502 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Dit onderzoek presenteert de eerste hoogwaardige genoomassemblage van *Chaetoceros muelleri*, afgeleid van in sedimenten bewaarde cellen, en onthult dat extensieve gen-duplicatie, functionele diversificatie en transposon-gemedieerde plasticiteit cruciale drijvende krachten zijn in de evolutie van deze diatomee.
Dit artikel vergelijkt de genomics van twee waterstof-oxidierende bacteriestammen, Cupriavidus necator H16 en Xanthobacter sp. SoF1, om hun geschiktheid te beoordelen voor schaalbare 'power-to-food' eiwitproductie en veilige toepassing in gesloten systemen op aarde en in de ruimte.
Deze studie toont aan dat methyleringsklokken de leeftijd en het risico op de ziekte van Alzheimer onnauwkeurig voorspellen bij genetisch gemengde populaties, voornamelijk door verschillen in methyleringspatronen en genetische varianten die specifiek zijn voor Afrikaanse afkomst.
Deze studie presenteert een workflow voor het isoleren van niet-gefixeerde celtype-specifieke kernen uit bevroren hersenweefsel en het uitvoeren van nanoCUT&Tag, waardoor epigenomische profielen kunnen worden verkregen voor diverse neurovasculaire celtypen die relevant zijn voor neurodegeneratieve ziekten.
Het Egypt Genome Project (EGP1K) heeft door het whole-genome sequencing van 1.024 Egyptenaren een cruciale genetische referentie voor deze ondervertegenwoordigde populatie gecreëerd, waarbij wordt aangetoond dat Europese risicotrainingen voor polygene scores niet direct toepasbaar zijn en dat er behoefte is aan populatiespecifieke kalibratie.
Deze studie onthult dat de driedimensionale genoomorganisatie bij Drosophila fundamenteel verschilt van die bij mensen, omdat vlieggenomen voornamelijk worden gestructureerd door LLPS-gemedieerde A-ruimten en Su(Hw)-geankerde lussen, terwijl menselijke genoomcompartimenten berusten op robuuste homotyperische interacties en CTCF-afhankelijke structuren.
Dit artikel presenteert het eerste haplotype-opgeloste telomeer-tot-telomeer-genoom van een varken, wat essentieel is voor het verbeteren van xenotransplantatie en interspecifieke chimera's door nieuwe genen te identificeren en een compatibiliteitsscore voor orgaanontwikkeling te definiëren.
In tegenstelling tot de bij andere soorten waargenomen versnelde veroudering door vroegkinderlijke trauma's, vertoonden weesolifanten in de Afrikaanse savanne een jongere epigenetische leeftijd en een beperkt epigenetisch signaal, wat suggereert dat deze soort mogelijk evolutionaire mechanismen heeft ontwikkeld om zich te beschermen tegen de epigenetische gevolgen van vroegkinderlijke stress.
Dit onderzoek toont aan dat het DNA-taalmodel GROVER, vooral wanneer het wordt gecombineerd met chromatin- en regulatorische kenmerken, effectief dubbelstrengsbreuken kan voorspellen en onthult dat hoewel chromatin context belangrijk is voor celtype-specifieke patronen, veel van de informatie die de genoomstabiliteit bepaalt al in het DNA-sequens zelf is gecodeerd.
DenMark is een Bayesiaans hiërarchisch model dat lokale celdichtheid en genexpressie in ruimtelijke transcriptomics-data koppelt om genen te identificeren die correleren met celdichtheid, terwijl het tegelijkertijd onzekerheid kwantificeert en schaalbaar is voor grote datasets.