510 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Dit onderzoek schetst een unificerend ontwikkelingskader voor DNA-methylatie door te tonen hoe genetische variatie via verstoring van transcriptiefactorbinding de epigenetische programmering in zowel muis als mens beïnvloedt, waardoor een cruciale link wordt gelegd tussen genetica, methylatie en transcriptie over verschillende weefsels en ontwikkelingsstadia heen.
GALA is een uniek, landmark-vrij framework dat genetische algoritmen en lokale diffeomorfische vervorming combineert om ruimtelijke transcriptoomdata van verschillende resoluties en modaliteiten nauwkeurig en efficiënt uit te lijnen, zelfs bij gedeeltelijke weefseldekking.
Dit onderzoek toont aan dat transponeerbare elementen een sleutelrol spelen in de evolutie en diversificatie van de genoomgrootte en aanpassingen van Peltigerales-lichen-symbionten, zoals onthuld door lang-lezen metagenoomsequencing en transcriptomica.
Deze studie introduceert een schaalbaar, modality-agnostisch AAV-platform voor *in vivo* mosaïekscreening dat, gekoppeld aan een geanalyseerd raamwerk voor menselijke ziektesignaturen, effectieve therapeutische doelen identificeert door genfuncties in native weefselarchitecturen van diverse soorten te testen en deze resultaten te valideren in humane ex vivo-modellen.
Dit onderzoek toont aan dat gamma-straling succesvol nieuwe genetische variaties in Europese peren kan induceren, waarbij pangenoom-gebaseerde Nanopore-sequencing een breed scala aan mutaties onthulde die potentieel waardevol zijn voor de ontwikkeling van nieuwe onderstammen.
Deze studie onthult dat tandemherhalingen, door middel van een geavanceerde multi-omics analyse van meer dan 5,4 miljoen immuuncellen, cruciale, celtype-specifieke regulerende effecten hebben op genexpressie en bijdragen aan de complexiteit van immuun- en hematologische eigenschappen.
Deze studie toont aan dat genomische selectie voor zaaizaagopbrengst in vlas een praktische en kostenefficiënte strategie is die, mits gebaseerd op een goed samengestelde fokpopulatie, de veldtestkosten aanzienlijk verlaagt en de selectie-efficiëntie in fokprogramma's verbetert.
Deze studie presenteert een consensus-genoom van de sociale amoebe *Dictyostelium giganteum*, afgeleid van zes stammen uit India, dat de genoomarchitectuur, de evolutionaire conservatie van signaal- en cytoskeletmodules, en de unieke genetische kenmerken van deze soort in kaart brengt.
Dit artikel beschrijft iCLIP3, een gestroomlijnd en niet-radioactief protocol dat gebruikmaakt van infraroodvisualisatie, silicacolumns en unieke dual-indexing om interacties tussen RNA-bindende eiwitten en RNA met single-nucleotide-resolutie af te beelden vanuit zeer kleine hoeveelheden celmateriaal.
Dit artikel introduceert UTOPIA, een modelonafhankelijk kader voor multischaal betrouwbaarheidskwantificatie dat statistisch gekalibreerde scores toekent aan voorspellingen van virtuele ruimtelijke transcriptomics om valse ontdekkingen te beperken en de interpretatie van biologische conclusies op verschillende resoluties te verbeteren.