509 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Dit onderzoek presenteert een hoogwaardig chromosoomschaal genoom van sacha inchi dat, gecombineerd met transcriptoomdata, de moleculaire mechanismen achter de hoge synthese van alfa-linoleenzuur en triacylglycerolaccumulatie in de zaden onthult.
Deze studie toont aan dat het integreren van weergegevens in genomische selectiemodellen voor Miscanthus sacchariflorus de voorspellende nauwkeurigheid behoudt terwijl de trainingsdata met tot 75% kan worden gereduceerd door gebruik te maken van milieucorrelaties.
Dit onderzoek combineert evolutionaire en diep leermethoden om schadelijke mutaties in suikerbieten te identificeren, waarbij wordt aangetoond dat hoewel domesticatie de genetische last verhoogde, de moderne veredeling gedurende meer dan een eeuw succesvol heeft geleid tot een afname van deze last en nieuwe kansen biedt voor precisie-veredeling.
Dit onderzoek onthult dat de geslachtsbepaling bij de invasieve zebra- en quaggamossel fundamenteel verschilt, waarbij de zebra-mossel een polygenetisch ZZ/ZW-systeem vertoont terwijl de quaggamossel een geconcentreerd XX/XY-systeem bezit met FoxL2-Y als nieuw mannelijk bepalend locus.
Dit artikel presenteert een chromosoom-niveau genoom van de C4-gras *Themeda triandra* dat hoge syntenie met sorghum onthult en genetische variatie blootlegt die gerelateerd is aan aanpassing aan diverse omgevingen, wat waardevolle inzichten biedt voor graslandbeheer en klimaatbestendigheid.
Dit onderzoek presenteert een hoog-resolutie, genoomwijd methylatiereferentiekader voor de volwassen zebravisforebrain, gegenereerd met Oxford Nanopore-sequencing, dat uitgebreide 5mC-methylering onthult maar beperkte niveaus van 5hmC, niet-CpG-methylering en 6mA.
Patches is een nieuw representatieleringskader voor scRNA-seq-data dat door middel van conditioneel subspace learning zowel gedeelde als condition-specifieke transcriptomische programma's in wondhelingsprocessen ontrafelt, zelfs bij complexe experimentele opzetten met ontbrekende data.
Deze studie introduceert een verbeterde methode voor Oxford Nanopore direct RNA-sequencing met behulp van het enzym UltraMarathonRT bij 30°C, wat leidt tot langere RNA-sequencingreads en nauwkeurigere isoformvoorspellingen door de hydrolyse van RNA-stranden bij hogere temperaturen te voorkomen.
Deze studie identificeert specifieke transcriptieprofielen voor de verschillende fasen van de *Pseudomonas aeruginosa*-biofilmcyclus en stelt veertien genen vast als biomarkers voor dispersie die kunnen worden gebruikt om het begin van dit proces te detecteren.
Deze studie introduceert een continu-lerend raamwerk dat een vergelijkbaar single-cell-atlas van colorectale kanker integreert met perturbatiegegevens om causale mechanismen te onthullen die celstaten en therapeutische responsen bepalen, waardoor een weg wordt gebaand naar gerichte behandelingen.