Li, Jingsong Shi, Zhenghong Xu, Xiaomei Zhang2026-10-28
🧬 生物学

Using machine learning and molecular docking technology to Elucidate the Molecular Pathway of Perfluorooctanoic Acid-Induced Ulcerative Colitis

本研究は、機械学習、ネットワーク毒性学、および分子ドッキングを統合し、ペルフルオロオクタン酸(PFOA)が潰瘍性大腸炎を誘発する際の極めて重要な分子標的として、6つのコア遺伝子(MEP1B、NAAA、PANK3、SCD、SLC23A1、およびSLC6A14)を特定した。

丁岩 郭, 化中 孙2026-10-28
🧬 生物学

An Integrated One-Click Python Pipeline for Bacterial Codon-Usage Analysis and Proteome-Wide Characterization

本論文は、配列品質のフィルタリング、ヌクレオチドおよびコドン指標、ならびにタンパク質の物理化学的特性を単一の再現可能なワークフローに統合することで、細菌のコドン使用量およびプロテオーム全体の特性解析を効率化する、統合されたワンクリックのPythonパイプラインを提示するとともに、計算上の定義やリファレンスセットに起因する不一致に対処するためのさらなるベンチマークの必要性を認めるものである。

Ujwal Dahal2026-10-28
🧬 生物学

Overexpression of miR-183-5p Attenuates Hyperuricemic Nephropathy-Induced Renal Interstitial Fibrosis by Targeting Egr-1 and Inactivating the TGF-β1/Smad pathway

本研究は、miR-183-5pがEgr-1を直接標的としてダウンレギュレーションすることにより、TGF-β1/Smadシグナル伝達経路を抑制し、高尿酸血症誘発性の腎間質線維化を抑制することを実証している。

Jiachang Li, Yuhan Ma, Qiong Yuan, zhanle chen, Junhen zhao, ying yang, Jiali Wei2026-10-28
🧬 生物学

A duplicated Hedgehog ligand and a duplicated Patched receptor show different constraint and genomic context in land snails and slugs

本研究は、陸生カタツムリやナメクジにおいて、重複したHedgehogリガンド遺伝子とPatched受容体遺伝子が異なる進化の軌跡を辿っていることを明らかにしており、そこではHedgehogのコピーが特定のドメインにおける制約の緩和と急速な分岐を起こしている一方で、Patchedのコピーは強く保存され、かつ共線性(シンテニー)を維持しており、プロテオームに基づく目録では遺伝子のコピー数を過小評価する可能性があることを強調している。

Zhi-Jie Xu2026-10-28
🧬 生物学

Effects of DDX58 Gene Knockdown on EV-A71 Replication and Modulation of RIG-I–Mediated Antiviral

本研究は、RD細胞におけるDDX58(RIG-I)のノックダウンが、予想に反してEV-A71の複製を抑制すると同時に、下流の抗ウイルスシグナル伝達およびインターフェロン産生の、一過性かつ時間依存的な活性化を誘導することを示しており、これは複雑で文脈依存的な調節的役割と潜在的な代償的免疫メカニズムを示唆している。

Guo-E Gou, Mei Li, Meng Zhang, Xin-Yu Wang, Wen Zhang, Song Zhai, Mu-Qi Wang, Chen-Rui Liu, Ting Li, Ya-Ping Li2026-10-28