⚛️ Category

biophysics

418 papers

Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.

Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.

Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.

⚛️ biophysics

Cryo-EM structure and biochemical characterization of a BRAF/CRAF heterodimer: Negative charge in the NtA motif is not required for RAF activation

Deze studie presenteert de cryo-EM-structuur en biochemische karakterisering van een BRAF/CRAF-heterodimeer, waaruit blijkt dat hoewel de algehele organisatie lijkt op die van RAF-homodimeren, de negatieve lading in het N-terminale zure (NtA)-motief niet essentieel is voor activatie, wat suggereert dat de rol ervan ligt in het moduleren van lokale ruggegraatsdynamiek en conformationele stabiliteit in plaats van specifieke interfaciële herkenning.

Ha, B. H., Tkacik, E., Gazgalis, D., Kang, H., Jang, D. M., Chakraborty, S., Jeon, H., Eck, M. J.2026-05-14
⚛️ biophysics

Using iPALM to determine protein organisation in cardiac muscle Z-discs

Deze studie maakte gebruik van iPALM en PERPL-analyse om de hoogprecieze driedimensionale organisatie van ZASP, α-Actinine-2 en het Z1Z2-epitoom van titine binnen de Z-schijven van hartspiercellen in kaart te brengen, waarbij bleek dat terwijl ZASP en α-Actinine-2 een vergelijkbaar herhalend patroon vertonen, het Z1Z2-epitoom een onderscheidende structurele rangschikking toont.

Umney, O., Curd, A. P., Martin, H., Lewis, T., Tang, A. A.-S., Balusubramanian, H., Khuon, S., Aaron, J., Peckham, M.2026-05-12
⚛️ biophysics

Yoda molecules agonize PIEZO2

Deze studie toont aan dat Yoda-moleculen, die eerder werden geacht selectief PIEZO1 te activeren, ook effectief PIEZO2 agoniëren door de open-kans te verhogen en de inactivatie te vertragen, waarbij de verhoogde potentie van Yoda2 wordt toegeschreven aan een specifieke zoutbruginteractie, wat aldus een herbeoordeling vereist van hun gebruik bij het onderscheiden van de functies van PIEZO-kanalen.

Wijerathne, T. D., Chandrasekharan, A., Bhatt, A., Luo, Y. L., Lacroix, J. J.2026-05-12
⚛️ biophysics

Triplet tumbling microscopy enables in situ quantification of protein complex assembly and dynamics

De auteurs ontwikkelden triplet tumbling microscopy (TTM), een veelzijdige beeldvormingstechniek die gebruikmaakt van infrarood-triggerbare triplettoestanden om rotatie-diffusie in levende cellen te meten, waardoor de kwantificatie van assemblage, grootte en dynamiek van proteïnecomplexen in real-time en in situ mogelijk wordt zonder dat voorafgaande kennis van de interagerende partners vereist is.

Lazzari-Dean, J. R., Millett-Sikking, A., Rao, P., Jensvold, Z. D., Baddock, H., Ingaramo, M., Nile, A. H., York, A. G. (…)2026-05-11
⚛️ biophysics

Dpb11 facilitates the colocalization of Mec1-Ddc2 with its activators on gapped DNA

Met behulp van single-molecule imaging en krachtspectroscopie onthult deze studie dat de checkpoint-mediator Dpb11 de colocalisatie van het Mec1-Ddc2-kinasecomplex met zijn activatoren op gegapte DNA faciliteert door Mec1-Ddc2 direct naar ss-dsDNA-overgangen te rekruteren en ssDNA te overbruggen om de effectieve gap-lengte te verminderen.

Beckwitt, E. C., Chua, G. N. L., Liu, S., O'Donnell, M. E.2026-05-10
⚛️ biophysics

Quantum kernel support vector machines for trabecular bone classification: comparing feature reduction strategies on synthetic micro-CT data

Deze studie toont aan dat, hoewel de meeste strategieën voor dimensiereductie leiden tot een onderprestatie van quantum-kernel SVM's ten opzichte van klassieke baselines bij de classificatie van trabeculair bot, UMAP de enige methode is die het mogelijk maakt dat quantum-kernels concurrerend blijven, alhoewel het waargenomen voordeel statistisch niet significant is en waarschijnlijk wordt opgeblazen door afhankelijkheid van de vouw, samen met bevindingen dat ZZ quantum-kernels geen gladde metrische structuren voor regressietaken kunnen vastleggen.

Florez, I., Farhat, A., Le Houx, J., Altamura, E., Tozzi, G.2026-05-07
⚛️ biophysics

Deep Learning-Enhanced TopoStats for the Automated Quantification of DNA and Complex Biomolecular Structures

Dit artikel introduceert Deep Learning-Enhanced TopoStats, een open-source Python-pakket dat de kwantitatieve analyse van Atomic Force Microscopy (AFM)-gegevens voor DNA en complexe biomoleculen automatiseert, waardoor AFM wordt getransformeerd van een kwalitatief visualisatietool naar een robuust, hoogdoorvoervermogen analytisch kader dat in staat is subtiele structurele verschillen te onderscheiden.

Whittle, S., Firth, T. A., Gamill, M. C., Wiggins, L., Shephard, N., Allwood, T., Catley, T. E., Pyne, A. L. B.2026-05-07
⚛️ biophysics

Mechanics-Driven Emergence of Mesenchymal Migration Features

Dit artikel introduceert een minimaal, tweedimensionaal computationeel model dat aantoont dat mesenchymale celmigratie, gekenmerkt door aanhoudende willekeurige wandelingen en diverse morfologieën, uitsluitend kan ontstaan uit het mechanische samenspel van intracellulaire trekkrachten en dynamische adhesiecycli zonder dat er een opgelegde polarisatie of directionele bias nodig is.

Louviaux, N., Cheddadi, I., Verdier, C., Stephanou, A., Chauviere, A.2026-05-04