376 papers
Dit onderzoek onthult via cryo-elektronmicroscopie en functionele assays dat het TAM-complex in gram-negatieve bacteriën fosfolipiden, met name cardiolipine, naar de buitenste membraan transporteert via een stabiele hybride-barrelstructuur en een lipofiel kanaal, wat suggereert dat TamB een evolutionair prototype is voor eukaryotische lipiettransfer-eiwitten.
Dit onderzoek onthult de moleculaire structuur en het werkingsmechanisme van RAD54B, waarbij wordt aangetoond dat dit eiwit via een modulair architectuur met een unieke beta-domein en N-terminale domeinen RAD51-filamenten stabiliseert en de homologe recombinatie bevordert om DNA-dubbelstrengsbreuken te repareren.
Dit onderzoek introduceert een nieuw raamwerk om de biosynthetische verbindingen tussen sideroforen en primaire metabolisme te traceren, wat leidt tot een strategie voor het onderdrukken van plantpathogenen door specifieke metabolieten toe te voegen om de siderofoorproductie van heilzame bacteriën te versterken.
Deze studie presenteert een nieuwe methode voor multimodaal epigenetisch profileren waarbij ingenieurs DNA-methyltransferasen zijn omgezet in koolzuurmethyltransferasen om 5-carboxymethylcytosine in GpC-contexten te introduceren, wat een betrouwbare en compatibele labeltechniek biedt voor het in kaart brengen van eiwit-DNA-occupancy zonder interferentie met natuurlijke DNA-modificaties.
Deze studie identificeert de Atlas-virussen, een nieuwe familie van endogene virussen in nematoden, en beschrijft hun cryo-EM-structuren en eigenschappen die hen tot veelbelovende kandidaten maken voor de aflevering van RNA-therapieën.
Deze studie toont aan dat de parasitaire kinase FIKK1 VAR2CSA fosforyleert, wat de hechting van met malaria geïnfecteerde erytrocyten aan de placenta versterkt en FIKK1 daarmee een veelbelovend doelwit maakt voor medicijnen tegen placenta-malaria.
Dit onderzoek introduceert een nieuwe methode om cel-specifieke isotooplabeling toe te passen in het intacte brein, waardoor wordt aangetoond dat neuronen myo-inositol via de SLC5A3-transporter doorgeven aan oligodendrocyten om hun proliferatie en differentiatie te bevorderen, wat essentieel is voor myelineherstel en een potentiële therapeutische doelstelling voor neurodegeneratieve ziekten biedt.
Door middel van T-REMD-simulaties toont dit onderzoek aan dat N-terminale chirale modificaties en sequentiemutaties in amyloïde-beta 42 de conformationele landschappen en thermodynamische stabiliteit beïnvloeden, waarbij specifieke variaties zoals A2TC{beta} pathogene effecten hebben die correleren met afwijkingen van het wild-type ensemble.
Dit onderzoek combineert experimentele bindingstests met moleculaire dynamica-simulaties om aan te tonen dat de ligand UCB-1A bij 37°C een stabiele binding behoudt aan het SV2C-isoform dankzij een unieke waterstofbrug, terwijl de binding aan SV2A significant afneemt door temperatuurafhankelijke destabilisatie.
De studie introduceert de reproduceerbare Enriched-GF-methode, die door een combinatie van glasparelagitatie, invriezen-thawen en calciumactivatie een aanzienlijk hogere en consistente opbrengst van regeneratieve groeifactoren uit autoloog bloed levert dan bestaande methoden.
De auteurs hebben een rationeel ontworpen peptide-remmer ontwikkeld die de interactie tussen PTP1B en het 14-3-3ζ-complex verstoort, waardoor de oxidatie en inactivatie van PTP1B wordt voorkomen, de enzymatische activiteit wordt hersteld en de groei van EGFR-gedreven kankercellen wordt onderdrukt.
Dit artikel beschrijft hoe twee menselijke eiwitverontreinigingen (hPCC en PRMT5:MEP50), geïsoleerd tijdens de affiniteitszuivering van getagde eiwitten uit HEK293-cellen, werden geïdentificeerd via cryo-EM en massaspectrometrie, waarmee het belang van de specificiteit van het zuiveringshars wordt benadrukt.
Dit onderzoek toont aan dat mutaties in het sterk geconserveerde isoleucine 563 van de Thermococcus sp. AM4 CODH2 de zuurstoftolerantie aanzienlijk verhogen door de diffusie van gassen via het hydrofobe kanaal te beïnvloeden, maar ook aangeeft dat een verbeterde zuurstofresistentie onvermijdelijk ten koste gaat van de CO-diffusie.
In deze studie werd de CB2-receptor gebruikt als model om de effectiviteit van library-docking te onderzoeken, waarbij het targeten van polaire orthostere residuen leidde tot subtype-selectieve liganden, een grotere bibliotheek (2,6 miljard moleculen) betere hits opleverde dan een kleinere, en cryo-EM-structuren de dockingvoorspellingen bevestigden, resulterend in acht nieuwe, potente ligandfamilies.
Deze studie toont aan dat het H/ACA snoRNP snR37 een bifunctionele rol speelt in de ribosoomassemblage door zowel pseudouridylering van de peptidyltransferasecentrum-uridine te katalyseren als, via een uniek eiwitcomplex, als structureel steiger te fungeren voor de organisatie van vroege pre-60S-intermediairen.
Deze studie onthult dat het enzym aspartaattranscarbamoylase uit E. coli niet simpelweg tussen twee statische vormen schakelt, maar via een dynamisch 'ademhalings'-mechanisme van een continuüm van conformaties zijn coöperativiteit reguleert, waarbij CTP en UTP het enzym comprimeren om de activiteit te remmen, terwijl ATP en GTP het uitbreiden om de activiteit te stimuleren.
Chronische alcoholblootstelling verhoogt de activiteit van CYP3A-enzymen niet door verhoogde eiwitniveaus, maar door een functionele interactie met CYP2E1, wat fysiek werd bevestigd en gekarakteriseerd via crosslinking-massaspectrometrie.
Dit onderzoek onthult hoe Tau-condensaten in de loop van de tijd inhomogeen verouderen tot een kern-schelp-structuur met amyloïde zaden, terwijl hun poreuze binnenkant toegankelijk blijft voor moleculaire interventie.
Dit artikel introduceert Decomap-seq, een hoogpresterend ruimtelijk transcriptomica-platform dat door middel van een innovatieve drievoudige segment-fabricatiestrategie de gevoeligheid en betrouwbaarheid van transcriptopname aanzienlijk verbetert ten opzichte van traditionele methoden.
Dit artikel toont aan dat de activiteit en abundantie van CK1δ op een celcyclusafhankelijke manier worden gecoördineerd, waarbij de eiwitafbraak, auto-inhibitie en fosfatase-activiteit samenwerken om de kinase te stabiliseren of te degraderen afhankelijk van de specifieke celcyclusfase.