511 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Deze studie toont aan dat klassieke niet-parametrische schattingstechnieken effectiever zijn dan modelgebaseerde benaderingen om de hoeveelheid onontdekte bacteriofagensoorten te voorspellen en zo de isolatie van nieuwe virussen voor de bestrijding van antibioticaresistente bacteriën te optimaliseren.
Dit onderzoek onthult via genoomanalyse van historische kruisingen dat de metabolische DDT-resistentie in Oost-Afrikaanse *Anopheles gambiae*-muggen, die vrij was van kdr-mutaties, voornamelijk wordt gedreven door selectie op het GSTe-gengencluster op chromosoom 3R, wat de basis vormt voor de huidige vectorbestrijdingsproblemen.
Dit onderzoek toont aan dat *Mycobacterium bovis* de epigenoom van boviene alveolaire macrofagen ingrijpend en specifiek herprogrammeert in vergelijking met andere *M. tuberculosis*-complex-bacteriën, wat nieuwe inzichten biedt in de pathogenese en potentiële doelen voor veredeling van resistentie tegen boviene tuberculose.
Deze studie introduceert OneCell CUT&Tag, een methode die het mogelijk maakt om chromatinestaten, transcriptomen en oppervlaktemerkers in één enkele cel te koppelen, waardoor epigenetische herprogrammering tijdens de overgang van basale naar lumenale cellen in de melkklier met hoge resolutie kan worden ontrafeld.
Dit onderzoek schetst een vergelijkbaar atlas van RNA-bindende eiwitten in 33 Leishmania-stammen om hun rol in post-transcriptionele regulatie, levenscyclusontwikkeling, stressrespons en antimonium-resistentie te ontrafelen, waardoor een raamwerk wordt geboden om aanpassingsmechanismen van deze parasieten te prioriteren.
Dit artikel introduceert commonPeak, een statistisch framework dat ChIP-seq-gegevens analyseert om gedeelde pieken te identificeren en te testen of hun verrijking tussen verschillende condities en protocollen equivalent is, wat essentieel is voor protocolvalidatie en het onderscheiden van behoudende van condition-specifieke biologische programma's.
Dit artikel beschrijft het genoom van Pavonine herpesvirus 1 (PaHv1), een nieuw, waarschijnlijk niet-oncogeen lid van het geslacht Mardivirus dat papegaaien infecteert en zich onderscheidt van het kippenpokkenvirus door het ontbreken van specifieke oncogene genen.
Dit artikel presenteert het genoom van *Digitalis purpurea*, waarbij een grote insertie in het *anthocyanidinesynthase*-gen verantwoordelijk wordt geacht voor het verlies van anthocyaninepigmentatie bij witte bloemen en een insertie in het *DpTFL1/CEN*-gen voor de ontwikkeling van grote terminale bloemen.
Dit onderzoek onthult dat antenomevenen zich niet uit één enkel voorouderlijk gen hebben ontwikkeld, maar door herhaaldelijk gebruik van drie specifieke genomische hotspots, waarbij ecologische niches de balans tussen genbehoud, duplicatie en nieuwe werving bepalen.
Deze studie onthult dat alleelspecifiek alternatief polyadenyleren (asAPA), gereguleerd door RNA-bindende eiwitten zoals FMRP, een cruciaal mechanisme vormt dat niet-coderende genetische variatie koppelt aan de transcriptiestructuur en zo het risico op neurodegeneratieve en neurodevelopmentale aandoeningen, waaronder de ziekte van Alzheimer, verklaart.