282 papers
Biochemie vormt de brug tussen de biologie en de chemie, waarbij we kijken naar de moleculaire processen die leven mogelijk maken. Op deze pagina verkennen we de nieuwste inzichten in hoe cellen functioneren, hoe enzymen werken en welke chemische reacties ons DNA sturen. Het is een fascinerend veld dat vaak complexe concepten omvat, maar die we hier proberen toegankelijk te maken voor iedereen.
Elk nieuw preprint dat op bioRxiv verschijnt binnen dit onderwerp, wordt direct verwerkt door Gist.Science. Wij bieden voor elk artikel zowel een duidelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische analyse, zodat u snel de kern begrijpt zonder vast te lopen in vakjargon. Hieronder vindt u de meest recente publicaties in biochemie, direct vanuit de bron.
De ReCap-workflow, die de Oxi-Stop cryopreservatiestrategie combineert met de Oxi-DIA-kwantificatiemethode, maakt diepe, op kopieaantal geschaalde cysteïne-redoxproteomics mogelijk die exogene oxidatie minimaliseert en onthult dat redoxsignalen kwantitatief geconcentreerd zijn op abundante eiwitten in plaats van uniform verdeeld te zijn.
Deze studie toont aan dat huidige machine learning-modellen en grote datasets er niet in slagen de thermische eigenschappen van extremofiele enzymen nauwkeurig te voorspellen vanwege biases en fouten in de trainingsdata, waardoor een definitieve beoordeling van de prevalentie van grote temperatuurverschillen in psychrofielen wordt verhinderd.
Deze studie onthult dat de rekrutering van mRNA naar het ribosoom een vertakt kinetisch pad volgt waarbij een reversibele arrestatie-toestand fungeert als een controlepunt, waardoor factoren zoals eIF4F en eIF3 mRNA's selectief kunnen sturen naar productieve initiatie op basis van hun structurele complexiteit.
Deze studie presenteert een geoptimaliseerde workflow voor hemoglobine-depletie in gedroogde bloedvlek-microsamples die de identificatie van eiwitten en de ontdekking van biomarkers aanzienlijk verbetert, met name voor het monitoren van chronische nierziekte, terwijl het ook de superieure prestaties van commerciële celvrije apparaten aantoont bij het vastleggen van plasma-achtige profielen.
Deze studie toont aan dat ioniserende straling dosis- en modelafhankelijke verstoringen in de cardiale mitochondriale bio-energetica en nucleotide-homeostase induceert, waarbij wordt onthuld dat hoewel 10 Gy acute metabole stress veroorzaakt, 25 Gy een paradoxale adaptieve respons triggert die ten grondslag kan liggen aan de onmiddellijke therapeutische effecten van cardiale stereotactische lichaamstherapie.
Deze studie toont aan dat het coaten van DNA-origami-nanodeeltjes met PEG5K-K10 de opname en structurele stabiliteit in Y-79-retinoblastoomcellen aanzienlijk verbetert zonder de vitreale mobiliteit aan te tasten, terwijl de toevoeging van PL3-targeterende peptiden geen verder voordeel bood.
Het NanoBridge-systeem is een modulair platform dat biologische binders gebruikt om kleine eiwit-tags te rekruteren naar uitdagende, vaak ongeordende endogene eiwitten, wat precieze, reversibele en gemultiplexed posttranslationele modificatie-editing in levende cellen mogelijk maakt zonder de noodzaak van exogene PTM-writers.
Deze studie toont aan dat het substitueren van heem B door structureel conservatieve, niet-natuurlijke metalloporfyrinen in de novo ontworpen tetrahelpische eiwitten zorgt voor hoogwaardige bindingsaffiniteit en een brede, voorspelbare afstemming van redoxpotentialen met meer dan 400 mV zonder de eiwitstructuur aan te tasten, waarmee een veelzijdige platform wordt gevestigd voor technisch vervaardigde bio-energetische en bio-elektronische toepassingen.
Deze studie onthult dat de KN-domein van KANK-eiwitten bestaat uit scheidbare modules, waarbij residuen 30–60 de talinebinding bemiddelen en residuen 60–68 een geconserveerde intramoleculaire interactie aandrijven, wat een modulaire architectuur vestigt die een autoinhibitoir regulatiemechanisme ondersteunt.
Deze studie stelt een geoptimaliseerde massaspectrometrie-workflow vast voor de kwantitatieve profilering van door JMJD6 gekatalyseerde lysine-hydroxylering, waarbij wordt onthuld dat deze modificatie een residu-afhankelijke zuurstofgevoeligheid en heterogeniteit in hypoxie-responsieve kinetiek vertoont over bromodomein-eiwitten heen.