380 papers
Deze studie toont aan dat actinefilamenten van twee evolutionair verre gistsoorten, in tegenstelling tot hun zoogdier-tegenhangers, een versnelde ouderdom en snellere ontbinding vertonen die grotendeels wordt veroorzaakt door het ontbreken van methylering op histidine 73, wat wijst op een grotere biochemische diversiteit dan eerder werd erkend.
In deze studie wordt de structuur en interactie van de M. tuberculosis Mam1A-1D-eiwitten gekarakteriseerd, waarbij wordt aangetoond dat Mam1A een stabiele tetrameer vormt en dat Mam1A-1D samen met LucA stabiele complexen vormt die essentieel zijn voor de organisatie en stabilisatie van de Mce-complexen.
Deze studie onthult de eerste structurele basis van het Mycobacterium tuberculosis-eiwit MfpD, waarbij wordt aangetoond dat het een stabiele dimerische Roadblock/LC7-achtige structuur aanneemt die waarschijnlijk de GTP-hydrolyse van MfpB via een niet-kanoniek mechanisme bevordert, wat nieuwe inzichten biedt in de pathogenese van tuberculose.
MetaReact is een geavanceerd, op Transformers gebaseerd model dat end-to-end drugsmetabolieten, enzymen en metabole locaties voorspelt door middel van een chemische reactie-gebaseerde pretraining, waardoor het bestaande methoden overtreft en waardevolle inzichten biedt voor de vroege geneesmiddelenontwikkeling.
In deze studie wordt met behulp van de PRISMA-techniek de interactie-oppervlakte van het vaak gemuteerde SWI/SNF-subunit ARID1A in hoge resolutie in kaart gebracht, waardoor nieuwe interacties met eiwitten zoals SIN3A, TOX4, CDK2 en CCNA2 worden ontdekt en een nieuwe reguleringsmechanisme van ARID1A wordt blootgelegd.
Dit onderzoek onthult dat het A2-domein van collageen VII via een uniek hydrofoob herkenningsmechanisme tijdelijk bindt aan fibrillair collageen, wat essentieel is voor de vorming van verankeringfibrillen en inzicht biedt in de moleculaire oorzaak van huidfragiliteit.
Deze studie introduceert MT-DS, een nieuwe fluorescente sensor die het direct in beeld brengen van microtubuli-schade mogelijk maakt en onthult dat kinesin-1 actief nieuwe beschadigingen in het rooster veroorzaakt tijdens beweging.
Deze studie onthult dat pulmonale arteriële hypertensie leidt tot een specifieke metabole en inflammatoire leveraandoening, gekenmerkt door Warburg-achtige metabolisme in hepatocyten en endotheelcellen, verhoogde activatie van HIF-1 in leversterncellen en een unieke signatuur van PI3K-Akt-signalering die verschilt van andere leverziekten.
Dit onderzoek toont aan dat het activeren van de CBL E3-ubiquitine ligase, bijvoorbeeld via een geengineerde mutante of kleine moleculen die de SLAP2-bindingsinterface nabootsen, leidt tot versterkte afbraak van tyrosinekinases zoals EGFR en een vermindering van downstream signaaltransductie, wat een veelbelovende strategie biedt voor het downreguleren van tyrosinekinase-signaleren.
Dit onderzoek toont aan dat een subset van RfaH-homologen constitutief actief is en een monomorf {beta}-vat-structuur aanneemt, wat het evolutionaire model van stapsgewijze specialisatie van RfaH vanuit NusG ondersteunt.
Deze studie introduceert de Metabolite2Function (M2F)-pipeline om de metabolomen van zes plantencallus-culturen te analyseren en te rangschikken op basis van hun bioactieve functies, zoals antioxidantia en anti-verouderingseffecten, voor toepassing in gezondheid en cosmetica.
Dit artikel introduceert Peptergent, een nieuw type amphifiele peptide dat detergentvrije extractie en zuivering van membraaneiwitten mogelijk maakt, waardoor deze direct geschikt worden voor structurele analyse en massaspectrometrie.
Deze studie onthult het stereochemische mechanisme van B12-afhankelijke radical SAM-glutamine-methyltransferase (QCMT) en toont aan dat dit enzym een veelzijdige biocatalysator is die niet alleen stereoselectieve C-methylatie, maar ook ongebruikelijke post-translationele modificaties zoals peptid-epimerisatie en de omzetting van glycine naar D-alanine kan katalyseren via een niet-geconcerterd mechanisme.
Dit artikel introduceert FLEX, een compacte, op fibroblast-groeifactor 1 gebaseerde fusiepartner die door structurele optimalisatie de expressie, oplosbaarheid en zuiverheid van moeilijk te produceren eiwitten in zowel bacteriële als zoogdiersystemen aanzienlijk verbetert via een efficiënte heparine-gebaseerde zuiveringsstap.
Dit artikel beschrijft een geoptimaliseerde methode voor de kwantificering van diverse fytohormonen in planten, inclusief verbeterde extractie- en HPLC-scheidingsprotocollen, en vergelijkt de voordelen en beperkingen van MRM- en HRMS-detectietechnieken.
Dit onderzoek introduceert de DNA-gecodeerde vloeibare glykaanarray (LiGA) als een efficiënt hulpmiddel om de glykaanbindingsprofielen van diverse darmbacteriën te kwantificeren, waarbij ook cross-chirale herkenning van spiegelbeeldglycanen door bacteriën zoals *E. coli* en *L. reuteri* wordt aangetoond, wat nieuwe inzichten biedt in de ecologie van het darmmicrobioom.
In dit artikel wordt HERCULES voorgesteld, een geïntegreerd deep-learning framework dat enkel op sequentie gebaseerde voorspellingen combineert om zowel RNA-bindende domeinen op residueel niveau te lokaliseren als de impact van mutaties op RNA-bindingsvermogen nauwkeurig te kwantificeren.
Deze studie toont aan dat bifunctionele moleculen die p300/CBP binden, afhankelijk van de cellulaire context kunnen schakelen tussen ultra-potente transactivatie en repressie, wat aantoont dat geïnduceerde proximaliteit niet noodzakelijk leidt tot een vast functieresultaat.
Deze studie toont aan dat de UFMylering van het pyruvaatdehydrogenase-complex, specifiek via het subunit DLAT, de mitochondriale stofwisseling reguleert door de pyruvaatoxidatie te activeren, een proces dat normaal wordt gebalanceerd door de de-UFMylase UFSP2.
Deze studie toont aan dat extracten van zaden van zeven Koreaanse bosbomen diverse en complementaire bioactiviteiten vertonen, waaronder antioxidant, ontstekingsremmende, verhelderende en anticarcinogene werking, waardoor ze veelbelovende, duurzame multifunctionele natuurlijke bronnen zijn voor verdere ontwikkeling.