502 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Deze studie toont aan dat replicatie-geassocieerde hypomethylatie van solo-WCGW CpG-sites een gedeelde epigenetische handtekening vormt van immuuncelproliferatie bij immuungemedieerde ziekten, terwijl gelijktijdig ziektespecifieke immunologische dynamiek wordt weerspiegeld in hypomethylatiepatronen binnen transcriptief actieve regio's zoals de T- en B-celreceptorloci.
Dit artikel presenteert de eerste chromosoom-schaal genoomassemblage van de invasieve Erythrina-galwesp (*Quadrastichus erythrinae*), inclusief het genoom van zijn endosymbiont *Wolbachia*, wat een belangrijke basis vormt voor verder evolutionair en beheersonderzoek.
Dit onderzoek toont aan dat hittestress bij lacterende Holstein-koeien leidt tot locus-specifieke DNA-hypomethylering in immuuncellen, wat wijst op epigenetische veranderingen die de immuunregulatie beïnvloeden.
Deze studie onthult dat de evolutie van het immuunsysteem in de Solanoideae wordt gedreven door een gecentraliseerde pangenoom-architectuur waarbij specifieke NLR-families via lijn-specifieke expansies worden versterkt om zich aan te passen aan pathogenedruk, in plaats van door willekeurige diversificatie.
De studie toont aan dat systematische over-conversiefouten in de enzymatische methyleringsequencing (EM-seq) leiden tot een vals-positieve achtergrondsignaal dat de specificiteit van cfDNA-analyses aanzienlijk beperkt, in tegenstelling tot bisulfiet- en nanopore-sequencing.
Deze studie analyseerde 2.658 *Desulfovibrio*-genomen en onthulde dat soortspecifieke functionele eigenschappen, zoals flagelline en de productie van waterstofsulfide, nauw verbonden zijn met inflammatoire ziekten en een verstoord immuunrespons.
Dit artikel presenteert GmHapMap-II, een uitgebreide globale haplotypekaart van 1.278 sojaboon- en wilde soja-toegangsen die als waardevol genomisch hulpmiddel dient voor het ontdekken van nieuwe genen, het analyseren van haplotype-diversiteit en het verbeteren van de kweek van hoogwaardige rassen.
Deze studie presenteert een hoogwaardige, telomeer-tot-telomeer genoomassemblage van het Lumpy skin disease virus (LSDV) stam Oman 2009, waarbij een hybride benadering van korte en nauwkeurige lange Nanopore-lezingen werd gebruikt om complexe herhalingsstructuren op te lossen en een nauwkeurige referentie te bieden voor toekomstig toezicht en evolutionair onderzoek.
Deze studie introduceert NMDetective-AI, een model dat de kwaliteit van voorspellingen voor nonsense-gemedieerde mRNA-afbraak (NMD) aanzienlijk verbetert door grote datasets en mutatiescanning te combineren, waardoor de klassieke regels voor NMD worden vervangen door kwantitatieve, gen-afhankelijke responscurves die van belang zijn voor variantinterpretatie en therapieontwikkeling.
Dit onderzoek suggereert dat tempererende en filamentuze bacteriofagen in koralen met Stony Coral Tissue Loss Disease (SCTLD) dienen als reservoirs voor virulentiegenen die via lysogene conversie de pathogeniteit van bacteriën kunnen versterken, wat een mechanistisch kader biedt voor het ontstaan van deze dodelijke ziekte.