419 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
Deze studie toont aan dat toonaangevende eiwitstructuurvoorspellingsmodellen, ondanks hun succes, fundamentele fysieke principes van atomaire interacties niet volledig hebben geleerd, wat leidt tot systematische fouten die een fysiek onderbouwde evaluatie vereisen voor de ontwikkeling van nauwkeurigere modellen voor biomoleculaire functievoorspelling.
Deze studie toont aan dat zowel ATP als Mg2+ essentieel zijn voor de hoge affiniteit van indolmycine voor menselijke mitochondriale tryptofanyl-tRNA-synthetase, waarbij een kristalstructuur en thermodynamische analyses aantonen dat dit enzym een mechanisme deelt met bacteriële varianten dat sterk afwijkt van dat van het menselijke cytoplasmatische enzym.
Dit onderzoek toont aan dat caldesmon op moleculair niveau niet alleen de krachtproductie van gladde spieren remt door de binding van myosine aan actine te belemmeren, maar ook de ontspanning versnelt, waardoor het een cruciale regulatorische rol speelt in plaats van slechts een structurele functie.
Deze paper introduceert CGRig, een efficiënt model dat eiwitten als starre lichamen met residu-niveau interactiepunten simuleert, waardoor langdurige en grootschalige studies van eiwitassemblage mogelijk worden zonder essentiële structurele informatie te verliezen.
Deze studie identificeert SNOR, een nieuw ribosoom-geassocieerd factor in Schizosaccharomyces pombe dat tijdens glucose-gebrek de eiwitsynthese remt en essentieel is voor het herstarten van de translatie bij het verlaten van de rusttoestand.
De auteurs hebben een investigator-blind analyse-pipeline ontwikkeld die op onbevooroordeelde wijze nieuwe structurele motieven identificeert die de functie van GPCR's reguleren, naast reeds bekende microschakelaars.
De studie toont aan dat mutatie-robuustheid, een maat voor de stabiliteit van eiwitten bij aminozuursubstituties, een krachtige voorspeller is van eiwitdynamica die zowel op natuurlijke als op *de novo* ontworpen eiwitten werkt en aanvullende informatie biedt boven bestaande structurele betrouwbaarheidsscores zoals AlphaFold2's pLDDT.
Dit onderzoek toont aan dat de afname van chromatinbeweging tijdens de celcyclus in menselijke cellen wordt veroorzaakt door de verdubbeling van het DNA-gehalte en niet door cohesine-gemedieerde zusterchromatiden, zoals onthuld door Hi-D-tracking en polymeermodelling.
Deze studie combineert een nieuwe analytische theorie met experimentele data van meer dan 62.000 antilichaamvarianten om de haalbaarheid van het ontwerpen van kwantitatief programmeerbare fitnesslandschappen voor eiwitevolutie te bevestigen.
Dit paper presenteert OpenFPM, een open-source Fourier ptychografische microscopie-platform dat goedkope 3D-geprinte componenten en een Raspberry Pi gebruikt om hoge-resolutie amplitude- en fasebeelden te genereren over een groot gezichtsveld.