285 papers
Biochemie vormt de brug tussen de biologie en de chemie, waarbij we kijken naar de moleculaire processen die leven mogelijk maken. Op deze pagina verkennen we de nieuwste inzichten in hoe cellen functioneren, hoe enzymen werken en welke chemische reacties ons DNA sturen. Het is een fascinerend veld dat vaak complexe concepten omvat, maar die we hier proberen toegankelijk te maken voor iedereen.
Elk nieuw preprint dat op bioRxiv verschijnt binnen dit onderwerp, wordt direct verwerkt door Gist.Science. Wij bieden voor elk artikel zowel een duidelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische analyse, zodat u snel de kern begrijpt zonder vast te lopen in vakjargon. Hieronder vindt u de meest recente publicaties in biochemie, direct vanuit de bron.
Deze studie toont aan dat co-sedimentatie met het adapterproteïne NUB1L een hoogwaardige MAS NMR-structurele analyse mogelijk maakt van het wild-type, intrinsiek ongeordende FAT10 N-domein, en onthult dat dit een vage complex vormt dat identiek is aan zijn gestabiliseerde variant, terwijl de N-terminus wordt gepositioneerd voor proteasomale degradatie.
Met behulp van de novo-ontwerp van eiwitten creëerden onderzoekers een integrine-onafhankelijke Tie2-agonist die bevestigt dat integrine-interactie niet vereist is voor receptoractivatie maar essentieel is voor het verlengen van de signaalduur, terwijl tegelijkertijd een krachtige therapeutische werkzaamheid wordt aangetoond in een muismodel van acuut respiratoir distresssyndroom.
De auteurs ontwikkelden HYlight2, een verbeterde genetisch gecodeerde sensor voor fructose-1,6-bisfosfaat die aanzienlijk verhoogde gevoeligheid biedt en in vivo beeldvorming van glycolytische flux in diverse weefsels en organismen mogelijk maakt, waaronder neuronen, pancreatische eilandjes en de lever.
De G23S-mutatie in β-glucosidase B van *Paenibacillus polymyxa*, voorspeld via Foldit-modellering en de Design to Data-database, verhoogt de katalytische efficiëntie en de maximale reactiesnelheid met respectievelijk ongeveer twee- en veertienvoud, met slechts een minimaal verlies aan thermische stabiliteit.
Deze studie identificeert nieuwe taxaan-deacetylasen (T13dA1, T13dA2 en T79dA) die het biosynthetische pad van paclitaxel opnieuw afbakenen als een complex netwerk, waardoor de succesvolle reconstructie van een hoge opbrengst aan baccatine III-productie in *Nicotiana benthamiana* mogelijk wordt via geïntegreerde 18- en 19-genenpaden.
Deze studie toont aan dat de fosfatase PPM1B gebruikmaakt van een trinucleair metaalcentrum, waarbij een derde metaalion (M3) het substraat direct coördineert en de vertrekkende groep stabiliseert om hydrolyse te drijven, wat een convergente chemische strategie met PPP-fosfatases vertegenwoordigt die een onderscheidende katalytische architectuur hanteert.
Deze studie toont aan dat door AI ontworpen synthetische eiwitminibinders (C6-DPC) signaalbarrières kunnen overwinnen om efficiënte, functionele menselijke myogene reprogramming mogelijk te maken door gelijktijdig pro-myogene FGFR-paden te activeren en anti-myogene ALK1/TGFBR2- en inflammatoire gp130-signalen te onderdrukken, waardoor hoogkrachtige spierweefsels uit fibroblasten worden gegenereerd.
In deze studie is een nieuw chemisch geïnduceerd dimerisatiesysteem ontwikkeld, bestaande uit een *de novo* ontworpen macrocyclisch peptide en een bijbehorend eiwit-homodimeer, waarmee cellulaire processen zoals genexpressie en luciferase-reconstitutie nauwkeurig kunnen worden gecontroleerd.
Deze studie karakteriseert het MprF-homoloog LpiA uit *Agrobacterium fabrum* door middel van cryo-EM-analyse, waarbij een dimere structuur wordt aangetoond en de rol van specifieke zwavel-aromatische motieven bij substraatbinding wordt gesuggereerd.
De studie toont aan dat de duur van de toxiciteit van IAPP voor bètacellen lineair samenhangt met de lengte van de lag-fase van amyloïdvorming, wat bevestigt dat tijdelijke pre-fibrillaire intermediairen en niet de rijpe fibrillen de celstoornis veroorzaken.