🧬 biology

Analysis of a Spatio-temporal Harvested Prey-Predator Model and a Machine Learning Framework for Prediction of Pattern Regimes with Demonstration on the Model

本論文は、解析的な安定性および分岐解析を通じて、ホリング・タイプII型機能反応を持つ収穫された被食者・捕食者モデルの時空間ダイナミクスを調査すると同時に、2パラメータ空間におけるパターン・レジームを予測し遷移図を構築するための、CNNとランダムフォレストを組み合わせたハイブリッド機械学習フレームワークの開発および検証を行うものである。

Ankur Paul, Amrit Bose, Uttam Ghosh2026-07-14
🧬 biology

Language-Grounded Drug Representations for Cold-Start Drug–Drug Interaction Prediction

本論文は、従来の構造のみに基づくモデルが失敗するコールドスタート・シナリオにおいて、未知の新しい薬物に対する薬物間相互作用を効果的に予測するために、薬物構造のグラフニューラルネットワーク表現と生物医学系言語モデルからの意味論的埋め込みを融合させたマルチモーダル・フレームワークを提案するものである。

Aaron Ajit2026-07-14
🧬 biology

Candidate Homologs of REST-Associated Chromatin Regulatory Components in Choanoflagellates

本研究は、動物のREST関連抑制に関与する主要なクロマチン調節成分の候補ホモログをチョアノフラゲラット(襟鞭毛虫)において特定しており、個々のタンパク質ファミリーは動物以前に存在していたものの、それらが機能的なREST様経路へと統合されていることは未確認のままであることを示唆している。

Ajay B. Vellanki2026-07-14
🧬 biology

Afadin Loss Uncovers an Ectopic Neurogenic Niche and Reorganizes the Adult Ventricular-Subventricular Zone

本研究は、接着結合タンパク質であるアファディンの発達段階における欠損が、新皮質における安定した異所性神経発生ニッチを誘導し、標準的な脳室下帯を破壊することによって成体脳を再編成することを実証しており、それにより、接着不全に応答する神経幹細胞の深遠な可塑性を明らかにしている。

Cristina Gil-Sanz, Isabel Mateos-White, Alba Marín-Garnes, Laura Veintimilla-Escot, Jaime Fabra-Beser, Laura Lázaro-Caro (…)2026-07-14
🧬 biology

Phytochemical Screening and Comparative Antimicrobial Activity of Phyllanthus niruri L. (Phyllanthaceae) against Staphylococcus aureus, Escherichia coli, and Candida albicans

本研究は、フェノール類、フラボノイド、およびタンニンを豊富に含むフィランサス・ニルリ(*Phyllanthus niruri* L.)の葉抽出物が、カンジダ・アルビカンス(*Candida albicans*)および黄色ブドウ球菌(*Staphylococcus aureus*)(最小発育阻止濃度[MIC]は12.5 mg/mL)に対して強力な用量依存的な抗真菌活性を示し、高濃度ではフルコナゾールを凌駕する一方で、大腸菌(*Escherichia coli*)に対しては効果を示さないことを実証することにより、モザンビークにおけるその民族薬学的利用を検証するものである。

Isidora Jorge, Gisela Guibunda, Jorge Amade, Porfirio Rosa, Jaime Diogo, Geraldo Hodela, Alfredo Dique, Lázaro Cuinica (…)2026-07-14
🧬 biology

Rethinking Model Selection in Choice Behavior

本論文は、研究報告の執筆時に統計数理研究所に所属し、現在では東京のRelations & Behavior Labで研究を行っている神谷直樹によって執筆された。本論文は、行動科学の分野において、選択行動のモデル選択の焦点を、単一の「正しい」定式化を特定することから、異なるモデルがいかにして個別の操作可能な環境構成要素を捉えているかを評価することへと転換することを主張し、予測と制御を向上させるために、これらの相補的な構造を統合するベイズモデル平均化やスタッキングのようなアンサンブル手法の使用を提唱するものである。

Naoki Kamiya2026-07-14
🧬 biology

Structure-Based Design of RNA Aptamers Targeting the Oncogenic KRAS G12D Variant

本研究は、RNA-106(そのSwitch IおよびIIドメインとの特異的な相互作用を通じて、発がん性変異型KRAS G12Dに選択的に結合し、これを阻害する安定したRNAアプタマー)を同定および特性評価するために、包括的なin silicoアプローチを採用しており、これはKRAS駆動型がんに対するRNAベースの治療薬開発のための有望な基礎を提供するものである。

Hammam T. Elghazzaly, Mohamed H. Abuseif, Abdelkader Ammar. KW, Hassan A. Sahloul, Majdeldin E. Abdelgilil2026-07-14
🧬 biology

Brain Activity Related to Cheating Identification: A Step Towards the Study of Corruption

本研究は、INDETRAEシナリオを用いたfMRIパラダイムを活用することで、異なる不正の状況がメンタライジング、実行制御、および報酬ネットワークにわたる異なる神経学的シグネチャーを引き起こすことを示し、それによって汚職の神経基盤を調査するための当該パラダイムの妥当性を検証した。

Víctor E. Olalde-Mathieu, Daniel Atilano-Barbosa, Giovanna L. Licea-Haquet, Jonatan García-Campos, Fernando A. Barrios (…)2026-07-14
🧬 biology

Chromosome-level reference genome assemblies of five Brassicaceae species inhabiting challenging ultramafic substrates

本研究は、PacBio HiFiおよびHi-C技術を利用して、超塩基性基質に適応したバルカン半島の5種のBrassicaceae(アブラナ科)における高品質な染色体レベルのゲノムアセンブリを提示するものであり、比較ゲノミクスおよび進化適応研究における基礎的なリソースを、この研究が進んでいない生物多様性のホットスポットに対して提供するものである。

Mahnaz Nezamivand-Chegini, Miloš Duchoslav, Raúl Wijfjes, Gabriela Šrámková, Jana Nosková, Vít Bureš, Tereza Koberová, T (…)2026-07-14
🧬 biology

Metastasis-associated DNA methylation alterations persist after accounting for immune and stromal cell heterogeneity in primary colorectal tumors

本研究は、免疫細胞および間質細胞の不均一性を考慮した後も持続する、原発性大腸腫瘍における転移進行に関連した明確なDNAメチル化の変化を特定しており、遺伝子サイレンシングおよび転移リスクの潜在的なバイオマーカーに関連する特定のエピジェネティックなシグネチャーを明らかにしている。

Alos B. Diallo, Sabin D. Hart, John P. Zavras, Scott M. Palisoul, Fred W. Kolling, Louis J. Vaickus, Jiaoyuan E. Sun, Lu (…)2026-07-14