Disentangling Loss Design and Ontology-Aware Architecture in GNN-Based Protein Function Prediction A Controlled Ablation Study
이 통제된 어블레이션 연구는 GNN 기반 단백질 기능 예측에서 제안된 정보 축적 인지 손실 함수(Information Accretion-aware loss function)가 역효과를 내는 반면, 최적의 성능은 GCN 아키텍처를 교차 온톨로지 어텐션 및 표준 이진 교차 엔트로피 손실과 결합함으로써 달성된다는 것을 밝혀냈다.