346 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Dit onderzoek gebruikt een pangenoom van vijf hoogwaardige Simmentalse rinderassemblages, waaronder halfbroers, om recombinatie-evenementen op basispaarniveau te identificeren via structurele varianten en DNA-methylering, wat een waardevolle aanvulling biedt op traditionele SNP-gebaseerde methoden.
Dit onderzoek toont aan dat de evolutie en populatiestructuur van de bacteriële bladvlekziekteverwekker Xanthomonas oryzae pv. oryzae in Afrika sterk is gevormd door de overgang van de lokaal gedomesticeerde rijstsoort Oryza glaberrima naar de geïntroduceerde Aziatische rijst Oryza sativa.
Dit onderzoek toont aan dat ultra-geconserveerde CpG-dinucleotiden in het menselijk genoom verrijkt zijn in ontwikkelings- en verouderingsgerichte genen, met name in de hersenen, wat suggereert dat functionele componenten van DNA-methylatie-gerelateerde veroudering nauw verweven zijn met ontwikkelingspaden.
Dit onderzoek toont aan dat donor-specifieke assemblages de detectie van somatische structurele varianten in complexe genoomregio's aanzienlijk verbeteren ten opzichte van lineaire referentiegenomen.
Dit onderzoek onthult hoe Ovate Family Proteins (OFPs) in de Rosaceae-fruitsoorten perzik en appel, via interacties met brassinosteroïden en microtubuli, de variatie in vruchtvorm van plat tot langwerpig reguleren, wat een nieuwe basis biedt voor veredeling.
Dit onderzoek toont aan dat nanopore-sequencing aanzienlijke genomische en methylatieverschillen, waaronder allelspecifieke veranderingen in kankerdrivergenen en transposabele elementen, blootlegt tussen twee MCF-7 sublijnen, wat de noodzaak onderstreept van nauwkeurige karakterisering van cellijnen voor kankeronderzoek.
Dit artikel beschrijft hoe gemeenschapscuratie van het *Pristionchus pacificus*-genoom, ondersteund door nieuwe transcriptoomdata, meer dan 7.500 genmodellen corrigeerde en zo veelvoorkomende annotatiefouten in kaart bracht die ook voor andere soorten relevant zijn.
Dit onderzoek analyseerde de droogterespons in een inter-specifiek tomatenpopulatie (ToMAGIC) door middel van fenotypische evaluatie en genomische associatiestudies, waardoor 15 significante genomische regio's werden geïdentificeerd en superieure transgressieve lijnen met verhoogde droogtetolerantie werden geselecteerd voor veredeling.
Dit onderzoek toont aan dat het Minimum Description Length-principe, gecombineerd met maximale parsimonie, een fundamenteel principe onthult dat de schaalverhouding tussen regulatorische architectuur, weefsel-specificiteit en evolutionaire leeftijd van genen in de menselijke genoomregulatie verklaart.
Dit onderzoek toont aan dat de evolutionaire geschiedenis en verspreiding van de bacteriële brandziekteverwekker *Xanthomonas oryzae* pv. *oryzae* in Azië nauw samenvallen met de domesticatie en migratiegeschiedenis van rijst, waarbij drie genetische lijnen ontstonden in domesticatiecentra en zich via landbouw- en handelsroutes verspreidden.