502 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Deze studie presenteert een hoogwaardig atlas van transcriptiedynamiek in het perifeer bloed van 31 gezonde zwangere vrouwen, waarbij door middel van longitudinale RNA-sequencing 720 genen met zwangerschapsspecifieke expressiepatronen en negen gecoördineerde modules werden geïdentificeerd die veranderingen in immuniteit, erytropoëse en hemoglobine metabolisme weerspiegelen.
In dit artikel wordt SnakeHichipTF gepresenteerd, een schaalbaar AI-gebaseerd raamwerk dat de specifieke logica van transcriptiefactoren onthult die de enhancer-promotorconnecties in verschillende regio's van het menselijk brein reguleren, waardoor verbanden worden gelegd met ziekterisico's, metabolische processen en evolutionaire aanpassingen.
Dit onderzoek toont aan dat door boeren onderhouden cacao-varieteiten in Costa Rica een aanzienlijke, tot nu toe onderbelichte genetische diversiteit bevatten, waaronder Criollo-lijnen en unieke lokale groepen, wat het belang van deze systemen voor behoud en veredeling onderstreept.
Deze paper introduceert MystraColoc, een Bayesiaans algoritme dat de prestaties en inzichten van multi-trait colocalisatie in duizenden GWAS-datasets aanzienlijk verbetert ten opzichte van bestaande methoden.
Dit artikel introduceert TrIdent, een R-pakket dat de tijdrovende handmatige analyse van transductomics-data automatiseert en reproduceerbaar maakt, waardoor het mogelijk wordt om efficiënt DNA-mobilisatie via virus-achtige deeltjes in muismicrobiomen te bestuderen.
Deze systematische review toont aan dat verstedelijking de bacteriële diversiteit in zoetwater vermindert en leidt tot een toename van pathogene bacteriën en antimicrobiële resistentie, wat ernstige gevolgen heeft voor de volksgezondheid en het ecosysteem.
Het paper introduceert scGRIP, een verklaarbaar AI-framework dat een grafvariatiële autoencoder en vooraf bestaande kennis gebruikt om op celniveau nauwkeurige genregulatienetwerken te infereerren uit single-cell multi-omics data, wat leidt tot beter inzicht in ziekteprocessen zoals de ziekte van Alzheimer.
Dit onderzoek onthult dat longplaveiselcelcarcinoom evolueert via een overgang van polyklonaal naar monoklonaal, een proces dat wordt gereguleerd door remming van de JNK-route en cytoskeletdysregulatie, wat nieuwe inzichten biedt voor gepersonaliseerde therapieën.
Dit onderzoek toont aan dat DNA-methylering een hoofdregulator is van de menselijke centromeer-organisatie, waarbij hypomethylering leidt tot het samenvloeien van CENP-A-domeinen en hypermethylering in pluripotente stamcellen resulteert in geconsolideerde, bredere tracts.
Het artikel introduceert BioWorldModel, een architectuur die genotype omzet naar fenotype door biologische processen als dynamische lagen te modelleren, waardoor de voorspellende nauwkeurigheid voor bacteriën, schimmels, dieren en planten aanzienlijk verbetert ten opzichte van traditionele statische methoden.