510 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Dit onderzoek introduceert een nieuwe workflow voor de *de novo* identificatie van niet-autonome LTR-retrotransposons in suikerbiet, waarbij wordt aangetoond dat bestaande methoden een groot deel van deze genetische diversiteit missen en dat deze elementen vaak langer en complexer zijn dan eerder gedacht.
Deze studie analyseerde bijna 600.000 cellen in verschillende hersengebieden en onthulde dat opioidenmisbruik en HIV specifieke, soms versterkende effecten hebben op metabole en immuunprocessen in neuronale en gliale cellen, waarbij cerebellaire celtypen een unieke gevoeligheid voor opioiden vertonen.
Dit artikel introduceert een contrastief leerframework dat single-cell RNA-sequencing-data gebruikt om genen te identificeren die hun expressie onafhankelijk van kopieaantalvariaties handhaven, waardoor nieuwe therapeutische doelwitten voor kanker worden blootgelegd.
Dit onderzoek onthult schaalwetten die aantonen dat de evolutie van complexe multicellulariteit gepaard gaat met een saturatie van coderend DNA en een dominante expansie van niet-coderende sequenties, waardoor het genoom wordt herschikt zonder een evenredige toename van genen.
Het ROME-pilotproject in Frankrijk (2020–2023) heeft een eDNA-observatienetwerk in vier kustgebieden met oesterteelt opgezet om onder het One Health-kader de invloed van rivierafvoer op het microbiome te bestuderen en pathogenen en schadelijke algenbloei effectiever te detecteren voor de bescherming van mens, oester en milieu.
Deze studie analyseert 37.970 *Streptococcus agalactiae*-genomen uit de BakRep-repository om een globaal epidemiologisch beeld te schetsen van de populatiestructuur, virulentiefactoren en antibioticaresistentie, waarbij wordt benadrukt dat verbeterde en gestructureerde metadata essentieel zijn voor een volledige interpretatie van de data.
Deze studie presenteert het eerste transcript-resolved referentiecatalogus van menselijke enhancer-RNAs (eRNAs), bestaande uit 36.536 transcripten die cellulaire specificiteit, subcellulaire lokalisatie en ziekterelateerde variatie in splicing onthullen, en biedt hiermee een nieuwe basis voor functioneel onderzoek via de eRNAkit-database.
Dit onderzoek toont aan dat de functioneel geconserveerde DNA- en RNA-bindende transcriptiefactor CLAMP co-transcriptionele splicing nauwkeurig reguleert door via zijn prion-achtige domein te interageren met specifieke RNA-moleculen en de dynamiek van splicingfactoren te moduleren, waardoor geslachtspecifieke transcriptdiversiteit wordt gegenereerd en foutieve splicing wordt voorkomen.
Dit artikel introduceert TranslAGE, een openbaar online platform dat 179 DNA-methylatiedatasets harmoniseert en een gestandaardiseerd STAR-framework biedt om epigenetische verouderingsbiomarkers systematisch te valideren en te vergelijken voor klinische toepassing.
Deze studie presenteert een hoogwaardig pangenoom van de graanamarant-soortencomplex dat, door middel van chromosoom-schaal assemblages en analyse van structurele variatie, inzicht verschaft in de genetica van domesticatie en bloeitijdregulatie voor veredeling.