⚛️ Category

biophysics

412 papers

Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.

Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.

Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.

⚛️ biophysics

Node-specific phase adjustment buffers the collective output of hyperthermal sarcomeric oscillations while preserving local power in a five-node model

Dit artikel toont aan dat een vijf-knooppuntmodel dat gebruikmaakt van een causaal, fase-gematcht routeringsmechanisme effectief de collectieve output van hyperthermische sarcomere oscillaties kan bufferen terwijl de lokale energie behouden blijft, waardoor het een ontwerpprincipe biedt voor het gelijktijdig bestaan van actieve lokale ritmes en gemodereerde globale signalen.

Shintani, S. A.2026-08-10
⚛️ biophysics

Toward Robust Characterization of Dynamic Binding Pockets: Lessons from the HBV Capsid Assembly Modulator Site

Deze studie vestigt een robuuste, gestandaardiseerde workflow met behulp van het fuzzy-boundary detectiealgoritme *measure volinterior* om de bindingspocket van de dynamische hepatitis B-viruscapside-assemblagemodulator kwantitatief te karakteriseren, wat een reproduceerbare strategie biedt voor het vergelijken van geometrische veranderingen in dynamische eiwitholtes over conformationele ensembles heen.

Perez-Segura, C., Scott, L. W., Zlotnick, A., Hadden-Perilla, J. A.2026-08-10
⚛️ biophysics

Protonation- and substrate-regulated dimer opening couples brain-type creatine kinase to vesicular and actin-remodeling membranes

Deze studie onthult dat verzuring en substraatbinding een conformationele verschuiving induceren in hersentype creatinekinase (CK-BB) van een oplosbare staat naar een open, membraan-competente dimeer, waardoor de rekrutering ervan naar gebogen vesiculaire en actin-remodellerende membranen mogelijk wordt om lokale ATP-regeneratie te koppelen aan dynamische cellulaire structuren.

Gies, S., McLaughlin, N. K., Shubbar, A., Kong, C., Wu, T., Khan, S., Ustione, A., Miller, I., Piston, D. W., Moradi, M. (…)2026-08-09
⚛️ biophysics

A water-pinning hotspot drives templated tau aggregation

Deze studie identificeert een specifieke water-pinning hotspot op het fibril-oppervlak die de initiële rekrutering en in-register stapeling van tau-monomeren tijdens getemplateerde aggregatie aanstuurt, wat een door ontwetting gemedieerd "dock-and-lock"-mechanisme onthult dat geblokkeerd kan worden om de ziekteprogressie te verstoren.

Han, C.-T., Tsay, K., Lobo, S., Najafi, S., Monahan, K., Hong, E., Shell, M. S., Shea, J.-E., Han, S.2026-08-09
⚛️ biophysics

Benchmarking AI-generated structural ensembles of membrane proteins against physics-based modelling

Deze studie toont aan dat de op AI gebaseerde tool BioEmu efficiënt plausibele conformationele ensembles kan genereren voor membraaneiwitten zoals GlpG, waarbij zeldzame toestanden en flexibele domeinen worden gevangen tegen een fractie van de computationele kosten van traditionele moleculaire dynamica-simulaties, hoewel het niet het volledige landschap volledig repliceert dat wordt waargenomen bij natuurkundig gebaseerde modellering.

Clifton, B. R., Grieve, A. G., Corey, R. A.2026-08-09
⚛️ biophysics

Propagation electrodynamics and differential conduction of action potentials in geometrically branched squid giant axons

Deze studie introduceert een gekoppeld Maxwell-elektromagnetisch kabelframework dat FDTD-oplossingen integreert met uitgebreide membraandynamica om aan te tonen dat klassieke quasi-statische modellen elektromagnetische effecten aanzienlijk onderschatten, waarbij wordt onthuld dat magnetische inductie en verplaatsingsstromen de voortplantingssnelheid van actiepotentialen, de transmissiefidelity van bifurcaties en de impedantieaanpassing in geometrisch vertakte neuronale structuren kritiek veranderen.

Liu, X., Fang, W., Perlin, K.2026-08-07
⚛️ biophysics

Conservation and divergence in the allosteric architectures of five human protein kinases

Door meer dan 160.000 varianten over vijf humane kinasen in kaart te brengen, onthult deze studie dat hoewel sommige allosterische sites geconserveerd zijn, elke kinase beschikt over een unieke en divergente energetische architectuur met onderscheidende functionele secundaire sites, wat nieuwe mogelijkheden biedt voor het ontwikkelen van specifieke therapeutische inhibitoren en activatoren.

Folgado, C., Beltran, A., Lehner, B.2026-08-07
⚛️ biophysics

Transient interdomain interactions shape the conformational ensemble governing RNA recognition by the tandem RRMs of Sex-lethal

Deze studie onthult dat de RNA-herkenning door de tandem-RRM's van het Sex-lethal-eiwit wordt beheerst door een fijn uitgebalanceerd, dynamisch conformationeel ensemble dat wordt gevormd door transiënte interdomeininteracties, waarbij verstoringen die dit evenwicht in een van beide richtingen verschuiven zowel de bindingsaffiniteit als de sequentie-selectiviteit in gevaar brengen.

Meyer, J., Schweimer, K., Matzner, P., Yoshida, S., Lomoschitz, A., Augsten, S., Simon, B., Chen, P.-c., Hennig, J.2026-08-07
⚛️ biophysics

Valency-Limited Molecular Dynamics Simulations of Stickers-and-Spacers Polymers Reveal a Tradeoff Between Condensation and Organization

Deze studie maakt gebruik van GPU-versnelde moleculaire dynamica-simulaties van een valentiebeperkt stickers-and-spacers-model om aan te tonen dat hoewel heterogene niet-specifieke spacer-interacties biomoleculaire condensatie bevorderen, zij tegelijkertijd de interne organisatie en de compositionele robuustheid van de resulterende condensaten verstoren, wat een fundamentele afweging tussen fase-scheiding en structurele orde onthult.

Zhang, Y., Sood, A., Athreya, A., Zhang, B.2026-08-06