609 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
Deze studie toont aan dat het NS3-proteasedomein van het geelvkoortsvirus met hoge specificiteit en affiniteit bindt aan G-kwadruplexen, wat nieuwe mogelijkheden biedt voor antivirale strategieën.
Dit onderzoek toont aan dat entanglement-maatstaven, afgeleid van knopentheorie, een biologisch relevante en evolutionair behouden dimensie vormen die de relatie tussen sequentie, structuur en functie van intrinsiek ongeordende eiwitten effectiever onthullen dan traditionele beschrijvers.
Deze paper introduceert RESURF, een lichtgewicht deep-learning framework dat real-time super-resolutie beeldvorming van levende cellen mogelijk maakt door het vereiste aantal frames te reduceren tot slechts acht en de inferentietijd onder de 30 ms te houden.
Dit onderzoek toont aan dat een hoge kromming van celmembranen de oxidatie van lipiden versnelt door een betere toegang voor reactieve zuurstofsoorten, waarbij de samenstelling van het membraan (zoals cholesterolgehalte en onverzadigde lipiden) deze krommingseffecten op een complexe manier kan versterken of onderdrukken.
De studie toont aan dat mutatie-robuustheid, een maat voor de stabiliteit van eiwitten bij aminozuursubstituties, een krachtige voorspeller is van eiwitdynamica die zowel op natuurlijke als op *de novo* ontworpen eiwitten werkt en aanvullende informatie biedt boven bestaande structurele betrouwbaarheidsscores zoals AlphaFold2's pLDDT.
Dit onderzoek toont aan dat lipiden een integraal onderdeel vormen van de structuur en functie van de KdpFABC-kaliumpomp uit E. coli, waarbij cryo-EM-studies in lipide-nanodiscs onthullen hoe specifieke lipiden de conformatieveranderingen en het transport van kalium mogelijk maken.
Dit onderzoek onthult dat brede verdelingen van glijtijden een universeel kenmerk zijn van efficiënte doeltrekkingsprocessen op DNA, waarbij intermitterende detachering niet alleen de gemiddelde zoektijd verkort maar ook de fluctuaties reguleert via een universele ongelijkheid die voortkomt uit de stochastische dynamiek van het zoekproces.
Dit onderzoek toont aan dat allosterische bindingsplaatsen in proteïnekinasen zich bevinden in neutraal gefrustreerde energielandschappen die contextafhankelijke regulatie mogelijk maken, wat leidt tot een systematisch 'blind' voor voorspellende modellen, terwijl orthosterische plaatsen in geoptimaliseerde, minimaal gefrustreerde regio's liggen die betrouwbaar worden gedetecteerd.
Deze studie introduceert amyAMP, een generatief deep-learning framework dat, in combinatie met moleculaire dynamica-simulaties, effectief ontwerpprincipes voor amyloïde-achtige antimicrobiële peptiden onthult door de gedeelde fysisch-chemische determinanten van antimicrobiële activiteit en amyloïde zelfassemblage te benutten.
Deze paper introduceert het SR-EV-model, een minimalistisch raamwerk dat aantoont dat chromatinestructuren zoals TADs statistische verrijkingen zijn binnen een heterogeen ensemble van 3D-configuraties in plaats van deterministische structuren, waardoor een brug wordt geslagen tussen experimentele contactkaarten en de werkelijke organisatie in individuele cellen.