🧬 biology

HiFi-ST: High-Fidelity Reconstruction of Continuous Spatial Transcriptomic Expression Fields via Conditional Neural Fields

HiFi-STは、スポットを領域的な観測値としてモデル化し、マルチスケールの組織特徴を統合することで、連続的な空間トランスクリプトーム発現場を再構成する条件付きニューラルフィールドフレームワークを導入しており、それによって既存の手法を精度において大幅に上回り、腫瘍微小環境の特性評価のような高度なダウンストリーム解析を可能にしている。

Lei Tang, Wenshuai Han, Xiao Yang, Xiaozhou Chen, Huamei Li2026-07-16
🧬 biology

MaEIN2 links ethylene signaling to chlorogenic acid accumulation in mulberry leaves in response to silkworm-feeding

本研究は、エチレンシグナル伝達成分であるMaEIN2が、桑の葉における食害誘発性のクロロゲン酸蓄積を媒介し、それによってカイコの摂食シグナルと植物防御の強化を結びつけ、潜在的にカイコの成長を支持していることを示している。

Peihong Liu, Qingxin Yao, Guang Yang, Nan Chao, Mengqi Li, Hongyan Lin, Rongjun Fang, Li Liu2026-07-16
🧬 biology

Global evolutionary pattern and distinct metabolic strategies of sulfur-cycling microorganisms across ecosystems

本研究は、海洋やヒトの腸内における新規分類群や非標準的な経路の特定を含め、多様な生態系における硫黄循環微生物の進化動態と特異な代謝戦略を明らかにするための、硫黄代謝遺伝子の精査された知識ベースであるDiSuCyを導入するものである。

Song-Can Chen, Tomohisa Tanabe, Chengliang Sun, Jing-Ling Yan, Xin-Yue Ren, Alexander Loy2026-07-16
🧬 biology

Seasonal Dynamics of Microbial Communities, Co-occurrence Networks, and Grazing-Mediated Carbon Flow Characteristics

本研究は、定海湾における季節的な環境変動が、微生物コミュニティの組成、集合プロセス、およびネットワーク構造の並行した変化を駆動すると同時に、植物プランクトンおよびバクテリオプランクトンからの摂食を介した炭素流動の効率を変化させ、その過程において植物プランクトンが一貫して主要な炭素源として機能していることを明らかにしている。

Guoqiang Shen, Qianqian Liu, Peng Xiao, Lianming Zheng, Chengxu Zhou, Zhongzhou Lin, Zhuoyi Zhu, Wenjing Zhang2026-07-16
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WATER: A Framework for Reconstructing Temporal Gene Expression Trajectories and Detecting Molecular Heterochrony Across Development and Disease

本論文は、発生および疾患の文脈における分子的なヘテロクロニー(遺伝子発現のタイミングのずれ)を検出するために、独立した時間的遺伝子発現軌跡を再構成する計算フレームワークであるWATERを紹介しており、従来のステージ一致比較が見落としてしまう広範な転写再編成を明らかにしている。

Rahul Kanadia, Saren Springer, Kevon Afriyie, Abigail Boria, Isabella Stevens, Katarina Micin, Vanessa Aguiar-Pulido2026-07-16
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The organizing unit of GPCR activation-switch architecture: a phylogenetic-scale census

本研究は、GPCRの活性化スイッチ構造がリガンドの同一性によってではなく、イオンロック、Tyr5.58、およびナトリウムポケット残基を含む共進化的な構造ネットワークによって組織されており、それが保存されたDRYアルギニンを安定化させるために多様で系統特異的なメカニズムを利用していることを明らかにしている。

Huazhang Shen2026-07-16
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Integrated carrying capacity: A holistic approach towards population target setting for conflict-prone threatened wildlife

本研究は、生態学的、生物学的、および社会的側面を組み合わせた統合的な環境収容力フレームワークを提案し、雲南省における中国の野生のアジアゾウをケーススタディとして用いることで、人間の許容度を優先し、土地利用政策を保全目標に適合させることを提唱しつつ、紛争のリスクにさらされている絶滅危惧種の、エビデンスに基づいた文脈依存的な個体数目標を確立するものである。

Hao Gu2026-07-16
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A multi-tissue transcriptome and expression atlas of Astacus leptodactylus: assembly and annotation

本研究は、37個のRNA-seqサンプルから構築され、機能的な完全性が検証された、ニホシラスコザエミ(*Astacus leptodactylus*)の高精度な多組織トランスクリプトームおよび発現アトラスを提示するものであり、これにより、非モデル甲殻類におけるイオンチャネル研究および機能ゲノミクスのための基礎的なリソースを確立するものである。

Berk Sağlam, Mehmet Akgun, Bora Ergin, Nuhan Purali2026-07-16
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A mechanistic framework for interspecific variation in vertebrate developmental radiosensitivity under chronic ionizing radiation

本研究は、20件の実験研究および9件の論文の構造化された統合に基づき、放射性核種の生物蓄積、代謝率、解剖学的遮蔽、および増殖動態といった要因を統合することで、慢性的な電離放射線下における脊椎動物の発達段階における放射線感受性の種間変異を説明する統一的なメカニズム的枠組みを提案するものである。

Bogdan Dmirtievitch2026-07-16