🧬 Category

genomics

345 papers

Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.

Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.

Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.

🧬 genomics

Interspecies variation of 45S ribosomal DNA in vertebrates

Deze studie maakt gebruik van chromosoom-schaal assemblages van het Vertebrate Genomes Project om te onthullen dat de 45S ribosomale DNA-locus binnen vertebraten een meerlagig evolutionair systeem is, gekenmerkt door lijn-specifieke variaties in genomische architectuur en kopie-aantal, terwijl een gradiënt van sequentieconservering behouden blijft die overgaat van zeer stabiele rRNA-coderende regio's naar snel divergerende spacer-sequenties.

Kang, L., Formenti, G., O'Connor, T., Michalak, P.2026-06-10
🧬 genomics

Metagenomic prediction of methane emissions in sheep using single- and multi-matrix BLUP models with taxonomic and functional microbial features

Deze studie toont aan dat het gebruik van long-read metagenomische data met COG-gebaseerde functionele kenmerken in single- en multi-matrix BLUP-modellen nauwkeurige voorspelling van enterische methaanemissies bij schapen mogelijk maakt, waarbij de prestaties de taxonomische kenmerken overtreffen en suggereert dat functionele annotatie alleen voldoende is voor effectieve strategieën voor methaanreductie.

Li, Y., Ong, C. T., Yadav, S., Aldridge, M., Fitzgerald, P., van der Werf, J., Nguyen, L. T., Ross, E. M.2026-06-10
🧬 genomics

Whole genome sequencing and variant discovery in 344 global grasspea (Lathyrus sativus L.) lines

Deze studie pakt de genomische hulpbronnenkloof voor het onderbenutte gewas grassoog aan door whole-genome sequencing-data te genereren voor 344 wereldwijde lijnen en een hoog-densiteit SNP-markerset van meer dan 1,5 miljoen varianten te ontwikkelen om toekomstige veredeling en kenmerkontdekking te faciliteren.

Schreiber, M., Staples, J., Emmrich, P. M. F., Edwards, A., Martin, C., Bayer, M., Raubach, S., Kilian, B., Shaw, P. D.2026-06-09
🧬 genomics

Scalable in vivo cardiac functional genomics with compressed AAV-Perturb-seq reveals a common mitochondrial response to perturbation

Deze studie introduceert een schaalbaar in vivo gecomprimeerd AAV-Perturb-seq platform dat er succesvol in slaagt genotypes aan fenotypes te koppelen in het hart, waarbij wordt onthuld dat mitochondriale transcriptoomveranderingen een gemeenschappelijke reactie zijn op diverse genetische perturbaties.

Kuznetsov, I. A., Li, K., Yang, Y., Zhao, W., Zhou, W., Zhu, W., Liang, J., Li, J., Edwards, J. J., Arany, Z.2026-06-05
🧬 genomics

Persistent circulation of Rift Valley fever virus lineage C in Rwanda, 2022-2025

Deze studie maakt gebruik van Nanopore-sequencing van veestofmonsters uit 2022 tot 2025 om aan te tonen dat recurrente uitbraken van het Rift Valley-koorts in Rwanda worden gedreven door de aanhoudende lokale circulatie van lineage C in plaats van door herhaalde virale introducties.

Udahemuka, J. C., Cassidy, H., Schuele, L., Uwibambe, E., Ngabo, M. G., Masirika, L. M., Otani, S., Gashegu, M., Twizere (…)2026-06-05
🧬 genomics

CLASH (Chromatin Loop Across-sample Score Harmonizer) quantifies the relative contributions of genetic variation, methylation, and CTCF occupancy on chromatin loop strength across individuals

Deze studie introduceert CLASH, een computationeel raamwerk dat chromatine-lus-calls over individuen heen harmoniseert met behulp van multimodale genomische data om te kwantificeren hoe genetische variatie, methylering en CTCF-occupancy gezamenlijk de differentiële lusvorming en -sterkte in menselijke populatiesel vormgeven.

Ranparia, V., Fudenberg, G., Chaisson, M.2026-06-04
🧬 genomics

Architectural fragility of gene regulatory networks underlies hematopoietic stem cell aging

Door de grootste enkelvoudige cel multiom-atlas van menselijke hematopoëtische stam- en progenitorcellen tot nu toe te analyseren, onthult deze studie dat veroudering een selectieve, door entropie gemedieerde instorting van complexe distale enhancer-netwerken aanstuurt terwijl de GC-rijke promoterarchitecturen behouden blijven, wat leidt tot een globale herbedrading die stresshyperactivatie, myeloïde bias en het verlies van zelfvernieuwingscapaciteit veroorzaakt.

Stevens, H. P., Yucel, A. D., Gould, R. A., Cai, G., Gladyshev, V. N., Plesa, A. M., Church, G. M.2026-06-04
🧬 genomics

Integrative genomics reveals shared and stress-specific adaptive pathways underlying acidic soil-associated metal toxicity in rice

Deze studie integreert meta-QTL-analyse en functionele genomics om gedeelde en stressspecifieke genomische paden, inclusief belangrijke kandidaatgenen en fysiologische mechanismen, te identificeren die ten grondslag liggen aan de adaptatie van rijst aan aluminium-, cadmium- en mangaantoxiciteit in zure bodems.

Jaiswal, S., Kumari, A., Singh, B. K., Kumar, K., Kumar, S., Kumar, S., Kaur, S., Prakash, N. R., Baiswar, P., Bharati (…)2026-06-03
🧬 genomics

A multi-tissue atlas of genetic regulatory effects in sheep

Deze studie presenteert de SheepGTEx-resource, een uitgebreide multi-tissue atlas afgeleid van 6.761 RNA-sequencing monsters verspreid over 51 weefsels en meerdere schapenrassen, die miljoenen regulatoire varianten identificeert om de genetische mechanismen te verduidelijken die ten grondslag liggen aan complexe eigenschappen, populatiedivergentie en adaptieve evolutie bij schapen.

Gong, M., Zhuang, Z., Sun, X., Xu, Y., Zhang, H., Wang, Y., Guan, D., Li, R., Lu, X., Bai, Z., Feng, P., Song, M., Tian (…)2026-06-02
🧬 genomics

Atg8 orchestrates stress-responsive chromatin programs across immunity and metabolism

Deze studie onthult dat het autofagie-eiwit Atg8/LC3 stressresponsieve transcriptieprogramma's in zowel immuniteit als metabolisme coördineert door direct te interageren met de NF-κB-transcriptiefactor Dif via geconserveerde motieven om zijn nucleaire accumulatie en chromaatinoccupatie te reguleren, waardoor cellen in staat worden gesteld verdediging en metabole aanpassing tijdens infectie en voedingsoverschot te coördineren.

Kelly, K. P., Ramesh, N. A., Ranganathan, S., Madan, A., Marschall, S. N., Unckless, R., Rajan, A.2026-05-28