🧬 生物学

Alpha- and Gamma-Synuclein Proteins Define Complementary Metabolic and Invasive Programs in Melanoma Development, Progression, and Prognosis

本研究は、メラノーマにおいてα-シヌクレインとγ-シヌクレインが相補的かつ負の相関関係にある悪性状態を定義しており、α-シヌクレインはミトコンドリア機能に関連する代謝プログラムを駆動し、γ-シヌクレインはインテグリン-FAK-MAPKシグナル伝達を介して浸潤プログラムを促進すること、そして高発現するγ-シヌクレインが予後不良の予測バイオマーカーとして機能することを明らかにしている。

Mauricio Menacho Marquez, Florencia Malizia, Lucía Zanotti, Mirco Mian, Pablo Martínez Ponce, Macarena Mamberto, Aylén A (…)2026-10-29
🧬 生物学

Different ways to disappear: transparency extends camouflage beyond background matching in heterogeneous environments

本研究は、カメレオンエビ(*Hippolyte varians*)において、有色の個体は背景と一致する場合に高い生存率を示すカムフラージュの専門家として機能する一方で、透明な個体は不均一な環境下で一貫しているもののトレードオフに制限のある生存率を持つジェネラリストとして機能することを示しており、これは環境の変動性がこれら代替的な戦略の共存を支えていることを示唆している。

Rafael Duarte, George Hancock, Gustavo Dias, Martin Stevens2026-10-29
🧬 生物学

Bacterial Species Classification from Full-Plate Culture Images Using Deep Learning: A Comparative Study of CNNs and Vision Transformers

本研究は、ファインチューニングされたVision Transformer(ViT-B/16)が、統一された実験プロトコルの下で、全プレート培養画像から19種の細菌を正確に分類することにおいて、ResNet50やDenseNet121といった従来のCNNアーキテクチャを上回り、平均精度99.05%を達成したことを実証している。

Abdulsalam Abdulsattar Abdulazez, Hussein Salim Abed, Aythem Khairi Kareem, Mustafa Nadhim OWAID, Ahmed Adil Nafea2026-10-29
🧬 生物学

Resource availability reshapes clonal recovery and trait coordination across fragment configurations of Salvinia natans

本研究は、浮遊シダの一種であるサルビニア・ナタンスにおいて、中程度の断片化が軽度または重度の断片化に対して示す成長上の優位性が高い資源可用性に依存すること、ならびに、異なる断片の構成が、変動する光および栄養条件に応答して、形質調整とネットワーク組織の明確なパターンを駆動することを実証している。

Hong Su, Yu Bai, Wenhui Zheng, Xihua Liu, Puming Li, Meng Zhang2026-10-29
🧬 生物学

Interfacial origin of label-free potentiodynamic fingerprints during bacterial growth in blood culture

本研究は、血液培養中の細菌増殖中に生成されるラベルフリーのポテンショダイナミック・フィンガープリントが、バルクの代謝変化や酸性化のみによるものではなく、主に細菌と電極の間の接着や局所的な代謝活動といった動的な細菌-電極界面相互作用に由来するものであることを示している。

Thibaut Babin, Stephan Pissot, Laura Bernard, Pierre R. Marcoux, Maxime Gougis, Pascal Mailley2026-10-29
🧬 生物学

Uncertainty-aware benchmarking reveals ambiguous transcripts in mRNA–lncRNA classification

本研究は、lncRNAおよびmRNAの分類におけるツール間の顕著な不一致を明らかにする不確実性を考慮したベンチマークフレームワークを導入し、リピート由来の特徴量と二次構造解析を組み込むことが、曖昧な転写物の特定に役立ち、より堅牢な分類器の開発を導くことを示している。

Daniel Garcia-Ruano, Mikaël Georges, Saswat K. Mohanty, Rahma Baaziz, Kateryna D. Makova, Macha Nikolski, Domitille Chal (…)2026-10-29
🧬 生物学

Antitumor Effects of Quercetin and Luteolin in MeWo Melanoma Cells: Potential Association with GPER Signaling

クエルセチンおよびルテオリンは、GPERシグナル伝達経路の調節を通じたP-ERK、c-Myc、およびP-Aktの発現変化によって、アポトーシスを誘導し、細胞周期を停止させ、かつ遊走を抑制することにより、MeWoメラノーマ細胞に対して抗腫瘍効果を発揮することが、GPERアンタゴニストであるG15によってその変化が逆転することから示されている。

shtaywy Abdalla, shaimaa Hussein, Noor Tarawneh, Nidaa Ababneh, Abdullah Awidi2026-10-29
🧬 生物学

Explainable Protein Language Model Embeddings for Rapid Antibiotic Resistance Gene Classification

本論文では、ESM2タンパク質埋め込みとロジスティック回帰を活用することで、抗生物質耐性遺伝子を5つの主要なクラスに迅速かつ正確に分類し、99.25%の精度を達成するとともに、SHAP分析による解釈可能な洞察とアクセシブルなウェブインターフェースを提供する、説明可能な機械学習フレームワークであるResiScanを紹介する。

M. Deepthi, S. Muthukumar, D. Vijayakumar2026-10-29
🧬 生物学

Genome-wide association study in Arabidopsis reveals IAN genes regulate pollen heatwave tolerance

本研究は、新規の機械学習を用いた表現型解析およびゲノムワイド関連解析を通じて、免疫関連ヌクレオチド結合(IAN)遺伝子のクラスターがシロイヌナズナにおける花粉の熱波耐性の負の調節因子であることを特定しており、これらが気候変動に強い作物の育種における潜在的な標的となることを示唆している。

Max Frencken, Daan M. van den Brink, Jeroen van den Hurk, Lotte van der Krabben, Elise A.R. Serin, Ivo Rieu2026-10-29
🧬 生物学

A five-gene risk model based on carnitine-related genes for predicting prognosis in ovarian cancer

本研究では、カルニチン関連遺伝子(ALPL、RAB38、SLC4A8、ZMAT4、および IGLON5)に基づく5遺伝子の予後リスクモデルを構築して卵巣がん患者を高リスク群と低リスク群に層別化し、生存アウトカム、免疫浸潤、および薬物感受性との有意な関連性を明らかにした。

Lan Liu, Xinfang Liu, Ping Luo, Xinyan Fu, Yanhui Ding, Fanfan Li, Yue Wu, Yongcang Zhang2026-10-29