613 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
In dit onderzoek worden geëngineerde varianten van de OAA-lectin geïdentificeerd en gekarakteriseerd die door middel van mutaties en valentie-modulatie een hoge specificiteit en affiniteit voor Man5GlcNAc2 vertonen, waardoor ze dienen als verbeterde hulpmiddelen voor het profileren van hoog-mannose-glycanen en als aanpasbare antivirale middelen.
Dit artikel biedt een gedetailleerd stappenplan voor het bouwen en karakteriseren van een enkel-objectief oblique plane microscoop (OPM) met commercieel verkrijgbare onderdelen, waarmee onderzoekers snelle, hoogresolutie 3D-fluorescentiebeeldvorming kunnen realiseren zonder de complexe uitlijningseisen van traditionele lichtsheet-microscopie.
Dit onderzoek combineert microsecondenlange moleculaire dynamica-simulaties met vrije-energieperturbatieberekeningen om te demonstreren dat Mg2+-coördinatie en substraatbinding gezamenlijk de inwaarts-gekeerde conformatie van de ABC-transporteur PCAT1 stabiliseren en de nucleotideherkenning via specifieke residuen zoals Lys525 in de Walker A-motief reguleren.
In dit onderzoek worden all-atom moleculaire dynamica-simulaties en free-energy perturbation gebruikt om de absolute bindingsvrijheidsenergie van cAMP aan de CNBD-van HCN-isoformen 1-4 te bepalen, waardoor inzicht wordt verkregen in de verschillen in kanaalsensitiviteit en activatiemechanismen.
Deze studie toont aan dat zelfs minimale sequentieveranderingen in intrinsiek ongeordende mitochondriale lokalisatiepeptiden de lokale structurele voorkeuren en het dynamische conformationele ensemble beïnvloeden, wat suggereert dat dergelijke variaties de targeting-efficiëntie kunnen moduleren.
Dit onderzoek combineert een nieuw experimenteel model met computermodellering om aan te tonen dat ephaptische interacties in het perinexum van cardiomyocyten, naast gap junctions, een cruciale rol spelen bij de elektrische geleiding, waarbij de bijdrage van deze mechanismen afhankelijk is van de natriumconcentratie en gap junction-conductantie.
Dit onderzoek toont aan dat clathrine, ongeacht de aanwezigheid van adaptorproteïnen, membraanfissie intrinsiek aandrijft door middel van zijn mechanische eigenschappen en roosterstijfheid, waarbij een verzwakte roosterassemblage paradoxalerwijs de fissie bevordert.
Deze studie onthult hoe specifieke interactievlakken in het C-terminale domein en de flankerende intrinsiek ongeordende regio's van het SARS-CoV-2 N-proteïne de oligomerisatie en RNA-condensatie coördineren, waardoor potentiële doelwitten voor therapeutische ingrepen worden geïdentificeerd.
Dit onderzoek onthult dat arginine in biomoleculaire condensaten effectiever dan lysine faseafscheiding bevordert, voornamelijk door de lagere dehydratatiepenalty van arginine, hoewel de sterkte van de kation-π-interactie zelf afhankelijk is van de omringende omgeving.
Dit onderzoek gebruikt all-atom moleculaire dynamica-simulaties van een volledig gelycosyleerd, in een lipidebilayer verankerd HIV-1 Env-trimer om aan te tonen dat hoewel het ectomeer rigide blijft, de intrinsieke flexibiliteit van het MPER en de interacties van het TMD met lipiden en ionen cruciaal zijn voor de conformationele variabiliteit en fusie, wat nieuwe inzichten biedt voor de ontwikkeling van antilichamen en vaccins.