🧬 biology

Unifying the statistical foundations of variant and methylation calling for enabling sequencing platform and calling scenario independence within Varlociraptor

本論文は、Varlociraptor内における、多様なシーケンシングプラットフォームにわたる遺伝的変異とメチル化率の検出を統合する一般化されたベイズ統計フレームワークを提示し、ゲノムおよびエピゲノムデータのより正確で、不確実性を考慮した、結合解析を可能にするものである。

Adrian Dominic Prinz, Johannes Köster2026-09-04
🧬 biology

Predictive Neurobiomarker of Memory Performance Based on Hippocampus– Amygdala Gamma Activity During Encoding

本研究は、符号化中の頭蓋内脳波から得られる海馬および扁桃体のミッドガンマ帯域のスペクトルパワーと結合性の特徴を組み合わせた予測的神経バイオマーカーが、その後の記憶パフォーマンスを正確に推定できること(R² = 0.8064)を示しており、リアルタイムの認知リハビリテーションシステムの潜在的な基礎を提供するものである。

Hyung-Tak Lee, Eun-Bi Cho, Soyeon Jun, June-Sic Kim, Chun-Kee Chung, Han-Jeong Hwang2026-09-04
🧬 biology

Vulnerability of terrestrial mammals hunted for human consumption

5,000種以上のIUCNデータに基づく系統発生モデルを用いた本研究は、体重と採餌層が陸生哺乳類の狩猟に対する脆弱性の主要な予測因子であることを特定し、現在狩猟対象となっていない450種以上の種がリスクにさらされていることを明らかにし、将来の保全モニタリングを導くための世界のホットスポットをマッピングしている。

Michela Pacifici, Andrea Cristiano, Giordano Mancini, Martina Fernando, Marco Davoli2026-09-04
🧬 biology

Position-resolved k-mer analysis of mature microRNAs reveal widespread CG and UA depletion across taxa

本研究は、271の生物種にわたる約49,000個の成熟マイクロRNA配列を解析することで、CGおよびUAジヌクレオチドの著しい枯渇とUGの濃縮を特徴とする、単純な突然変異バイアスを超えた構造的または進化的制約を示唆する、広範かつ系統に関連した位置的組織性を明らかにしている。

Chandhru Srinivasan, Mano Chitra Karthikeyan, Abirami Jayaprakash, Indhirakumar Murugesan, Vignesh Packiyaraj, Antony Jo (…)2026-09-04
🧬 biology

Effects of phytoplankton blooms on aquatic macroinvertebrate assemblages in a tropical karst lake

ラゴア・ミステリオサに関するこの研究は、植物プランクトンのブルーム(WAB)とその不在(AAB)が、特定の大型無脊椎動物の分類群および機能的摂食群と特定の水質パラメータとの関連性に大きな影響を与える一方で、全体のコミュニティ構造や生態学的指標を変化させるものではないことを明らかにしている。

Éverton Gustavo Miguel Neves, Anderson Ferreira2026-09-04
🧬 biology

Genome-wide identification of the PSK family and the association between SlPSK7 and auxin signaling in tomato

本研究は、トマトにおける8つのPSKファミリー遺伝子を特定し、SlPSK7が、オーキシン応答と並行する発現パターンおよびARF遺伝子への調節効果を示すことにより、果実形成期におけるオーキシンシグナル伝達の正の調節因子として機能することを実証している。

Shaoli Zhang, Lu Xie, Yuanyuan Song, Haidong Li, Guiyun Wang, Pengcheng Yi, Shude Yang, Luying Zhu, Kai Pan2026-09-04
🧬 biology

DPP3-mediated Destabilization of SLC3A2 Promotes Ferroptosis and Restores Chemosensitivity in Gastric Cancer

本研究は、DPP3が胃癌における化学療法感受性の重要な調節因子であり、SLC3A2を不安定化させることでシスチン取り込みとグルタチオン合成を阻害することにより、フェロトーシスを促進し治療効果を回復させることを特定した。

Lan Yu, Ting Wu, Xuan Feng, Zhu Xu, Hui Zhi, Xuanyao Yu, Ruiying Tong, Mao Jiang, Pengfei Zhang2026-09-04
🧬 biology

Astrocyte reactivity impairs lymphopoiesis through cholesterol-dependent mTOR suppression in common lymphoid progenitors

本研究は、アストロサイトの反応性が共通リンパ球前駆細胞におけるコレステロール蓄積を誘発することで、mTORシグナル伝達を抑制しB細胞の発達を阻害し、それによって骨髄のリンパ球造血を損なうことを明らかにしている。

Fang Ni, Rui Zhao, Xian Song, Yakun Liu, Jing Du, Tingting Liang, Zhi Yang, Lili Qian, Mingming Zhu, Jiani Zheng, Xinru (…)2026-09-04
🧬 biology

Energy Availability, Not Stress Tolerance, Determines Archaeal Persistence in Extraterrestrial Habitats

ストレス耐性が地球外環境における生存を決定づけるという一般的な仮定に反して、3,531の古細菌ゲノムの大規模なゲノム解析は、エネルギーの利用可能性、特にメタン生成による利用可能なエネルギー密度が、太陽系の諸生息域における古細菌の存続の主要な決定要因であることを明らかにしている。

Ajay Vellanki2026-09-04
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Thousands of pathogenic variants in ClinVar show signs of incomplete loss-of-function

本研究は、LOFTEE、pextスコア、NMD解析といった特定の指標が病原性変異と良性変異を区別するのに役立つ一方で、既知のClinVar病原性変異のうち数千件が不完全な機能喪失の兆候を示しており、そのような変異を除外するために自動化されたフィルタリングルールのみに依存することには重大な限界があることを実証している。

Tatyana E. Lazareva, Yury A. Barbitoff, Yulia A. Smirnova, Andrey S. Glotov2026-09-04