609 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
Dit onderzoek gebruikt grootschalige moleculaire dynamica-simulaties om kwantitatief in kaart te brengen hoe sulfatatiepatronen en de aanwezigheid van L-iduronzuur de secundaire structuur van glycosaminoglycanen bepalen, en introduceert een nieuwe tweeparameter-metriek voor de objectieve classificatie van deze structuren.
Deze studie toont met behulp van single-molecule-fluorescentiemicroscopie aan dat de vorming van een stabiel rrnTAC-complex door de werving van SuhB noodzakelijk is om transcriptiepauses te verminderen en de co-transcriptionele verwerking van bacteriële rRNA te optimaliseren.
Dit artikel introduceert een efficiënte workflow die Mean-Shift Super-Resolution (MSSR) toepast op intensiteitsdata om ruimtelijke maskers te genereren, waardoor de door het puntverspreidingsfunctie (PSF) veroorzaakte menging van tijdsverloopsignalen in FLIM-effectief wordt onderdrukt zonder de nauwkeurigheid van de levensduurmetingen te beïnvloeden.
Deze studie onthult dat de productieve binding van PETase aan PET-oppervlakken wordt beperkt door 'over-ankeren' in encounter-toestanden, en biedt een mechanistisch kader om door flexibiliteit-gestuurde ontwerpstrategieën de enzymatische efficiëntie te verbeteren.
Deze studie presenteert cryo-EM-structuren van het *E. coli* AcrAB-TolC-effluxsysteem, waarbij de onbekende lipoproteïne YbjP wordt geïdentificeerd als een essentieel structureel component dat TolC verankert en de conformatieveranderingen tijdens het antibioticumtransport faciliteert.
Deze studie introduceert een voorspellend mechanochemisch model dat, geverifieerd met experimenten aan U2OS-cellen, aantoont hoe de nanotopografie van het substraat en het laminegehalte de vervorming van de nucleaire lamina, nucleocytoplasmatisch transport en de lokalisatie van YAP/TAZ beïnvloeden.
Dit onderzoek toont aan dat intramoleculaire interacties tussen de geordende en ongeordende gebieden van ubiquilinen hun gesloten conformatie en functionele diversiteit over verschillende eukaryote lijnen bepalen.
Dit onderzoek gebruikt all-atoom moleculaire dynamica-simulaties en vrije-energieberekeningen om de interacties van virale insuline/IGF-achtige peptiden met zebravishoreceptoren te analyseren, waarbij zowel overeenkomsten met menselijke bindingen als unieke, niet-geconserveerde interacties en potentiële mutaties voor verhoogde bindingsaffiniteit worden geïdentificeerd.
Dit onderzoek toont aan dat reflectine-eiwitten in inktvissen door fosforylatie-achtige ladingveranderingen multicompartmentele vloeistof-vloeistof fasegescheiden condensaten vormen, waarbij hun specifieke ruimtelijke organisatie de mechanische basis vormt voor de dynamische kleuraanpassing in de Bragg-lamellen van de huid.
Dit onderzoek toont aan dat moleculaire dynamica-simulaties van de bindingsenergielandschappen tussen antilichamen en het JAM-A-receptor kunnen worden gebruikt om de membraaninternalisatie van therapeutische antilichamen te voorspellen, waarbij specifieke contacttopologieën en elektrostatische interacties cruciaal blijken voor succesvolle endocytose in plaats van alleen hoge bindingsaffiniteit.