🧬 Category

genomics

345 papers

Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.

Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.

Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.

🧬 genomics

Local ancestry inference identifies robust evidence of selection in Neolithic Europe

Door zes methoden voor lokale afstammingsinference te benchmarken op neolithische Europese genomen, toont deze studie aan dat hoewel multi-methodevalidatie selectiesignalen in genen gerelateerd aan pigmentatie en metabolisme robuust kan identificeren, de afgeleide afstammingspatronen en selectiesignaturen sterk gevoelig zijn voor de specifieke gebruikte methode, met name in complexe regio's zoals het HLA.

Mies, G., Mathieson, I.2026-04-28
🧬 genomics

Genome-wide association study of morphometric and metabolic characteristics in the European populations of the sugar kelp Saccharina latissima

Deze studie voert de eerste genoombrede associatiestudie (GWAS) uit bij de suikerwiersoort *Saccharina latissima* om de genetische basis van morfologische en metabole eigenschappen te identificeren, wat een fundament legt voor versnelde veredeling in de zeewieraquacultuur.

MAUGER, S., AVIA, K., JAUGEON, L., RUGGERI, P., NEHR, Z., SALIA, O. I., COUDRET, J., GOUHIER, E., BAUD, A., LOISEL, S. (…)2026-04-28
🧬 genomics

Genomic basis of rapid urban evolution revealed by the subgenome-resolved genome of octoploid Oxalis corniculata

Door middel van geavanceerde genoomsequencing hebben onderzoekers de genetische basis ontdekt van de snelle adaptatie van de achtvoudige plant *Oxalis corniculata* aan stedelijke hitte, waarbij een specifieke variatie in een MYB-transcriptiefactor verantwoordelijk blijkt te zijn voor de verandering in bladkleur.

Iimura, H., Sato, M. P., Aoyagi, Y. B., Kikuchi, S., Tachiki, Y., Uchida, K., Katsuhara, K. R., Hiraoka, K., Fukano, Y. (…)2026-04-27
🧬 genomics

A new phased assembly of the Antarctic spiny plunderfish provides novel insights into the evolution of the notothenioid radiation.

Dit onderzoek presenteert een nieuwe gefaseerde genoomassemblage van de Antarctische spiny plundervis (*Harpagifer antarcticus*) en onthult dat transposon-activiteit, genoomuitbreiding en diversificerende selectie op antioxidanten en proteostase-genen cruciale drijvende krachten waren achter de evolutionaire adaptatie en radiatie van de notothenioïden in de extreme koude.

Martelossi, J., Krasheninnikova, K., Denton, A., Wood, J. M. D., Mathers, T., Durbin, R., Fong, N., Bentley, D. L., Clar (…)2026-04-23
🧬 genomics

Functional characterisation of an essential neo-chromosome III in Sc2.0 strain reveals opportunities and challenges for genome minimisation in Sc3.0

Dit onderzoek toont aan dat het verplaatsen van essentiële genen naar een synthetisch neo-chromosoom in de Sc2.0-yeast-stam de mogelijkheid biedt tot verdere minimalisatie van het genoom, terwijl het gebruik van orthologe regulerende elementen en een nieuwe SCRaMbLE-rapportage (ERICA) stabiele, levensvatbare cellen met uitgebreide deletiemogelijkheden oplevert die als blauwdruk kunnen dienen voor genoomminimalisatie in complexere eukaryoten.

Swidah, R., Monti, M.2026-04-22
🧬 genomics

Estimating protein isoform abundances with PAQu

Deze paper introduceert PAQu, een nieuwe Bayesiaanse methode die transcriptoom- en peptidoomgegevens combineert om de abundantie van eiwit-isoformen nauwkeurig te schatten en differentieel tot expressie gebrachte isoformen te detecteren, wat wordt geïllustreerd door de bevestiging van verhoogde C4A-isoformniveaus bij schizofrenie.

Testa, L., Klei, L., Rengle, A., Yocum, A., Lewis, D. A., Devlin, B., Roeder, K., MacDonald, M. L.2026-04-22
🧬 genomics

Single-Plant Genome-Wide Association Study Identifies Loci Controlling Multiple Vegetative Architecture Traits in Cultivated Northern Wild Rice (Zizania palustris L.)

Dit onderzoek toont aan dat een single-plant genoomwijd associatiestudie (sp-GWAS) succesvol loci kan identificeren die meerdere vegetatieve architectuurkenmerken van de geteelde Noordelijke wilde rijst (Zizania palustris L.) reguleren, wat de weg vrijmaakt voor genomische selectie in deze heterozygote en niet-repliceerbare gewas.

McGilp, L., Millas, R., Mickelson, A., Shannon, L. M., Kimball, J.2026-04-19