Amino acid auxotrophy is a feature of a distinct bacterial lifestyle across environments

広大で活気に満ちた都市を想像してみてください。そこには、目に見えない小さな住民である細菌たちが住んでいます。長い間、科学者たちは、細菌が自ら不可欠な構成要素（アミノ酸）を作るのをやめ、隣人からそれを盗み始めたとき、それは環境に対する賢明で即時的な反応であると考えてきました。それはまるで、地元の食料品店に在庫が豊富に揃っているのを見て、料理をやめることに決めた人のようなものだと考えられていました。この概念は「ブラック・クイーン仮説」として知られています。つまり、他の者がそれを提供してくれるため、生物は自分に必要のない機能を失うように進化するという考え方です。

しかし、この新しい論文は、その物語が「食料品の買い出し」というよりも、むしろ「家族の家宝」に近いものであることを示唆しています。

大きな発見：近所ではなく、家族の話である
研究者たちは、数千もの細菌ゲノムを調査し、アミノ酸を作る能力を失うことが、環境中で何が利用可能か（食料品店のようなもの）への反応なのか、あるいはもっと深い何かなのかを調べました。彼らは、祖先の影響と環境の影響を切り離すために、洗練された「家系図」分析を用いました。

結果は驚くべきものでした。あなたの家族の歴史は、現在の近所付き合いよりもずっと重要であるということでした。

研究の結果、細菌が自身のアミノ酸を作れるかどうかは、主にその進化の系統によって決定されることが分かりました。それは、細菌が周囲の状況を見て、「今日からこれを作るのをやめよう」と言ったわけではありません。むしろ、それはあなたの曾祖父や高祖父から特定の道具を受け継ぐようなものです。もしあなたの家系が数百万年前に特定のアミノ酸を作る能力を失っていたなら、現在の環境が豊かであろうと貧しかろうと、おそらく今でも作ることができないのです。

「全か無か」のライフスタイル転換
おそらく最も興味深い発見は、細菌はこれらの能力を、家具を一つずつ売っていく人のように、一つずつ失っていくのではないということです。代わりに、この論文は、アミノ酸を作る能力を失うことは、**パッケージ・ディール（セット販売）**として起こることを示しています。

それは、家のリフォームのようなものです。壁を一つだけ壊すのではなく、キッチン、バスルーム、リビングルームをすべて取り壊して、完全にオープンでミニマリストなスタジオを作る決断をするようなものです。研究によると、ある細菌があるアミノ酸を作る能力を失うとき、他のいくつかの能力も同時に失う可能性が非常に高いことが分かりました。これらの喪失は、大規模な「ゲノム・ストリームライニング（ゲノムの合理化）」プロジェクトの一環として、一斉に起こります。細菌は本質的に、ゼロから物を作るための重たい機械を脱ぎ捨て、より小さく、より効率的になるために、運営全体を縮小させているのです。

結論
この論文は、アミノ酸への依存は、細菌が特定の瞬間に適応するために用いる一時的で柔軟な戦略ではないと結論付けています。その代わりに、それは特定の細菌の家系図の枝を定義する、深く根ざした、永続的なライフスタイルの選択なのです。

要するに、細菌は単にパントリーにあるものに反応しているのではなく、先祖によって決定されたライフスタイル、つまり、料理をするのをやめて、合理化され簡素化された存在に頼るという生活を全うしているのです。この発見は、彼らが常に「ブラック・クイーン（環境）」に適応しているという考えに異議を唱え、彼らが代わりに、より無駄のない生活を送るための厳格で受け継がれた設計図に従っていることを示唆しています。