365 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
Dit onderzoek onthult met cryo-elektronenmicroscopie dat de kracht-gereguleerde overgang tussen twee bindingsstaten de catch-bond-mechanisme van het eiwit α-actinine-4 mogelijk maakt, terwijl de ziekteverwekkende K255E-mutatie deze dynamiek verstoort door het eiwit vast te houden in een sterke bindingsstaat.
Dit onderzoek toont aan dat fosforylering de oligomere staat van Grb2 schakelt van een auto-inhiberende dimer naar een monomeer, waardoor een enthalpie-gedreven faseovergang ontstaat die stabiele condensaten vormt die fungeren als multivalente scaffolds om niet-condenserende wildtype-dimeren te werven en zo de ruimtelijke organisatie van de Ras/MAPK-signaalweg reguleren.
Dit paper introduceert de 'Kinetic Intron Hypothesis', een nieuw model dat de overvloedige lengte van introns in eukaryote genomen verklaart door hun potentiële rol in mitose en NTP-resourcebeheer via synthese- en afbraakdynamiek.
Dit artikel introduceert DNAsight, een modulair en automatisch framework dat machine learning combineert met kwantitatieve analyse om AFM-beelden van chromatinestructuur om te zetten in reproduceerbare biologische inzichten over DNA-organisatie en eiwitinteracties.
Dit artikel onthult via cryo-EM de moleculaire structuur van het Gβγ-prefusie SNARE-complex en onthult hoe Gβγ de vesikelversmelting remt door te binden aan het C-terminale deel van SNAP-25, waardoor de volledige vorming van het SNARE-helical bundle wordt geblokkeerd.
Dit onderzoek onthult met cryo-EM en moleculaire dynamica hoe de chemokine CCL19 en CCL21 via verschillende bindingsposities en intracellulaire dynamiek, met name de flexibiliteit van helix 8, de selectieve rekrutering van β-arrestine versus G-eiwitten bij de CCR7-receptor bepalen, wat een structurele basis biedt voor het ontwerp van pathway-selectieve immunomodulatoren.
Dit artikel biedt een gedetailleerd stappenplan voor het bouwen en karakteriseren van een enkel-objectief oblique plane microscoop (OPM) met commercieel verkrijgbare onderdelen, waarmee onderzoekers snelle, hoogresolutie 3D-fluorescentiebeeldvorming kunnen realiseren zonder de complexe uitlijningseisen van traditionele lichtsheet-microscopie.
Dit onderzoek combineert microsecondenlange moleculaire dynamica-simulaties met vrije-energieperturbatieberekeningen om te demonstreren dat Mg2+-coördinatie en substraatbinding gezamenlijk de inwaarts-gekeerde conformatie van de ABC-transporteur PCAT1 stabiliseren en de nucleotideherkenning via specifieke residuen zoals Lys525 in de Walker A-motief reguleren.
In dit onderzoek worden all-atom moleculaire dynamica-simulaties en free-energy perturbation gebruikt om de absolute bindingsvrijheidsenergie van cAMP aan de CNBD-van HCN-isoformen 1-4 te bepalen, waardoor inzicht wordt verkregen in de verschillen in kanaalsensitiviteit en activatiemechanismen.
Deze studie toont aan dat zelfs minimale sequentieveranderingen in intrinsiek ongeordende mitochondriale lokalisatiepeptiden de lokale structurele voorkeuren en het dynamische conformationele ensemble beïnvloeden, wat suggereert dat dergelijke variaties de targeting-efficiëntie kunnen moduleren.