275 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Dit onderzoek toont aan dat BAF-complexen continu nodig zijn om de toegankelijkheid van chromatin te behouden bij stimulus-responsieve versterkers, waardoor ze essentieel zijn voor de genexpressie-reactie op externe prikkels zoals interferon-gamma.
Deze studie onthult dat het Europese wolfpopulatiecomplex uit diverse evolutionaire lijnen bestaat met ernstige genetische erosie en inteelt in geïsoleerde populaties, wat noodzaakt tot regionale, op genetisch toezicht gebaseerde behoudsmaatregelen.
Deze studie toont aan dat een celvrij systeem van Drosophila-embryo-extracten de spontane vorming van complexe chromatinestructuren, zoals TADs en lussen, kan reconstrueren en onthult dat de vorming van TADs bij de eve-locus niet door eenvoudige loop-extrusie, maar door directe Su(Hw)-gemedieerde paring van grenselementen wordt aangestuurd.
Dit onderzoek combineert evolutionaire en diep leermethoden om schadelijke mutaties in suikerbieten te identificeren, waarbij wordt aangetoond dat hoewel domesticatie de genetische last verhoogde, de moderne veredeling gedurende meer dan een eeuw succesvol heeft geleid tot een afname van deze last en nieuwe kansen biedt voor precisie-veredeling.
Dit onderzoek onthult dat de geslachtsbepaling bij de invasieve zebra- en quaggamossel fundamenteel verschilt, waarbij de zebra-mossel een polygenetisch ZZ/ZW-systeem vertoont terwijl de quaggamossel een geconcentreerd XX/XY-systeem bezit met FoxL2-Y als nieuw mannelijk bepalend locus.
Dit artikel presenteert een chromosoom-niveau genoom van de C4-gras *Themeda triandra* dat hoge syntenie met sorghum onthult en genetische variatie blootlegt die gerelateerd is aan aanpassing aan diverse omgevingen, wat waardevolle inzichten biedt voor graslandbeheer en klimaatbestendigheid.
Deze studie introduceert een continu-lerend raamwerk dat een vergelijkbaar single-cell-atlas van colorectale kanker integreert met perturbatiegegevens om causale mechanismen te onthullen die celstaten en therapeutische responsen bepalen, waardoor een weg wordt gebaand naar gerichte behandelingen.
Deze studie toont aan dat de transcriptomische instabiliteit van atopische dermatitis voortkomt uit een structurele afhankelijkheid van effectgroottes en onthult dat een reproduceerbaar deel van patiënten met niet-lesionale huid al een individuele ontsnapping aan de homeostatische grens vertoont, wat een nieuw inzicht biedt in de ziektemechanismen en een potentieel doelwit voor vroege interventie.
Deze studie introduceert een uniek dataset- en modeleringskader, gebaseerd op data van 190 Parkinson-patiënten en controles, om cis-regulatorische variatie in menselijke hersenen te modelleren en zo de functionele impact van niet-coderende genetische varianten op Parkinson's ziekte te ontrafelen.
Dit artikel introduceert OxBreaker, een geautomatiseerd en soortonafhankelijk open-source-pipeline dat met behulp van Oxford Nanopore-sequencing en een gebruiksvriendelijke interface nauwkeurige, real-time genomische surveillance van bacteriële uitbraken mogelijk maakt voor niet-specialisten.