🧬 Category

genomics

345 papers

Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.

Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.

Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.

🧬 genomics

Genetic architecture of soluble arabinoxylan fibre in elite genotypes of bread wheat revealed by genome-wide association analysis

Deze studie maakte gebruik van een genoombrede associatieanalyse op 384 elite Britse tarwegenotypes om zeven genetische loci te identificeren, waaronder belangrijke stabiele effecten op chromosomen 1B en 6B, die het gehalte aan waterextracteerbare arabinoxylan reguleren, waarmee wordt aangetoond dat het stapelen van gunstige allelen binnen bestaand kiemplasma een praktische strategie biedt voor de veredeling van tarwe met een verhoogd dieetvezelgehalte.

Alabdullah, A. K., Kosik, O., Leverington-Waite, M., Mitchell, R. A., Prins, A., Brett, J., Griffths, S., Shewry, P. R. (…)2026-07-24
🧬 genomics

TRIM28 preserves ovarian identity by stabilising lineage-specific transcription factor hubs

Deze studie onthult dat TRIM28 de identiteit van ovariële cellen primair behoudt door te fungeren als een transcriptionele co-regulator die lijn-specifieke transcriptiefactorhubs (zoals FOXL2 en NR5A2) stabiliseert via SUMOylering, in plaats van door het in stand houden van H3K9me3-afhankelijke heterochromatine.

Sitkiewicz, L., Chaleil, F., Granes, G., Rossitto, M., Dejardin, S., Cammas, F., Lefrancois-Martinez, A.-M., Stevant, I. (…)2026-07-24
🧬 genomics

Multidimensional variation and population stratification across 8000 complete human centromeres

Deze studie construeert een uitgebreide multidimensionale kaart van genetische variatie van meer dan 8.000 volledige menselijke centromeren door diverse genoomassemblages te integreren, waarbij uitgebreide structurele diversiteit, populatiestratificatie en een tweesporen-evolatiemodel wordt onthuld dat structurele innovatie balanceert met mutationele beperking, terwijl het een cruciale bron biedt voor het begrijpen van centromeerbiologie en geassocieerde stoornissen.

Sun, Y., Wan, S., Nie, L., Yu, D., Zhou, F., Yang, Y., Yang, X., Liu, A., Chen, Q., Fu, K., Ni, Q., He, Y., Su, B., Mao (…)2026-07-24
🧬 genomics

An updated assessment of the genomic health of Odocoileus

Deze studie maakt gebruik van genoombrede gegevens om de eerste schattingen van de genetische belasting bij gevederde herten te bieden en geactualiseerde beoordelingen van runs-of-homozygosity voor witte staart herten te geven, waarbij een verhoogde inteelt bij Key-herten en een toegenomen genetische belasting in populaties van gevederde herten in de Pacific Northwest worden onthuld als gevolg van historische flessenhalzen.

Cars, B., Shafer, A.2026-07-23
🧬 genomics

Perturb-seq resolves physiologic programs and bidirectional regulation of non-canonical NF-κB signaling in epidermal organoids

Deze studie maakt gebruik van Perturb-seq in een fysiologisch relevant epidermaal organoïdmodel om genetische drijfveren van keratinocytdifferentiatie te ontdekken en de bidirectionele rol van niet-canonieke NF-κB-signalering in late differentiatie te onthullen, waarbij de beperkingen van eerdere op 2D-cultuur gebaseerde screens worden overwonnen.

Squiers, G., Nanes, B. A., Balas, M., Lingo, J. J., Wang, L., Zhou, H., Munawar, S., Nzima, M., Hon, G. C., Klein, J.2026-07-23
🧬 genomics

Integrating epigenomic features reveals principles of chromatin-state organization

Door genoombrede epigenomische profielen te integreren, identificeert deze studie vijf hoofdchromatinetoestanden en onthult zij dat celtype-specifieke verschillen primair worden gedreven door de remodeling van Polycomb-geassocieerd chromatine, terwijl CTCF-geassocieerd chromatine dient als een cruciale architecturale anker die de chromatinestructuur verbindt met de driedimensionale genomische structuur.

Martini, J., Williams, R. A., Smith, R. G., Zhou, Y., Liu, Y.2026-07-23
🧬 genomics

Allele-specific chromatin modifications of HPV-associated extrachromosomal DNAs in cervical cancer

Deze studie onthult dat HPV-menselijke hybride extrachromosomale DNA's in baarmoederhalskanker een onderscheidende, allelspecifieke epigenetische landschappen vertonen met hogere dichtheden van actieve regulatoire elementen vergeleken met mens-alleen ecDNA's, wat benadrukt hoe HPV-integratie de regulatoire architectuur van deze kanker-drijvende circulaire structuren vormgeeft.

MacLennan, S., Ng, M., Porter, V. L., Corbett, R. D., Pandoh, P., Trinh-Hamilton, D., Coope, R., Zhao, Y., Marra, M. A.2026-07-20
🧬 genomics

Lifestyles of Gypsy-family transposons shape their regulatory mechanisms

Door de sequenties van LTR-retrotransposons over 249 drosophilide genomen te analyseren, onthult deze studie complexe interspecies evolutionaire patronen van Gypsy-familie-elementen, waarbij wordt benadrukt hoe het verlies of de inactivatie van het Envelope-eiwit en de stabiliteit van sORF2 verschuivingen in weefselspecifieke expressie en co-evolutie met gastheer-transcriptiecontrolemechanismen aansturen.

Papameletiou, A.-M., Czech Nicholson, B., Bornelöv, S., Hannon, G. J.2026-07-18