398 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Deze studie introduceert SNACKKSS, een geautomatiseerd systeem dat transcriptomische data en biomedische literatuur combineert om effectieve geneesmiddelen te identificeren die gen-deficiënties of -overproductie kunnen tegengaan, terwijl het ook waarschuwt voor inconsistente resultaten van complexe machinelearning-modellen op verschillende hardware.
HiFi-Helper is een gebruiksvriendelijke Snakemake-workflow die reproducible genoomassemblage uit HiFi-lecturen mogelijk maakt door visuele feedback te bieden voor parameteroptimalisatie, waardoor hoogwaardige genoomassemblages tegen lagere kosten en tijdsinvestering bereikbaar worden.
Deze studie introduceert een BRET-assay voor het meten van de telomeerlengte in levende *S. cerevisiae*-cellen, waarbij de energieoverdracht tussen een luciferase-Rif2-fusie en fluorescentie-gemarkeerd Rap1 een sterke correlatie vertoont met de telomeerlengte zoals vastgesteld via lang-lees sequencing.
Deze studie presenteert een hoogwaardige genoomassemblage van een Chileense *Tigriopus*-populatie, die waarschijnlijk een nieuwe soort (*Tigriopus aff. angulatus*) vertegenwoordigt, en levert waardevolle genetische bronnen voor het bestuderen van adaptatie en diversiteit binnen deze copepod-groep.
Ondanks dat transcriptoomvariatie in wilde *Arabidopsis thaliana*-populaties sterk afhankelijk is van individuele omstandigheden en niet volledig overeenkomt met laboratoriumstresspatronen, blijken biotische responsnetwerken evolutionair behouden te zijn, terwijl abiotische netwerken in de natuur aanzienlijk worden herorganiseerd.
Deze studie introduceert een datasetbewust kader om recurrente artefacten in SARS-CoV-2 diepsequencingdata te identificeren en maskeren, waardoor de betrouwbaarheid van afgeleide binnen-huis diversiteit en transmissie-inferenties aanzienlijk verbetert.
Deze studie toont aan dat in Arabidopsis thaliana de positie van de eerste intron en het totale aantal introns voorspellend zijn voor respectievelijk actieve chromatinemarkeringen bij het transcriptiestartpunt en de accumulatie van genlichaam-geassocieerde chromatinestructuren, wat suggereert dat intron-architectuur via twee verschillende mechanismen de genexpressie beïnvloedt.
Dit artikel beschrijft de generatie en karakterisering van een volledig, gepersonaliseerd genoom voor de KOLF2.1J iPSC-referentielijn, wat leidt tot nauwkeurigere genomische analyses en een waardevol basispunt voor toekomstig onderzoek naar neurodegeneratieve ziekten.
Deze studie toont aan dat aanhoudend SARS-CoV-2 Spike-antigeen in de darmweefsels van Long COVID-patiënten geassocieerd is met lokale immuundysregulatie en een pro-inflammatoire transcriptieprofiel, wat suggereert dat het virus de chronische symptomen in de colon activeert.
Deze studie presenteert een hoogwaardig, chromosoomniveau genoom van de Zuid-Afrikaanse leeuw, gegenereerd met PacBio HiFi en Omni-C-technologieën, dat dient als cruciale genetische basis voor toekomstige populatiegenomische en behoudsinspanningen.