419 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
Deze paper introduceert MorphCurveVAE, een tweestapsframework dat variatie-encoderende auto-encoders en geprojecteerde hoofdcurven combineert om continue, biologisch plausibele morfologische trajectoïden te reconstrueren uit statische 3D-microscopiebeeldjes.
Deze studie presenteert een computergestut kader dat, door het simuleren van longresectie op 1D-modellen van de longvasculatuur, aantoont dat veranderingen in de golfdichtheid na de operatie voornamelijk het gevolg zijn van veranderingen in de morfometrie van de longslagader, met resultaten die goed overeenkomen met klinische data.
Dit onderzoek toont aan dat intrinsiek ongeordende gebieden (IDRs) in het transcriptiefactor ComK cruciaal zijn voor het versterken van microseconde fluctuaties in DNA op grote afstand, waardoor allostery en transcriptie-activatie mogelijk worden, terwijl het verwijderen van deze gebieden de DNA-structuur verstijft en de functie vernietigt.
Dit onderzoek toont aan dat transcriptiefactoren in levende menselijke cellen specifieke genen selecteren via een energieafhankelijk kinetisch bewijsvoeringsmechanisme waarbij promotor-activiteit wordt bepaald door de verblijftijd van de factor in plaats van alleen de bezettingsgraad.
Dit onderzoek gebruikt grootschalige moleculaire dynamica-simulaties om kwantitatief in kaart te brengen hoe sulfatatiepatronen en de aanwezigheid van L-iduronzuur de secundaire structuur van glycosaminoglycanen bepalen, en introduceert een nieuwe tweeparameter-metriek voor de objectieve classificatie van deze structuren.
Deze studie toont met behulp van single-molecule-fluorescentiemicroscopie aan dat de vorming van een stabiel rrnTAC-complex door de werving van SuhB noodzakelijk is om transcriptiepauses te verminderen en de co-transcriptionele verwerking van bacteriële rRNA te optimaliseren.
Dit artikel introduceert een efficiënte workflow die Mean-Shift Super-Resolution (MSSR) toepast op intensiteitsdata om ruimtelijke maskers te genereren, waardoor de door het puntverspreidingsfunctie (PSF) veroorzaakte menging van tijdsverloopsignalen in FLIM-effectief wordt onderdrukt zonder de nauwkeurigheid van de levensduurmetingen te beïnvloeden.
Deze studie presenteert cryo-EM-structuren van het *E. coli* AcrAB-TolC-effluxsysteem, waarbij de onbekende lipoproteïne YbjP wordt geïdentificeerd als een essentieel structureel component dat TolC verankert en de conformatieveranderingen tijdens het antibioticumtransport faciliteert.
Deze studie introduceert een voorspellend mechanochemisch model dat, geverifieerd met experimenten aan U2OS-cellen, aantoont hoe de nanotopografie van het substraat en het laminegehalte de vervorming van de nucleaire lamina, nucleocytoplasmatisch transport en de lokalisatie van YAP/TAZ beïnvloeden.
Met behulp van high-speed atomaire krachtmicroscopie visualiseren de auteurs hoe het G2L4-reverse transcriptase in real-time dubbelstrengs DNA-breuken repareert via microhomologie-gemedieerd end-joining door microhomologie te stabiliseren en gaten op te vullen, terwijl T4 DNA-ligase het herstel voltooit en vertakkingen onderdrukt.