🧬 biology

Synthetic Phenotype Assisted Linear Mixed Models Improve Proteome-Wide Genetic Discovery in Incomplete Biobank Data

Het artikel introduceert Syn-PALM, een robuust en schaalbaar lineair gemengd model-framework dat gebruikmaakt van door machine learning voorspelde synthetische proteomische data om de statistische kracht en genetische ontdekking in genoombrede associatiestudies aanzienlijk te vergroten, ondanks substantiële ontbrekende gegevens in biobank-datasets.

Xihong Lin, Haoyu Yang, Ruoyu Wang, Shuang Song2026-07-30
🧬 biology

Interaction-Token Structural Alignment (ITSA): An Interpretable Framework for Protein Similarity Based on Residue-Level Chemical Interactions

Het artikel introduceert Interaction-Token Structural Alignment (ITSA), een interpreteerbaar raamwerk dat eiwitstructuren omzet in residu-niveau biochemische interactietokens voor lokale uitlijning, waarmee de effectiviteit ervan wordt aangetoond in het vastleggen van familie-niveau gelijkenis en het behouden van mechanistische context waar traditionele geometrie-georiënteerde methoden tekortschieten.

Samanyu Kulkarni, Ranjita Thapa2026-07-30
🧬 biology

Transforming MRI volumes with Space-Filling Curves reveals Multifractal Signatures of Ageing and Dementia Progression

Deze studie introduceert Multifractal Space-filling Curve Analysis (MFSCA) om aan te tonen dat de ruimtelijke organisatie van hersenstructuren, gemeten door multifractaliteit in MRI-data, met de voortgang van de leeftijd en de progressie van dementie progressief verslechtert van een complexe, heterogene staat naar een eenvoudigere, homogene staat.

Marta Lotka, Jacek Grela, Zbigniew Drogosz, Jeremi K Ochab, Paweł Oświęcimka2026-07-30
🧬 biology

Exploring ubiquitination-related biomarkers in osteoarthritis based on single-cell and transcriptomic data

Deze studie integreert single-cell en bulk transcriptomische data om vijf ubiquitinatie-gerelateerde biomarkers (MYC, TLR7, CX3CR1, PER1 en GADD45B) te identificeren die betrokken zijn bij de pathogenese van artrose, waarbij wordt onthuld dat zij verrijkt zijn in de TNF-alfa/NF-kappaB-route, geassocieerd zijn met specifieke immuuncelpopulaties en een verhoogde expressie vertonen in synoviale fibroblasten, waardoor zij nieuwe therapeutische doelwitten voor de ziekte bieden.

Tian Lan, Huan Dai, DeGuang Li, ChongYu Zhao, XiaoYu Mu, Li Li, Chao Wang2026-07-30
🧬 biology

Transformed Callus of Panax vietnamensis: Promising In Vitro Platform for Majonoside R2 Production alongside Hairy Roots

Deze studie toont aan dat door *Agrobacterium rhizogenes*-geïnduceerde getransformeerde callus van *Panax vietnamensis* dient als een stabiel, hormoonvrij en hoogproductief alternatief voor haarwortels voor de duurzame in vitro productie van het zeldzame saponine majonoside R2, met name wanneer dit wordt versterkt door MeJA-elicitatie.

HUYEN TRAN, THI QUY TRAN, HongIk Yoon, Hei Chan Lee2026-07-30
🧬 biology

Polarity-Registered Nuclear Mapping Reveals Discrete Topological Classes of Chromosome Organization

Deze studie introduceert een op polariteit geregistreerd nucleair coördinatenstelsel dat de nucleaire geometrie normaliseert om discrete, reproduceerbare topologische klassen van chromosomale organisatie in humane mesenchymale stamcellen te onthullen, waarmee wordt aangetoond dat mechanische en polariteitsbeperkingen asymmetrische, homolog-specifieke ruimtelijke gedragingen aansturen.

Paolo Netti, Luca Messina, Carlo Natale2026-07-30
🧬 biology

BMP9 Promotes Hepatocellular Carcinoma Progression By Accelerating Cell Cycle through CKS1B Lactylation

Deze studie onthult dat verhoogde BMP9-expressie de progressie van hepatocellulair carcinoom aanjaagt door CKS1B-K4-lactylering te bevorderen, wat de interactie tussen CKS1B en CDK1–3 versterkt en de afbraak van p27 faciliteert om de celcyclusprogressie te versnellen.

Hong Tang, Han Chen, Jianhao li, Ying-Yi Li, Mingming Zhang, Jiayi Wang, Xia Zhu, Weixiu Li, Junpeng Zhou, Xiangnan Teng (…)2026-07-30
🧬 biology

FuncDECODE Resolves Cell-Type-Specific Functional Heterogeneity across Biological States and Spatial Contexts

FuncDECODE is een computationeel framework dat gebruikmaakt van single-cell referenties om gemengde bulk- en ruimtelijke transcriptomische data te deconvolueren, waardoor identificatie van celtype-specifieke functionele programma-remodellering over diverse biologische toestanden, ziektecontexten en ruimtelijke weefselarchitecturen mogelijk wordt gemaakt.

Yadong Wang, Renjie Liu, Tianyi Zhao2026-07-30
🧬 biology

Malaria parasites coordinate host cell remodeling through the AP2-HCR DNA-binding protein

Deze studie identificeert PfAP2-HCR als een essentiële ApiAP2-transcriptiefactor in *Plasmodium falciparum* die de remodelering van de gastheercel orkestreert door direct de expressie van sleutel-geëxporteerde eiwitten te reguleren, waardoor het overleven, de ontwikkeling en de transmissie van de parasiet tijdens zowel de aseksuele als seksuele bloedstadia wordt gewaarborgd.

Arnab Pain, Amit Subudhi, Dhiviya Vedagiri, Sara Mfarrej, Reem Abu-Shamma, Rohit Satyam, Rahul Salunke, Di Liu, Maya Aya (…)2026-07-30