🧬 Category

genomics

502 papers

Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.

Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.

Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.

Improved deconvolution of circulating tumor DNA from ultra-low-pass whole-genome methylation sequencing using CelFiE-ISH

Deze studie toont aan dat het gebruik van het CelFiE-ISH-deconvolutiekader met een groter aantal restrictieve markers voor de epiteliale cellijn de detectiegrens voor circulerend tumor-DNA in ultra-laag-dekking whole-genome methylatiesequencing op het Oxford Nanopore-platform kan verlagen tot 1,7-3,1%, waarmee deze methode de prestaties van bestaande kopie-aantalveranderingsbenchmarks evenaart of overtreft.

Katsman, E., Isaac, S., Darwish, A., Maoz, M., Inbar, M., Marouani, M., Unterman, I., Gugenheim, A., Salaymeh, N., Abu Khdeir, S., Uziely, B., Peretz, T., Kaduri, L., Hubert, A., Cohen, J. E., Salah (…)2026-04-18🧬 genomics

Droplet-compatible single-cell DNA methylation sequencing with PreTIC

Deze studie introduceert PreTIC, een methode die volledige methylome-profilering van individuele cellen mogelijk maakt op een commercieel druppelplatform door conversiechemie te integreren met druppelmicrofluidica, waardoor duizenden methylomen uit gefixeerde bevroren cellen in slechts twee dagen kunnen worden gegenereerd.

Zhang, S., Wang, F., Zhang, Y., Lee, K.-J., Engman, C., He, H.-Z., Fan, Y., Zheng, S.-Y.2026-04-18🧬 genomics

Population structure and gene flow in the endangered Caribbean reef-building coral, Acropora palmata

Deze studie biedt een geüpdate genoomische analyse van de bedreigde koraalsoort *Acropora palmata* op basis van ruim 4000 monsters, waaruit blijkt dat de soort uit negen ruimtelijk gestructureerde genetische clusters bestaat die worden beïnvloed door zeestromingen, maar over het algemeen een wijdverspreide en uitgekruiste populatie vormt.

Baums, I. B., Locatelli, N. S., deLuca, K. L., Kitchen, S. A.2026-04-18🧬 genomics

Dynamic regulation of long non-coding RNAs across asexual andgametocyte development in Plasmodium falciparum

Dit onderzoek gebruikt geavanceerde sequencing-technieken om een uitgebreide kaart te maken van lang niet-coderend RNA in *Plasmodium falciparum*, waarbij wordt aangetoond dat deze moleculen specifiek tot expressie komen in gametocyten en een cruciale rol spelen in de regulatie van genexpressie tijdens de overdracht van het malaria-parasiet.

Gruenebast, J., Singhal, R., Olson, S., Bromley, R., Kanatani, S., Ko, K., Dunning Hotopp, J. C., Sinnis, P., Llinas, M., Serre, D.2026-04-18🧬 genomics

Genome sequencing and multi-stage, blood-feeding, and tissue-specific transcriptome atlas of the Rocky Mountain wood tick provide a critical resource for this vector

Dit onderzoek presenteert een referentiegenoom en een uitgebreide transcriptoomatlas van de Rocky Mountain-houten teek (*Dermacentor andersoni*), die cruciale inzichten biedt in de genetica van bloedvoeding en weefsel-specifieke expressie om strategieën voor ziektepreventie en vectorbestrijding te ontwikkelen.

Tompkin, J. E., Saelao, P., Kruczalak, J., Yeo, H., Olafson, P. U., Sim, S. B., Oyen, K., Kelley, M., Corpuz, R. L., Scheffler, B., Geib, S. M., Childers, A., Chen, X., Weirauch, M. T., Dergousoff, S. (…)2026-04-17🧬 genomics

Whole-genome 3D architectural screen reveals modulators of brain DNA structure

Dit onderzoek introduceert het Plate-C-platform, een hoogdoorvoersysteem dat duizenden hele genoomarchitecturen in één dag analyseert en zo de eerste chemische screen mogelijk maakt om te onthullen hoe diverse biologische paden de 3D-structuur van DNA in hersencellen beïnvloeden.

Parasar, B., Raja Venkatesh, A., Perera, J., Sosnick, L., Moghadami, S., Seo, Y., Shi, J., Chan, L., Takenawa, S., Akiyama, T., Sianto, O., Uenaka, T., Hadjipanayis, A., Wernig, M., Gitler, A. D., Tan (…)2026-04-17🧬 genomics

Comparing DNA extraction methods for successful PacBio HiFi sequencing: a case study of the freshwater mussel Anodonta anatina (Bivalvia: Unionidae)

Deze studie vergelijkt verschillende DNA-extractiemethoden voor de zoetwatermossel *Anodonta anatina* en concludeert dat hoewel PacBio Nanobind en CTAB het beste werken bij vers weefsel, de Omega Mollusc Kit een kosteneffectief en succesvol alternatief biedt voor flash-bevroren weefsel, waardoor het een praktische startpunt vormt voor genoomstudies bij mosselen.

Giulio, M., Lergster, U., Feulner, P. G. D., Weber, A. A.-T.2026-04-16🧬 genomics

Contrasting transcriptional responses and genetic determinants underlie Zymoseptoria tritici adaptation mechanisms to simulated host defense environments

Deze studie onthult dat *Zymoseptoria tritici* zich aanpast aan gesimuleerde gastherenverdedigingsomgevingen door zowel gedeelde als omgevings-specifieke transcriptiereacties en genetische loci die betrokken zijn bij processen zoals celwandhermodellering en proteostase.

Minana-Posada, S., Feurtey, A., McDonald, B. A., Lorrain, C.2026-04-16🧬 genomics