365 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
Dit onderzoek toont met behulp van tijdopgeloste single-molecule FRET en microfluidica aan dat poly(ADP-ribose) (PAR) decompactering van nucleosomen induceert via een lengteafhankelijke kinetische drempel, waarbij alleen langere PAR-ketens efficiënte chromatinetoegang mogelijk maken door elektrostatische interacties.
In dit artikel wordt een model op basis van dynamische grafgrammatica's gepresenteerd dat de morfodynamiek van synaptische doornen simuleert door de interactie tussen het actine-cytoskelet en het membraan te beschrijven, waarmee de invloed van actine-bindende eiwitten op de vorm van de doornen wordt ontrafeld.
Deze studie introduceert een volledig geautomatiseerde, zelfconsistent iteratieve methode voor het nauwkeurig bepalen van de rotatie van individuele cellen, waardoor de betrouwbaarheid en schaalbaarheid van holotomografische flowcytometrie aanzienlijk worden verbeterd.
Deze paper introduceert een uitgebreid theoretisch kader voor de dynamische simulatie van NMR-spectra in bicellen en nanodiscs, dat lipidediffusie, oriëntatieverdeling en membraanverdikking integreert om de kwantitatieve interpretatie van anisotrope interacties en membraanveranderingen bij biomoleculaire interacties mogelijk te maken.
Dit artikel introduceert MiCSPARC, een gebruiksvriendelijke CryoSPARC-gebaseerde verwerkingspijplijn die geautomatiseerde deeltjesselectie en snelle 3D-verfijning combineert om robuuste, hoge-resolutie structuren van zowel gedecoreerde als ongedecoreerde microtubuli te genereren.
Deze paper introduceert AI-BioMech, een deep learning-framework dat de mechanische respons van biologische cellulaire materialen direct voorspelt uit 2D-beelden met een nauwkeurigheid tot 99%, waardoor handmatige geometrische definities en traditionele eindige-elementen-simulaties overbodig worden.
Dit onderzoek toont aan dat gastruloiden zich zelfstandig organiseren en een as vormen door collectieve lotbeslissingen en celherschikkingen die worden aangedreven door een mechanochemisch mechanisme, zonder externe signaalcues.
Dit artikel beschrijft hoe DNA-origami met herhalende dockingstrengen wordt gebruikt om drift te corrigeren en de precisie van MINFLUX-beeldvorming over langdurige opnames tot ongeveer 2 nm te waarborgen, wat vervolgens wordt toegepast op het afbeelden van cardiale eiwitten in weefsel.
De auteurs hebben cryoJAX ontwikkeld, een flexibele bibliotheek voor het simuleren van cryo-elektronenmicroscopie-beelden in JAX, die de ontwikkeling en implementatie van rekenkrachtige data-analysemethoden voor cryo-EM mogelijk maakt.
Deze studie introduceert en valideert MARTINI 3 grofkorrelige modellen van het mycobacteriële buitenmembraan, die aantonen dat de herschikking, diffusie en aggregatie van PDIM-lipiden sterk worden beïnvloed door membraanvloeibaarheid en lipidesamenstelling.