510 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Dit onderzoek toont aan dat de 10X Genomics GEM-X Flex-assay, in combinatie met het 'chop-fix'-protocol, superieure transcriptomische data levert voor gefixeerd weefsel en FFPE-blokken vergeleken met bestaande methoden, waardoor het een robuuste oplossing biedt voor single-cell sequencing in klinische trials.
Dit onderzoek gebruikt PacBio HiFi-long-read sequencing bij een groot familiepedigree om te onthullen dat tandemrepeat-mutagenese wordt beïnvloed door factoren zoals locuslengte, motif-integriteit, heterozygositeit en de leeftijd van de vader, terwijl het ook hypermutabele loci identificeert die worden gestuurd door subtiele verschillen in motiefsamenstelling.
Dit artikel presenteert een hoogwaardige, chromosoomspecifieke genoomassemblage en annotatie van de parthenogenetische nematode *Acrobeloides nanus*, die als waardevol referentiekader dient voor het bestuderen van zijn unieke voortplanting, extreme droogtetolerantie en evolutionaire kenmerken.
De auteurs hebben het iMAP-CRISPR-platform geoptimaliseerd om recombination bias te elimineren, waardoor ze in muisweefsels een uitgebreid en nauwkeurig profiel van weefsel-specifieke RNA-modificatiefactoren konden opstellen en therapeutische doelwitten voor kankerbehandeling konden identificeren.
Ondanks dat de uiterst kleine populatie van de Eolische muurhagedis de laagste ooit waargenomen genomische variatie vertoont, is de realiserde genetische last vergelijkbaar met die van een grotere populatie, wat suggereert dat soorten met ernstige bottlenecks lang kunnen overleven zolang de last van schadelijke mutaties binnen aanvaardbare grenzen blijft.
Dit onderzoek onthult dat een groot deel van de menselijke C2H2-zinkvinger-eiwitten uitgebreide interacties aangaat en significant verrijkt is op de ankers van chromosomale lussen, wat een cruciale rol suggereert in de organisatie van het genoom en de regulatie van genexpressie.
Dit onderzoek onthult dat de onsterfelijkheid van *Hydra vulgaris* niet wordt veroorzaakt door de aanwezigheid van klassieke anti-verouderingsgenen, maar door unieke metabole strategieën en een specifiek patroon van genverlies en epigenetische stabiliteit in vergelijking met de verouderende *Hydra oligactis*.
Dit onderzoek biedt een uitgebreid profiel van genetische, expressie- en regulatorische patronen van ouderlijke allelen in de ZW-systeem van de muskuseend door middel van haplotype-resolvene genoomassemblages, wat nieuwe inzichten biedt in heterosis en de genregulatie op het geslachtschromosoom Z.
Deze studie presenteert voor het eerst het volledige chloroplastgenoom van de inheemse Filipijnse vrucht Garcinia binucao, inclusief de genoomstructuur, genannotatie en fylogenetische analyse, om toekomstig onderzoek naar conservatie en genetisch gebruik te faciliteren.
Dit artikel introduceert FX-seq, een schaalbare single-nucleus RNA-sequencingmethode die organokatalysatoren en Pt(II)-crosslinking gebruikt om de analyse van zwaar gefixeerd en FFPE-materiaal mogelijk te maken door reverse-transcriptie-opbrengsten te verhogen en RNA-lekkage te voorkomen.