398 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Dit onderzoek schat de retrotranspositie-rates van LINE-1 en SINEC-elementen bij honden in door genoomassemblages te vergelijken, waarbij wordt geconcludeerd dat hoewel deze elementen belangrijke drijvers zijn van de canine genoomdiversiteit, de hoge mate van dimorfisme voornamelijk het gevolg is van langdurige genetische variatie in plaats van recente, snelle mutaties.
Dit onderzoek integreert ATAC-seq, molQTL en GWAS-data om te tonen dat chromatinetoegankelijkheid in varkensspier zich tijdens de ontwikkeling verschuift van prenatale transcriptiepriming naar postnatale regulatie, waardoor specifieke causale regulatorische varianten voor agronomische eigenschappen kunnen worden geïdentificeerd.
Deze studie valideert een geoptimaliseerde methode om nauwkeurige genomische datasets van individuele haakworm-larven te genereren, waardoor de genetische diversiteit en populatiestructuur van zowel laboratorium- als veldstammen effectief kunnen worden vergeleken om de bestrijding van deze verwaarloosde tropische ziekte te verbeteren.
Dit onderzoek gebruikt een pangenoom van vijf hoogwaardige Simmentalse rinderassemblages, waaronder halfbroers, om recombinatie-evenementen op basispaarniveau te identificeren via structurele varianten en DNA-methylering, wat een waardevolle aanvulling biedt op traditionele SNP-gebaseerde methoden.
Dit onderzoek toont aan dat de evolutie en populatiestructuur van de bacteriële bladvlekziekteverwekker Xanthomonas oryzae pv. oryzae in Afrika sterk is gevormd door de overgang van de lokaal gedomesticeerde rijstsoort Oryza glaberrima naar de geïntroduceerde Aziatische rijst Oryza sativa.
Dit onderzoek toont aan dat ultra-geconserveerde CpG-dinucleotiden in het menselijk genoom verrijkt zijn in ontwikkelings- en verouderingsgerichte genen, met name in de hersenen, wat suggereert dat functionele componenten van DNA-methylatie-gerelateerde veroudering nauw verweven zijn met ontwikkelingspaden.
Dit onderzoek toont aan dat donor-specifieke assemblages de detectie van somatische structurele varianten in complexe genoomregio's aanzienlijk verbeteren ten opzichte van lineaire referentiegenomen.
Dit onderzoek onthult hoe Ovate Family Proteins (OFPs) in de Rosaceae-fruitsoorten perzik en appel, via interacties met brassinosteroïden en microtubuli, de variatie in vruchtvorm van plat tot langwerpig reguleren, wat een nieuwe basis biedt voor veredeling.
Dit onderzoek toont aan dat nanopore-sequencing aanzienlijke genomische en methylatieverschillen, waaronder allelspecifieke veranderingen in kankerdrivergenen en transposabele elementen, blootlegt tussen twee MCF-7 sublijnen, wat de noodzaak onderstreept van nauwkeurige karakterisering van cellijnen voor kankeronderzoek.
Dit artikel beschrijft hoe gemeenschapscuratie van het *Pristionchus pacificus*-genoom, ondersteund door nieuwe transcriptoomdata, meer dan 7.500 genmodellen corrigeerde en zo veelvoorkomende annotatiefouten in kaart bracht die ook voor andere soorten relevant zijn.