Mendel, a foundation model of human genetic variation, prioritizes regulatory variants and improves gene expression prediction
Mendelは、変異中心の目的関数を用いて学習された新しいDNA基盤モデルであり、アレルイベントの予測においてEvo 2のような既存のモデルを凌駕し、効果的に調節変異を優先させ、ヒトの各組織における遺伝子発現予測を大幅に向上させている。
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Mendelは、変異中心の目的関数を用いて学習された新しいDNA基盤モデルであり、アレルイベントの予測においてEvo 2のような既存のモデルを凌駕し、効果的に調節変異を優先させ、ヒトの各組織における遺伝子発現予測を大幅に向上させている。
36人の患者から得られた141,428個の単一細胞および核のプロファイルを用いた統合的な解析を通じて、研究者らは、コピー数多型に裏付けられた、早期肝細胞癌を慢性肝損傷から効果的に区別する堅牢な12遺伝子シグネチャーを開発し、独立したコホートにおいて高い診断精度と予後予測価値を達成した。
本研究は、脂肪細胞由来のTGFBIが、Notch/HES1/C/EBPαシグナル伝達軸を介してβ3アドレナリン受容体の発現を低下させることにより、肥満に関連する脂肪組織の褐色化を抑制することを明らかにしており、このプロセスは具体的にそのEMIドメインおよびRGDモチーフによって媒介される。
本論文は、最小限の二次元的な宿主・病原体ダイナミクスモデルにおいて、細菌の排除と慢性的な保菌および免疫病理を分かつ、構造的に堅牢な治療窓を定義する閉形式の食細胞動員閾値を確立するものである。
本研究は、魚類がカルマン歩行(Kármán gait)を特徴とする渦跡を利用してエネルギーを節約していることを明らかにしており、その歩行は、受動的な柔軟性と周波数の一致によって安定した引き込みを可能にする、位相ロックされた近共鳴的な体部運動によって特徴づけられ、能動的な調節は前部体部に集中している。
本研究は、主要な葉および根の機能形質と降水量のデータを統合することで、アーバスキュラー菌根菌に対する植物の応答性を予測することに成功した、ランダムフォレストに基づく機械学習フレームワークであるTrait2Mycoを紹介するものであり、資源獲得型の形質シンドロームと特定の環境条件が、菌根菌の成長応答の最も強力な駆動要因であることを明らかにしている。
本研究は、メソ置換ポルフィリン光増感剤における正電荷の空間配置、具体的には非対称なジカチオン構造における隣接した電荷の存在が、同様の親油性と一重項酸素収率にもかかわらず、より深い膜透過と酸化的損傷を促進することによって細菌の光不活性化を強化するための決定的な分子決定因子であり、対称なレジオアイソマーの有効性を凌駕することを示している。
本研究は、ブラジルの集中治療室における臨床分離されたアセトバクター・バウマニの比較ゲノミクスを利用し、多剤耐性および超多剤耐性表現型が、クローンの多様性、アクセサリー遺伝子の負荷、染色体変異、およびACB複合体内における分類学的複雑性の多因子的な組み合わせによって駆動されていることを明らかにしている。
本研究は、片側性の前庭機能喪失後におけるマウス内側前庭神経核のシングルセルデータを再解析することで、シーケンシング深度が発現変動解析の結果に著しいバイアスをもたらすことを示し、急性反応がIL-1受容体の活性化ではなく、ミクログリアのCd14/Tlr2プログラムによって駆動されていることを明らかにしている。
本研究は、代謝物の検出能と再現性を高めるために溶媒系および調製技術を体系的に評価することにより、セクレトーム・メタボロミクスにおける標準化され最適化されたプロトコルを確立し、それによって腫瘍微小環境における代謝的なクロストークの調和された解析を可能にするものである。