376 papers
Deze studie toont aan dat verschillende virale en cellulaire IRES-sequenties effectief de translatie van synthetische circRNA's aansturen in zowel menselijke cellen als verbeterde cellulaire extracten, wat cruciale inzichten biedt voor de ontwikkeling van circRNA-gebaseerde medicijnen.
Dit onderzoek breidt het inzicht uit in de activeringsmechanismen van NR4A-RXR-heterodimeren door aan te tonen dat een functioneel diverse set RXR-liganden noodzakelijk is om zowel klassieke farmacologische activering als het niet-klassieke mechanisme van heterodimere dissociatie te identificeren, wat cruciaal is voor het begrijpen van hun rol bij neurodegeneratieve en inflammatoire ziekten.
Dit onderzoek onthult de kristalstructuren van het periplasmatische domein van ToxS en toont aan dat galzouten de vorming van een ToxS-homodimeer induceren, waardoor een structureel model voor de galzout-gemedieerde regulatie van het ToxRS-virulentiesysteem in Vibrio-bacteriën wordt geboden.
De studie toont aan dat mutaties in de {beta}5-{beta}6-lus van OXA-48-varianten de waterstofbruggen in het actieve centrum veranderen, wat leidt tot verschillen in de hydrolyse-efficiëntie van imipenem door beïnvloeding van de deacyleringsdynamiek en bindingsaffiniteit.
Hoewel metabole enzymen evolutionair sterk geconserveerd zijn, tonen hun katalytische efficiënties geen universeel trendpatroon gebaseerd op organismische complexiteit, maar vertonen enzymspecifieke variaties die worden bepaald door contextuele selectiedrukken zoals metabole vraag en regulatie.
Dit onderzoek presenteert hoog-resolutie cryo-EM-structuren van fotosysteem I in een *Synechocystis*-mutant met alternatieve quinonen, waarbij onverwacht een asymmetrisch vermogen tot binding en uitwisseling van plastoquinon-9 in de A1A- en A1B-bindingsplaatsen wordt ontdekt, wat nieuwe inzichten biedt in cofactor-selectiviteit en de rol van metabole plasticiteit.
Deze studie presenteert de structuur van het tetramere TvPPi-PFK-enzym uit Trichomonas vaginalis, wat niet alleen de bevestiging biedt van de PPi-afhankelijke activiteit als potentieel medicijnkandidaat, maar ook onverwachte ATP- en suikerfosfaatbindingsplaatsen onthult die wijzen op een mogelijke ATP-afhankelijke functie.
In dit artikel wordt ThermoTargetMiner voorgesteld, een database die de proteoomwijde doelwitlandschappen van longkankertherapieën in kaart brengt met behulp van de PISA-assay, waardoor nieuwe doelwitten voor 77% van de geteste moleculen zijn geïdentificeerd en de werkingsmechanismen van geneesmiddelen zoals PEITC zijn verduidelijkt.
Dit onderzoek toont aan dat niet-fibrillaire oligomeren en transient assembly-intermediairen van het prion-eiwit (PrP) structurele informatie kunnen opslaan en doorgeven, waardoor ze fungeren als onafhankelijke templates die de conceptuele kaders van prion-assembly uitbreiden voorbij de klassieke fibril-eindverlenging.
Deze studie onthult dat de biomineralisatie van koralen wordt aangestuurd door een geconserveerde toolkit van eiwitten en transportmechanismen die onafhankelijk is van hun leefomgeving of symbiotische status, waarbij het koraal *Desmophyllum pertusum* als nieuw model dient om de weerbaarheid van dit proces tegen oceaanverandering te bestuderen.
Dit onderzoek toont aan dat plantaardige zachte elektrofielen, zoals bepaalde flavonen, de productie van ontstekingsoplossende oxylipinen in een paraquat-geïnduceerd Parkinson-model van *Drosophila* stimuleren via het *relish*-pad, waardoor neuro-inflammatie wordt opgelost en potentiële therapeutische kansen voor neurodegeneratieve ziektes worden geboden.
Dit onderzoek toont aan dat de RhoG G12E-mutant, ondanks dat hij zich in een GTP-gebonden toestand ophoopt, de nucleotidencyclus verstoort wat leidt tot verminderde RhoG-signaleringsoutput en celmigratie, in plaats van hyperactivatie.
Dit onderzoek onthult via cryo-EM-structuren dat het HSP90-CDC37-chaperonensysteem RAF1-kinase niet alleen stabiliseert, maar actief reguleert via een uniek asymmetrisch vouwmechanisme dat pre-dimerisatie mogelijk maakt en zo de MEK-signalering en celproliferatie beïnvloedt.
Dit onderzoek biedt een geoptimaliseerd LC-MS-werkproces voor de betrouwbare detectie en kwantificering van retinoïden in cerebrospinaal vocht, waarbij specifieke aandacht wordt besteed aan chromatografische scheiding, ionisatieparameters en extractieprocedures om lage concentraties en structurele isomerie aan te pakken.
Deze studie toont aan dat pathogene varianten in menselijke mitochondriale tRNA-genen, met name nabij het acceptorstamgebied, de verwerking van RNA verstoren door de verwijdering van de 5'-leider te belemmeren, wat leidt tot een gebrekkige vrijgave van downstream tRNA's en mitochondriale ziekten.
Deze studie onthult de moleculaire interacties binnen het ISG15-USP18-STAT2 remcomplex door middel van AlphaFold-modellering en biochemische analyses, waarbij een cruciale STAT2-bindingslus in USP18 wordt geïdentificeerd en de impact van patiëntmutaties en virale eiwitten op deze interactie wordt onderzocht.
Dit onderzoek toont aan dat de reactiesnelheid in biomoleculaire condensaten niet alleen wordt bepaald door lokale concentratie-effecten, maar ook door chemische microomgevingsfactoren zoals hydrofiliciteit en wateractiviteit, wat nieuwe inzichten biedt voor het ontwerpen van condensaten met afstelbare reactiviteit.
In deze studie wordt met behulp van tijdsopgeloste seriële synchrotronkristallografie (TR-SSX) in real-time inzicht verkregen in hoe ligandbinding de conformationele populaties en de herschikking van de F-helix van T4-lysozyme L99A beïnvloedt, waardoor een direct verband wordt gelegd tussen diffusie, bezettingsgraad en structurele aanpassing.
Moleculaire dynamica-simulaties tonen aan dat volledige oxidatie van virale membraanlipiden de verankering van het SARS-CoV-2-spike-eiwit significant verzwakt door de lipide-structuur te verstoren, hoewel deze oxidatie alleen waarschijnlijk niet voldoende is voor spontane detachering en eerder als synergistisch mechanisme werkt met mechanische krachten.
Dit onderzoek ontrafelt de kinetische logica van uridylatie-gemedieerde RNA-afbraak in *Drosophila melanogaster*, waarbij wordt aangetoond dat Tailor via product-afhankelijke kinetische afstemming discrete oligo(U)-intermediairen genereert die door Dis3l2 worden herkend als een kwalificatie voor efficiënte degradatie.