338 papers
Biochemie vormt de brug tussen de biologie en de chemie, waarbij we kijken naar de moleculaire processen die leven mogelijk maken. Op deze pagina verkennen we de nieuwste inzichten in hoe cellen functioneren, hoe enzymen werken en welke chemische reacties ons DNA sturen. Het is een fascinerend veld dat vaak complexe concepten omvat, maar die we hier proberen toegankelijk te maken voor iedereen.
Elk nieuw preprint dat op bioRxiv verschijnt binnen dit onderwerp, wordt direct verwerkt door Gist.Science. Wij bieden voor elk artikel zowel een duidelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische analyse, zodat u snel de kern begrijpt zonder vast te lopen in vakjargon. Hieronder vindt u de meest recente publicaties in biochemie, direct vanuit de bron.
Deze studie maakt gebruik van genetische code-expansie om een fotovercrosslinkbare onnatuurlijke aminozuur in het gist 26S-proteasoom te introduceren, wat de in vivo vangst en massaspectrometrische identificatie van diverse, ATP-afhankelijke eiwitsubstraten mogelijk maakt en onthult hoe hun landschap verschuift onder endoplasmatisch reticulumstress.
Dit artikel presenteert een nieuw protocol dat de uitdagingen bij het isoleren van zeldzame neuronale lipiddruppels overwint door triglyceridelipase te blokkeren om ze te vergroten voor zuivering via een sucrosegradiënt, wat gedetailleerde lipidische profilering mogelijk maakt om het begrip van hun rol bij neurodegeneratieve aandoeningen te bevorderen.
Deze studie rapporteert de succesvolle isolatie en in vitro reconstitutie van het cobalamine-afhankelijke radical SAM-enzym BchE, wat de eerste gedetailleerde karakterisering van zijn katalytische mechanisme in de anaerobe biosynthese van bacteriochlorofyl mogelijk maakt.
UniFlow is een schaalbaar normalizing flow-framework dat de generatie van eiwitconformatie-ensembles en machine-learned coarse-grained krachtvelden verenigt, wat zowel snelle bemonstering van evenwichtsdistributies als stabiele moleculaire dynamica-simulaties op lange tijdschalen binnen één differentieerbaar model mogelijk maakt.
Deze studie maakt gebruik van activiteitsgebaseerde proteïneprofilering met fluorofosfonaatprobes om een uitgebreide chemoproteomische kaart van het *Trypanosoma cruzi*-seroom te genereren, waarbij 37 actieve serinehydrolasen worden geïdentificeerd die betrokken zijn bij het lipidenmetabolisme en gastheer-pathogeeninteracties om toekomstige antiparasitaire medicijnontwikkeling te faciliteren.
Deze studie onthult dat het afneembare staartspiek-eiwit TspA van de genoverdrachtagenten van *Rhodobacter capsulatus* functioneert als een krachtig biofilm-afbrekend enzym dat horizontale genoverdracht faciliteert door navigatie door complexe microbiële extracellulaire matrices mogelijk te maken.
Deze studie onthult dat de beperkte genoombewerkingsactiviteit van TnpB voortkomt uit inefficiënte DNA-ontwinding naar een stabiele open toestand, en demonstreert dat een geoptimaliseerde variant (Ymu1-WFR) zowel in vitro klieving als genoombewerking in planten verbetert door specifieke ontwindingsintermediairen te stabiliseren.
Deze studie toont aan dat de moleculaire lijm-degrader EM12-FS cereblon (CRBN) covalent herstructureert bij His353 om een nieuwe, niet-canonieke interface te creëren die de selectieve rekrutering en degradatie van het neosubstraat NTAQ1 mogelijk maakt, waardoor de reikwijdte van induced-proximity farmacologie wordt uitgebreid door middel van site-specifieke synthetische modificatie.
Deze studie onthult de structurele basis voor het vermogen van rifamycine B om rifampicine-resistent RNA-polymerase te remmen, waarbij wordt aangetoond dat de unieke C-4 O-carboxymethylgroep een stabiliserende zoutbrug vormt met het enzym die veelvoorkomende resistentiemutaties omzeilt, waardoor een nieuw doelwit voor rationeel antibioticadesign wordt geïdentificeerd.
Dit artikel maakt gebruik van het murburn-raamwerk en kwantitatieve modellering om aan te tonen dat gehydrateerde extracellulaire polymere fasen, variërend van biofilms tot geboorte, functioneren als evolutionair geconserveerde, fasegescheiden matrices die stochastische diffuse reactieve soorten reguleren om zuurstofbenutting mogelijk te maken terwijl biologische coherentie wordt behouden en complexe levensprocessen worden gefaciliteerd.