238 papers
Biochemie vormt de brug tussen de biologie en de chemie, waarbij we kijken naar de moleculaire processen die leven mogelijk maken. Op deze pagina verkennen we de nieuwste inzichten in hoe cellen functioneren, hoe enzymen werken en welke chemische reacties ons DNA sturen. Het is een fascinerend veld dat vaak complexe concepten omvat, maar die we hier proberen toegankelijk te maken voor iedereen.
Elk nieuw preprint dat op bioRxiv verschijnt binnen dit onderwerp, wordt direct verwerkt door Gist.Science. Wij bieden voor elk artikel zowel een duidelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische analyse, zodat u snel de kern begrijpt zonder vast te lopen in vakjargon. Hieronder vindt u de meest recente publicaties in biochemie, direct vanuit de bron.
Dit onderzoek onthult de structurele basis voor het transport van metalloïden door de arseniet-effluxpomp ArsB via cryo-EM, waarbij wordt aangetoond dat het een proton-gekoppelde secundaire transporter is die metalloïden via waterstofbruggen bindt in een naar binnen gerichte conformatie.
Deze studie onthult dat het PML-1-eiwit een unieke nucleïnezuurbindende module, PXL, bevat die specifiek G-rijke enkelstrengige RNA- en DNA-motieven herkent en zo de transcriptoomregulatie beïnvloedt.
De auteurs presenteren OptiPrime, een interpreteerbaar machine learning-model dat de efficiëntie van prime editing voorspelt en optimaliseert voor diverse therapeutische toepassingen, waaronder de in vivo correctie van een pathogene mutatie in een muismodel voor KIF1A-geassocieerde neurologische aandoeningen.
Dit onderzoek gebruikt lang-read genomische analyse en structurele modellering om de complexe herhalingsstructuur van RTX-adhesines in zeven bacteriesoorten te ontrafelen, waardoor 35 unieke adhesines werden geïdentificeerd die potentiële doelwitten vormen voor nieuwe anti-infectie strategieën.
Deze studie introduceert de GATO-seq-techniek en cryo-EM-beelden om een nieuw, door DNA-sequentie gecodeerd 'super-pauze'-mechanisme te onthullen dat RNA-polymerase II in een stabiele, teruggetrokken toestand vastzet die niet door TFIIIS kan worden opgeheven.
In deze studie ontwikkelen de onderzoekers chemiluminescente sondes die het enzym ClbP selectief detecteren, waardoor colibactine-producerende bacteriën sneller en gevoeliger kunnen worden geïdentificeerd in complexe stoelgangstalen dan met eerdere methoden.
De auteurs presenteren Enzyme-toolkit, een geïntegreerde pipeline die bestaande en nieuwe methoden combineert om onbekende enzymen te ontdekken voor specifieke reacties, zoals de afbraak van milieuverontreinigende stoffen.
Dit onderzoek onthult dat condensine II in de mitose via een bipartiet mechanisme wordt geactiveerd, waarbij het eiwit M18BP1 zowel de auto-inhibitie opheft als direct bijdraagt aan de DNA-organisatie om stabiele chromosoomlussen te vormen.
Dit onderzoek onthult dat het ciliaire eiwit INPP5E, dat geassocieerd is met het Joubert-syndroom, via tyrosine- en serine-fosforylering interageert met endocytische en signaalregulerende eiwitten om groeifactorsignalering via PDGF en TGF{beta} op een cilium-afhankelijke manier te moduleren.
In deze studie wordt een computergestuurde strategie gepresenteerd waarbij nieuw ontworpen eiwitbinders het autoregulerende interface tussen de helicase-kern en het dsRBD2-domein van DHX9 blokkeren, waardoor de helicase-activiteit specifiek wordt geïnhibeerd als een potentiële kankertherapie.