388 papers
Dit onderzoek gebruikt lang-read genomische analyse en structurele modellering om de complexe herhalingsstructuur van RTX-adhesines in zeven bacteriesoorten te ontrafelen, waardoor 35 unieke adhesines werden geïdentificeerd die potentiële doelwitten vormen voor nieuwe anti-infectie strategieën.
Deze studie optimaliseert de expressie en zuivering van het STEAP1-eiwit door stabiele expressie te gebruiken om de homogene vorming van zijn functionele homotrimeer en de correcte opname van cofactoren te waarborgen, wat essentieel is voor therapeutische toepassingen bij prostaatkanker.
Dit onderzoek toont aan dat het vernieuwingsproces van myeline in de hersenen sterk varieert afhankelijk van het lipide-type en vertraagt met de leeftijd, waarbij de vervanging van cholesterol en sfingolipiden afneemt en afhankelijk is van ApoE-gemedieerd transport.
Deze studie onthult dat het *alx*-riboswitch in *E. coli* de expressie van mangaanexporters reguleert door een allosterisch mechanisme waarbij alkalische pH de RNA-conformatie verandert, waardoor de gevoeligheid voor mangaanionen (Mn²⁺) toeneemt en de bacterie in staat stelt om zowel metaal- als pH-signalen te integreren tijdens alkalische stress.
Dit onderzoek toont aan dat organosulfverbindingen zoals DMS en DMSO via niet-enzymatische, door geochemische factoren aangedreven oxidatiemechanismen kunnen worden geassimileerd om microbiële groei te ondersteunen, wat suggereert dat metabole paden niet per se enzymatisch hoeven te zijn.
Dit onderzoek toont aan dat door microben en het gastheer gevormde glycine-conjugaten van indool-3-carboxylaten, zoals IAA-glycine, functioneren als endogene liganden voor de Ah-receptor in de mens, waardoor een onvoorziene biologische link wordt gelegd tussen planten, microben en de menselijke fysiologie.
Dit onderzoek toont met behulp van massaspectrometrie-afbeelding aan dat ouderdom de genezing van botbreuken vertraagt doordat de weefselomzetting van kraakbeen naar bot in oudere muizen uitblijft, wat resulteert in een accumulatie van kraakbeencollageen en een tekort aan botcollageen in het genezingsweefsel.
Dit onderzoek onthult dat hoge-affiniteit binding aan amyloïdefibrillen via twee topologisch verschillende mechanismen verloopt, wat leidt tot nieuwe ontwerpprincipes voor het ontwikkelen van verbeterde liganden en diagnostische middelen voor neurodegeneratieve ziekten.
Deze studie toont aan dat de interactie tussen de darmmicrobiota en de gastheer de stofwisseling van verschillende vetzuren beïnvloedt, wat leidt tot unieke veranderingen in het lipidenprofiel en ontstekingsmediatoren die een cruciale rol spelen bij cardiometabole ziekten.
Dit onderzoek ontrafelt het werkingsmechanisme van een parasitair TGFβ-antagonist en leidt tot de ontwikkeling van programmeerbare, celtype-specifieke modulatoren van TGFβ-signaleren door middel van rationeel ontworpen chimere eiwitten en nanobody-fusies.
De studie toont aan dat structurele modificaties aan oxazolidinon-antibiotica, zoals tedizolid en delpazolid, hun stallingvoorkeur voor specifieke aminozuren in het nascent peptide kunnen veranderen en zo de trajecten door het ribosoom beïnvloeden.
Uit biochemische en computationele analyses blijkt dat het vogelcryptochroom ErCRY4a geen antenne-chromoforen (8-HDF of MTHF) bindt en waarschijnlijk uitsluitend afhankelijk is van FAD als lichtgevoelige cofactor, wat wijst op een functionele specialisatie die verschilt van de meeste fotolyasen.
Het paper introduceert AlphaFast, een framework dat de langzame CPU-gebonden MSA-generatie van AlphaFold 3 vervangt door GPU-versnelde MMseqs2-zoekopdrachten, waardoor de doorvoer met een factor 68,5 toeneemt en de voorspellingen in slechts 8 seconden met behoud van structurele nauwkeurigheid kunnen worden uitgevoerd.
Door proline-residuen in te voegen om de vorming van bèta-vlakken in het prion-achtige domein van het FUS-eiwit te voorkomen, kan de pathologische aggregatie en neurotoxiciteit worden onderdrukt zonder de fysiologische faseafscheiding of functie te verstoren.
In dit onderzoek wordt met behulp van licht-gestuurde signalering aangetoond hoe positieve feedback tussen Ras en PI3Kγ lokale versterking en golfvorming van membraansignalisatie mogelijk maakt, ondanks de aanwezigheid van globale remmers, waarbij diffusie en feedback-architectuur cruciale rollen spelen.
Deze studie presenteert de eerste cryo-elektronenmicroscopie-structuur van het menselijke TRPM1-kanaal in de geleidende toestand, waarbij een onverwachte kloksgewijs omgekeerde domein-gewisselde poreuze architectuur wordt onthuld die de constitutieve gating en retinale functie verklaart.
Dit onderzoek beschrijft het structureel inzicht en de rational engineering van een cytochroom P450-enzym uit *Rhodococcus* om de O-demethylatie van lignine-afgeleide guaiacolen en syringolen te verbeteren, waardoor een efficiëntere biocatalytische valorisatie van houtlignine mogelijk wordt.
Deze studie introduceert de GATO-seq-techniek en cryo-EM-beelden om een nieuw, door DNA-sequentie gecodeerd 'super-pauze'-mechanisme te onthullen dat RNA-polymerase II in een stabiele, teruggetrokken toestand vastzet die niet door TFIIIS kan worden opgeheven.
Deze studie ontrafelt de moleculaire code die de specifieke subunit-ordening in ringvormige GID/CTLH-type E3-ligases regelt en toont aan dat deze code zowel begrijpelijk als hanteerbaar is voor het ontwerpen van nieuwe interacties.
In deze studie ontwikkelen de onderzoekers chemiluminescente sondes die het enzym ClbP selectief detecteren, waardoor colibactine-producerende bacteriën sneller en gevoeliger kunnen worden geïdentificeerd in complexe stoelgangstalen dan met eerdere methoden.