508 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Dit onderzoek biedt een geïntegreerd overzicht van de diversiteit in tRNA-genen en modificaties binnen de eukaryotische subfilum Saccharomycotina door middel van vergelijkende genomica en Nano-tRNAseq, waarbij wordt aangetoond dat lijn-specifieke verliezen van modificatie-enzymen correleren met afwezigheden in tRNA-sequentie-nucleotiden.
Dit onderzoek onthult dat de opmerkelijke levensduur en virusresistentie van *Myotis*-vleermuizen worden gedreven door pleiotrope aanpassingen, waarbij DNA-virussen positieve selectie op interactie-eiwitten veroorzaken en RNA-virussen kopieaantalvariatie, wat leidt tot verbeterde kankerresistentie en een unieke reactie op DNA-schade.
Dit artikel introduceert causarray, een robuust causaliteitsinference-framework dat ongemeten verstorende factoren corrigeert om causale genexpressie-effecten te onthullen in heterogene single-cell en bulk-genomische datasets, zoals aangetoond in studies naar autisme en de ziekte van Alzheimer.
Deze studie toont aan dat een celvrij systeem van Drosophila-embryo-extracten de spontane vorming van complexe chromatinestructuren, zoals TADs en lussen, kan reconstrueren en onthult dat de vorming van TADs bij de eve-locus niet door eenvoudige loop-extrusie, maar door directe Su(Hw)-gemedieerde paring van grenselementen wordt aangestuurd.
Dit onderzoek presenteert een hoogwaardig chromosoomschaal genoom van sacha inchi dat, gecombineerd met transcriptoomdata, de moleculaire mechanismen achter de hoge synthese van alfa-linoleenzuur en triacylglycerolaccumulatie in de zaden onthult.
Deze studie toont aan dat het integreren van weergegevens in genomische selectiemodellen voor Miscanthus sacchariflorus de voorspellende nauwkeurigheid behoudt terwijl de trainingsdata met tot 75% kan worden gereduceerd door gebruik te maken van milieucorrelaties.
Dit onderzoek combineert evolutionaire en diep leermethoden om schadelijke mutaties in suikerbieten te identificeren, waarbij wordt aangetoond dat hoewel domesticatie de genetische last verhoogde, de moderne veredeling gedurende meer dan een eeuw succesvol heeft geleid tot een afname van deze last en nieuwe kansen biedt voor precisie-veredeling.
Dit onderzoek onthult dat de geslachtsbepaling bij de invasieve zebra- en quaggamossel fundamenteel verschilt, waarbij de zebra-mossel een polygenetisch ZZ/ZW-systeem vertoont terwijl de quaggamossel een geconcentreerd XX/XY-systeem bezit met FoxL2-Y als nieuw mannelijk bepalend locus.
Dit artikel presenteert een chromosoom-niveau genoom van de C4-gras *Themeda triandra* dat hoge syntenie met sorghum onthult en genetische variatie blootlegt die gerelateerd is aan aanpassing aan diverse omgevingen, wat waardevolle inzichten biedt voor graslandbeheer en klimaatbestendigheid.
Dit onderzoek presenteert een hoog-resolutie, genoomwijd methylatiereferentiekader voor de volwassen zebravisforebrain, gegenereerd met Oxford Nanopore-sequencing, dat uitgebreide 5mC-methylering onthult maar beperkte niveaus van 5hmC, niet-CpG-methylering en 6mA.