502 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Dit onderzoek analyseert voor het eerst de genetische diversiteit van cytochroom P450-genen in 1.467 honingbij-individuen van 18 ondersoorten en onthult dat positieve selectie op deze genen, met name in de CYP3-clan, cruciaal is voor het ontwikkelen van een farmacogenomische resource ter verbetering van de weerstand van bijenpopulaties tegen pesticiden.
Deze studie presenteert hoogwaardige referentiegenomen voor vier cypriniforme vissoorten uit de zure veenmoerassen van Zuidoost-Azië, waarmee de genomische basis van extreme aanpassingen en lichaamsverkleining wordt onderzocht.
Deze studie presenteert een single-cell atlas van varken-aap nierxenotransplantatie die macrofaagchimerisme onthult en een door IFN-ε gecoördineerd immuun-niche identificeert dat graftbescherming bevordert.
Dit onderzoek introduceert een nieuw computationeel genomics-framework dat, door middel van ruimtelijke transcriptomics en cfDNA-analyse, de specifieke clonale dynamiek en micro-omgevingsinteracties bij zeldzame blaaskankervarianten in kaart brengt om hun agressieve aard en slechte prognose beter te begrijpen.
Dit onderzoek introduceert een theoretisch en experimenteel raamwerk dat lage-dekkingsequencing (Sparse-Seq) valideert als een nauwkeurige, kosteneffectieve en toegankelijke methode voor het kwantificeren van 5mC en 5hmC op genoomwijd niveau, waardoor grootschalige epigenetische studies mogelijk worden.
Deze studie presenteert twee nieuwe, geannoteerde transcriptoomassemblages voor de gewone pijlstaartinktvis (Sepia officinalis) onder verschillende blootstellingscondities aan metalen en pCO2, die waardevolle genomische bronnen bieden voor het bestuderen van de effecten van milieustress op deze soort.
Deze studie identificeert en kwantificeert barcode-crosstalk in Oxford Nanopore-sequencing en introduceert post-ligatie pooling (PLP) als een effectieve methode om dit probleem volledig te elimineren in plaats van alleen te mitigeren.
Dit onderzoek toont aan dat het toepassen van een 'sparse testing'-ontwerp in Miscanthus-veredeling de fenotyperingskosten met een factor vijf kan verlagen zonder in te leveren op de voorspellende nauwkeurigheid van de genoomselectie.
Deze studie concludeert dat multi-trait multi-environment genomische selectiemodellen de voorspellingsnauwkeurigheid voor complexe eigenschappen in Miscanthus sacchariflorus kunnen verbeteren, waardoor de veredelingsefficiëntie toeneemt, hoewel de prestaties variëren afhankelijk van het specifieke kenmerk.
Dit onderzoek, gebaseerd op het nieuwe T2T ENCODE-dataset, onthult dat transponerende elementen, met name SVA-elementen, een evolutionaire strijd aangaan met het menselijke genoom door te ontsnappen aan heterochromatinisatie (voornamelijk via H3K9me3) en zich geleidelijk te vestigen in CTCF-rijke regio's, wat bijdraagt aan genetische innovatie.