364 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
Deze studie toont aan dat gedecomposeerde energietermen in MM-GBSA bindingsvrije energieberekeningen hoogst collinear zijn in plaats van onafhankelijk, wat onthult dat traditionele aannames van scheidbaarheid ongeldig zijn en oproept tot de combinatie van gecorreleerde termen tot effectieve polaire, niet-polaire en entropische bijdragen voor robuustere voorspellende modellering.
Deze studie presenteert cryo-EM-structuren van heteromere GluK2/GluK5-kainaatreceptoren in apo-, agonist-gebonden en antagonist-gebonden toestanden, waarbij wordt onthuld dat heterotetrameren een verminderde conformationele dynamiek vertonen vergeleken met homomeren en wordt aangetoond dat het targeten van de GluK5-subunit met UBP310 effectiever is dan het targeten van GluK2 door de receptor vast te leggen in een porie-geoccludeerde conformatie.
Dit artikel introduceert een 3D mechanisch adaptief visco-elastisch celnetwerkmodel dat discrete interacties tussen individuele cellen en de herstructurering van verbindingen koppelt aan emergente weefselschaal-rheologie, en valideert succesvol het vermogen om complexe fenomenen zoals swirlen en jamming te reproduceren tegenover experimentele micropipet-aspiratie- en compressie-assays.
Deze studie toont aan dat stereochemische modificaties in oligopeptiden de elektronentransport significant controleren door het stapelen van aromatische zijketens in tyrosine-gebaseerde sequenties en secundaire structuurconformaties in alanine-gebaseerde sequenties te veranderen, wat nieuwe paden biedt voor het ontwerpen van peptide-gebaseerde elektronische materialen.
Dit artikel stelt een verenigd conceptueel kader en een biofysisch model voor dat aantoont hoe geometrische effecten, parallelle amplificatie en mechanismen van middelen-delen-polarisatie gezamenlijk de onderscheidende microtubuli-oriëntaties vestigen die de axon-dendriet-differentiatie in ontwikkelende neuronen definiëren.
De auteurs hebben hun manuscript ingetrokken omdat verbeterde twee-kleuren MINFLUX-experimenten hun initiële bewering van een "Chasse-Inchworm"-stapmechanisme voor kinesine-1 hadden weerlegd, waarbij werd onthuld dat de motor in plaats daarvan het algemeen aanvaarde hand-over-hand-mechanisme met stappen van 8 nanometer volgt.
Het artikel introduceert MAHLER, een open-source hybride machine learning- en fysica-methode die inverse folding integreert met metadynamica om snel en nauwkeurig de dissociatiekinetiek van antilichaam-antigeen op schaal te voorspellen, wat een praktisch alternatief biedt voor op affiniteit gerichte ontwerptools.
Met behulp van viervoudige optische pincetten en een Bayesiaanse unmasking-strategie demonstreert deze studie dat enkelvoudige actine- en vimentinefilamenten directe, krachtdragende interacties vormen die onafhankelijk zijn van crosslinking-eiwitten, met bindingssterktes die robuust zijn tegen variaties in ionsterkte maar beperkt worden door de mechanische limieten van actinefilamenten.
Deze studie toont aan dat de ruimtelijke organisatie van anionische lipiden binnen lipidenanodisken, gedreven door clustering en interacties met het membraanskeletproteïne, de conformationele evenwichten van de A2A-adenosine-receptor kritisch reguleert, een mechanisme dat gemoduleerd kan worden door middel van gerichte proteïne-engineering.
Deze studie onthult dat FluoVolt-kleuring en de daarmee gepaard gaande laser-excitatie aanzienlijke fotodamage en door kleurstof geïnduceerde morfologische perturbaties in diverse celtypen veroorzaken, wat geoptimaliseerde protocollen noodzakelijk maakt om systematische artefacten bij live-cell voltage imaging te mitigeren.