398 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Deze studie onthult de ongekende abundantie en diversiteit van endogene virofagen en Polinton-achtige virussen binnen het genoom van de halofiele protist *Halocafeteria seosinensis*, wat wijst op hun complexe genetische uitwisseling, supraparasitisme door mobiele elementen en een significante bijdrage aan het genomische landschap van de gastheer.
Met behulp van long-read sequencing en Omni-C data lost deze studie de complexe evolutionaire geschiedenis van de gecultiveerde dahlia op door een tetraploïde genoom voor *Dahlia variabilis* 'Edna C' te assembleren en deze te identificeren als een segmentale tetraploïde met kenmerken van zowel auto- als allopolyploïdie.
Deze studie toont aan dat drie generaties van metabole uitdagingen in een vroeg stadium bij muizen genoominstabiliteit induceren en de genetische variabiliteit beperken door de activiteit van transponeerbare elementen en kopieenaantalvariaties, in plaats van door wijdverspreide veranderingen in DNA-methylering.
Deze studie maakte gebruik van een genoombrede associatieanalyse op 384 elite Britse tarwegenotypes om zeven genetische loci te identificeren, waaronder belangrijke stabiele effecten op chromosomen 1B en 6B, die het gehalte aan waterextracteerbare arabinoxylan reguleren, waarmee wordt aangetoond dat het stapelen van gunstige allelen binnen bestaand kiemplasma een praktische strategie biedt voor de veredeling van tarwe met een verhoogd dieetvezelgehalte.
Deze studie onthult dat TRIM28 de identiteit van ovariële cellen primair behoudt door te fungeren als een transcriptionele co-regulator die lijn-specifieke transcriptiefactorhubs (zoals FOXL2 en NR5A2) stabiliseert via SUMOylering, in plaats van door het in stand houden van H3K9me3-afhankelijke heterochromatine.
Deze studie construeert een uitgebreide multidimensionale kaart van genetische variatie van meer dan 8.000 volledige menselijke centromeren door diverse genoomassemblages te integreren, waarbij uitgebreide structurele diversiteit, populatiestratificatie en een tweesporen-evolatiemodel wordt onthuld dat structurele innovatie balanceert met mutationele beperking, terwijl het een cruciale bron biedt voor het begrijpen van centromeerbiologie en geassocieerde stoornissen.
Deze studie maakt gebruik van genoombrede gegevens om de eerste schattingen van de genetische belasting bij gevederde herten te bieden en geactualiseerde beoordelingen van runs-of-homozygosity voor witte staart herten te geven, waarbij een verhoogde inteelt bij Key-herten en een toegenomen genetische belasting in populaties van gevederde herten in de Pacific Northwest worden onthuld als gevolg van historische flessenhalzen.
Deze studie maakt gebruik van Perturb-seq in een fysiologisch relevant epidermaal organoïdmodel om genetische drijfveren van keratinocytdifferentiatie te ontdekken en de bidirectionele rol van niet-canonieke NF-κB-signalering in late differentiatie te onthullen, waarbij de beperkingen van eerdere op 2D-cultuur gebaseerde screens worden overwonnen.
Door genoombrede epigenomische profielen te integreren, identificeert deze studie vijf hoofdchromatinetoestanden en onthult zij dat celtype-specifieke verschillen primair worden gedreven door de remodeling van Polycomb-geassocieerd chromatine, terwijl CTCF-geassocieerd chromatine dient als een cruciale architecturale anker die de chromatinestructuur verbindt met de driedimensionale genomische structuur.
Door meer dan 1.100 *Arabidopsis thaliana*-genomen te analyseren, identificeert deze studie een complexe genetische architectuur die zowel cis- als trans-werkende loci omvat die de abundantie van repeats reguleren, en onthult zij dat zuiverende selectie werkt om snelle divergentie van genoominhoud te beperken.