398 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Deze studie heeft een flexibele GT-seq genomische panel ontwikkeld en gevalideerd die niet alleen de cryptische diversiteit binnen het *Coregonus artedi*-complex oplost, maar ook succesvol kruis-amplificeert om verwante witvissoorten te identificeren, wat grootschalige ecologische monitoring van vroege levensstadia in de Laurentiaanse Grote Meren mogelijk maakt.
Deze studie identificeert co-expressie van microRNA's en hun geassocieerde mRNA-doelwitten bij vrouwen in de midlife met prediabetes, waarbij wordt onthuld dat metabole, inflammatoire, endocriene en stressgerelateerde paden ten grondslag kunnen liggen aan het verhoogde risico op multimorbide depressie en diabetes type 2 in deze populatie.
Dit artikel introduceert LongBench, een uitgebreide multi-platform referentiedataset die acht menselijke longkankercellijnen profileert met behulp van bulk-, single-cell- en single-nucleus long-read RNA-sequencingtechnologieën, die hun prestaties systematisch evalueert om een hoge concordantie in genniveau-analyses te onthullen, maar een verminderde consistentie in transcriptniveau- en isoformresolutie vanwege platformspecifieke biases.
Deze studie maakt gebruik van chromosoom-schaal assemblages van het Vertebrate Genomes Project om te onthullen dat de 45S ribosomale DNA-locus binnen vertebraten een meerlagig evolutionair systeem is, gekenmerkt door lijn-specifieke variaties in genomische architectuur en kopie-aantal, terwijl een gradiënt van sequentieconservering behouden blijft die overgaat van zeer stabiele rRNA-coderende regio's naar snel divergerende spacer-sequenties.
Deze studie toont aan dat het gebruik van long-read metagenomische data met COG-gebaseerde functionele kenmerken in single- en multi-matrix BLUP-modellen nauwkeurige voorspelling van enterische methaanemissies bij schapen mogelijk maakt, waarbij de prestaties de taxonomische kenmerken overtreffen en suggereert dat functionele annotatie alleen voldoende is voor effectieve strategieën voor methaanreductie.
Deze studie pakt de genomische hulpbronnenkloof voor het onderbenutte gewas grassoog aan door whole-genome sequencing-data te genereren voor 344 wereldwijde lijnen en een hoog-densiteit SNP-markerset van meer dan 1,5 miljoen varianten te ontwikkelen om toekomstige veredeling en kenmerkontdekking te faciliteren.
Deze studie introduceert een schaalbaar in vivo gecomprimeerd AAV-Perturb-seq platform dat er succesvol in slaagt genotypes aan fenotypes te koppelen in het hart, waarbij wordt onthuld dat mitochondriale transcriptoomveranderingen een gemeenschappelijke reactie zijn op diverse genetische perturbaties.
Deze studie maakt gebruik van Nanopore-sequencing van veestofmonsters uit 2022 tot 2025 om aan te tonen dat recurrente uitbraken van het Rift Valley-koorts in Rwanda worden gedreven door de aanhoudende lokale circulatie van lineage C in plaats van door herhaalde virale introducties.
Deze studie introduceert CLASH, een computationeel raamwerk dat chromatine-lus-calls over individuen heen harmoniseert met behulp van multimodale genomische data om te kwantificeren hoe genetische variatie, methylering en CTCF-occupancy gezamenlijk de differentiële lusvorming en -sterkte in menselijke populatiesel vormgeven.
Door de grootste enkelvoudige cel multiom-atlas van menselijke hematopoëtische stam- en progenitorcellen tot nu toe te analyseren, onthult deze studie dat veroudering een selectieve, door entropie gemedieerde instorting van complexe distale enhancer-netwerken aanstuurt terwijl de GC-rijke promoterarchitecturen behouden blijven, wat leidt tot een globale herbedrading die stresshyperactivatie, myeloïde bias en het verlies van zelfvernieuwingscapaciteit veroorzaakt.