502 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Dit onderzoek toont met behulp van een geoptimaliseerde, gemultiplexte single-cell multiome-methode (mTEA-seq) aan dat hoge insulineniveaus in de kindertijd bij mannen een aanhoudende, geslachtsgebonden moleculaire signatuur in bloedgevende immuuncellen creëren die een specifiek subtype van astma definieert.
Deze studie toont aan dat genomische markers, specifiek een 7 kb profage-gebied in *Salmonella* Agona, kunnen worden gebruikt om voedselgeassocieerde stammen met een verhoogd risico op menselijke infectie te onderscheiden, waardoor een meer gerichte en voorspellende risicobeoordeling mogelijk wordt.
Dit onderzoek onthult dat bij de parasitaire nematoden *Ascaris* en *Parascaris* ruimtelijke interacties en 3D-genoomherorganisatie een cruciale rol spelen bij het mechanisme van geprogrammeerde DNA-eliminatie, waarbij hoewel de initiële interacties verschillen, de uiteindelijke ruimtelijke organisatie van de somatische chromosomen evolutionair behouden blijft.
Dit onderzoek toont aan dat tijdelijke RNA-gebaseerde epigenoom-editing van menselijke hematopoëtische stamcellen leidt tot duurzame, erfelijke en omkeerbare onderdrukking van de bloedplaatjesintegrine ITGB3, waardoor een effectieve en langdurige preventie van trombose mogelijk wordt.
Deze studie gebruikt structurele voorspelling om nieuwe, compacte RNA-geleide nucleasen met een zeer diverse PAM-preferentie te identificeren, waardoor efficiëntere in vivo genoomeditie mogelijk wordt.
Deze studie onthult dat verlies aan systemische genoomcorrelatie, en niet enkel veranderingen in genexpressie, de centrale biologische handtekening van ruimtevaart is waarbij de regulerende architectuur van het transcriptoom in microzwaartekracht vervalt naar stochasticiteit, wat een nieuw paradigma voor astronautische gezondheidszorg vereist dat zich richt op netwerkstabilisatie in plaats van padremming.
MINTsC is een nieuw computergestuurd hulpmiddel dat, door gebruik te maken van Dirichlet-multinomiaal spline-modellen op single-cell Hi-C-data, tot nu toe over het hoofd geziene multi-way chromosomale interacties kan detecteren en zo de studie van genregulatie en epistatische SNP-effecten mogelijk maakt.
Deze studie biedt de eerste uitgebreide analyse van niet-B-DNA-motieven in vogelgenomen, waarbij wordt aangetoond dat hun verdeling sterk varieert tussen chromosoomgroepen, een rol speelt in genregulatie en uitdagingen oplevert voor de assemblage van dot-chromosomen.
Dit onderzoek onthult dat crossovers tijdens meiose evolutionair geconserveerd worden weggeleid van genen die actief zijn in de transcriptie, doordat DNA-breuken in deze genen snel worden gerepareerd als niet-crossovers, terwijl langzamere reparatie leidt tot crossovers in andere gebieden.
Deze studie presenteert een gestructureerde workflow voor het systematisch identificeren en filteren van zaad-gedreven off-target-effecten in CRISPRi Perturb-seq-experimenten door gebruik te maken van transcriptomische gelijkenis tussen cellen met off-target-gidsen en die met directe doelwit-gidsen.