🧬 biology
MiShape: 3D Mitochondrial Shape Modelling for Fluorescence Microscopy
MiShapeは、高解像度の電子顕微鏡から得られた学習済みの3D形状事前分布を活用することで、単一の2D蛍光顕微鏡画像からミトコンドリアの3D形態を正確に再構成し、幾何学的およびトポロジー的な指標において既存の手法を凌駕する新しいフレームワークである。
🧬 Category
q-bio
1582 件の論文
🧬 biology
Benchmarking Classical, Hybrid, and Quantum Annealing Workflows on a Structured Control QUBO
本論文は、温室のヒーター・スケジューリングから導出された構造化されたバイナリ制御QUBOを用いて、古典的、ハイブリッド、および量子アニーリングのワークフローをベンチマークしており、古典的手法およびシミュレーションによる量子手法が一貫して最適解に近い解を算出する一方で、現在の量子ハードウェアおよびハイブリッドソルバーは、古典的なベースラインに対して性能上の優位性をまだ示していないことを見出した。
🧬 biology
Ecological constraints to mirror life
本論文は、鏡像生命体は分子レベルでの実現可能性があるにもかかわらず、栄養素の不適合性および既存の生物相による競争排除により、自然生態系において定着することは困難であり、深刻な生態学的制約に直面することになるであろうことを示す理論的枠組みを提示するものである。
🧬 biology
Case report on Variations of the Musculocutaneous Nerve
本症例報告は、解剖学実習において観察された筋皮神経の3つの異なる解剖学的変異を記録したものであり、それらには正中神経による機能的代償を伴う同神経の完全な欠如が2例、および烏口腕筋を支配した後に正中神経と合流する例が1例含まれており、これらはいずれも上肢の感覚および運動機能障害の診断において重要な臨床的意義を有している。
🧬 biology
Cross-species ncRNA annotation using synteny-constrained embedding similarity
本論文は、シンテニーに制約されたゲノムアライメントとRiNALMo RNA基盤モデルの埋め込みを組み合わせることで、従来の配列保存指標を補完する局在化した埋め込み支持領域を特定し、種を越えた非コードRNAアノテーションを向上させる新しいパイプラインであるCURIAを導入するものである。
🧬 biology
A single-cell atlas of cancer-educated ecotypes across high-risk pediatric sarcomas
本研究は、高リスク小児肉腫における腫瘍微小環境の包括的なシングルセルおよび空間アトラスを提示し、明確な細胞状態と12種類のTMEアーキタイプを定義することで、合理的な免疫療法を開発するための枠組みを提供する、保存された、あるいはエンティティ固有の多細胞ニッチを明らかにするものである。
🧬 biology
Unmasking the Black Box: Computational Evidence Identifying Mitochondrial ATP Synthase Subunit β as a High-Confidence Target of Glycyrrhetinic Acid Analogs Against Brugia malayi
本研究は、高信頼性のAlphaFold2モデルに対するプロテオームワイドなリバース分子ドッキングスクリーニングを用いることで、強力なマクロフィラリサイドであるグリチルレチン酸アナログ6aの、高信頼かつ構造的に妥当な分子標的としてミトコンドリアATP合成酵素サブユニットβを特定し、その観察された有効性とこれまで未知であった作用機序との間の溝を埋める計算科学的根拠を、バンクロフト糸状虫（*Brugia malayi*）に対して提示するものである。
🧬 biology
Diel variation in diving behaviour of rehabilitated grey seal juveniles (Halichoerus grypus) in the Baltic Sea
本研究は、リハビリテーションを受けた幼獣のバルト海アザラシが、日中は深く短い潜水、夜間は浅く長い潜水という特徴的な日周潜水パターンを示すことで、現地の環境に迅速に適応しており、これは放流後の行動調整が餌の分布に対して成功裏に行われたことを示唆していることを実証している。
🧬 biology
PolySUMOylation restrains ubiquitination to protect fragile genomic loci during replication stress in fission yeast
本研究は、分裂酵母において、ポリSUMO化が相同組換え因子Rad52のK63結合型ポリユビキチン化を抑制することによって、複製ストレス下での脆弱なリボソームDNAを保護し、それによってRad52の異常な蓄積とゲノム不安定性を防止していることを示している。
🧬 biology
CRISPRi loss-of-function mutations revealed through experimental evolution in Burkholderia cenocepacia
*Burkholderia cenocepacia*のCRISPRi変異体の実験的進化を通じて、研究者らは、野生型の増殖への表現型復帰が、CRISPRi機構自体の変異ではなく、dCas9発現の消失につながるラムノース取り込みの欠陥によって引き起こされたことを特定した。