🧬 Category

q-bio

1498 papers

🧬 biology

Mutation-induced conformational remodeling explains gain- and loss-of-function phenotypes in Euglena gracilis phytoene synthase

Deze studie maakt gebruik van moleculaire dynamica-simulaties om aan te tonen dat gain- en loss-of-function-mutaties in *Euglena gracilis*-fytoënsynthase de carotenoïdenproductie veranderen door het induceren van een onderscheidende conformationele hermodellering van de energielandschappen, residu-mobiliteit en de architectuur van het actieve centrum van het enzym.

Toto Subroto, Rega Saputra2026-07-02
🧬 biology

Evolution and Regulatory Roles of the KNOX Gene Family in Eucommia ulmoides in Response to Phytohormones and Abiotic Stresses

Deze studie identificeert en karakteriseert systematisch de acht KNOX-genen in *Eucommia ulmoides*, waarbij de fylogenetische classificatie, weefselspecifieke expressiepatronen en de onderscheidende regulerende rollen in de ontwikkeling en reacties op diverse fytohormonen en abiotische stressfactoren worden onthuld.

Jun LIU, Lili WANG, Tingting CHENG, Pei Lixin, DU Qingxin, LIAN Conglong, LAN Jinxu, FENG Weimeng, YANG Jingfan, Jiefeng (…)2026-07-02
🧬 biology

Computational Characterization of a Hypothetical Protein from the Jumbo Phage vB_Pae3705-KEN49 Targeting Multidrug-Resistant Pseudomonas aeruginosa

Deze studie maakt gebruik van een uitgebreide computationele workflow om WWV93726.1 te karakteriseren, een geconserveerd hypothetisch eiwit uit de jumbofaag vB_Pae3705-KEN49, waarbij het wordt geïdentificeerd als een niet-canonieke, bimodulaire DNA-bindende regulatoire eiwit die waarschijnlijk de overgang van faagtranscriptie naar assemblage reguleert door middel van een elektrostatisch gedreven interactie met virale promotorsequenties.

Meshack Tweya Omwega, Moses Gachoya, Justin Nyasinga, Martin Georges, James Wachira, Collins Kigen, Eric Omori Omwenga (…)2026-07-02
🧬 biology

The clinical and molecular spectrum of AGO2-associated Lessel-Kreienkamp neurodevelopmental syndrome

Deze studie breidt het klinische en moleculaire begrip van het Lessel-Kreienkamp-syndroom uit door 45 nieuwe individuen met AGO2-varianten te karakteriseren, waarbij een multisystemische neurodevelopmentale stoornis wordt onthuld die wordt gedreven door diverse structurele verstoringen die specifieke AGO2-functies verstoren—waaronder miRNA-binding, P-body-assemblage en fosforyleringsafhankelijke omzetting—waardoor verschillende moleculaire mechanismen worden gekoppeld aan fenotypische variabiliteit.

Debora Tibbe, Christina Kiel, Olena Ielesicheva, Kerstin Robles de Maruri, Helia Mahboobi, Joschka Züghart, Hans-Hinrich (…)2026-07-02
🧬 biology

GeneRhythm uncovers gene expression rhythms that shape the dynamic transcriptional landscape in single-cell omics

Het artikel introduceert GeneRhythm, een nieuw framework dat de analyse van enkelcel-genexpressie herformuleert in het tijd-frequentiedomein om ritmische regulatieprogramma's en ziekterellevante dynamieken te onthullen die onzichtbaar zijn voor conventionele tijddomein-benaderingen.

Jun Ding, Xiuhui Yang, Yiming Jia, Braeden Giles, Yumin Zheng, Jingtao Wang, Kailu Song, Bowen Zhao, Yasmin Jolasun, Vis (…)2026-07-02
🧬 biology

Gut microbiota of insectivorous bats in Japan harbor Chlamydophila psittaci and Shiga toxin-producing Escherichia coli: host species and location shape community structure

Deze studie karakteriseert de darmmicrobiota van drie insectivore vleermuissoorten in Japan, waarbij wordt onthuld dat zowel de gastheersoort als de bemonsteringslocatie de gemeenschapscompositie significant vormgeven, terwijl tevens de eerste detectie van *Chlamydophila psittaci* naast andere pathogenen zoals *Bacillus cereus* en Shiga-toxineproducerende *Escherichia coli* wordt geïdentificeerd, wat daarmee het belang van microbiële surveillance bij wilde dieren voor One Health onderstreept.

Rosalia Mwongeli Makau, Bett Evalyne Chepkirui, Ishara Uhanie Perera, Takashi Shimizu, Masanori Hashino, Hiroshi Shimoda (…)2026-07-02
🧬 biology

Cell-Size-dependent of bacterial communities antibiotic resistome profiles and risk assessment in a river: A metagenomic analysis

Deze metagenomische studie onthult dat hoewel kleine (0,1–0,45 µm) en grote (>0,45 µm) rivierbacteriën verschillende samenstellingen van antibioticaresistentiegenen en gastheergemeenschappen vertonen, zij uiteindelijk vergelijkbare risico's op antimicrobiële resistentie vormen, wat de significante en voorheen over het hoofd geziene rol van kleine bacteriën in omgevingsresistomen benadrukt.

Pengfei Yang, Jiaxian yao, Yuehua Zhang, Yongzhen Zhao, Zening Wang, Shuhan Li, Fangzhou Gao, Guannan Mao, Shuai Zhang (…)2026-07-02
🧬 biology

Performance of a fine-scale positioning acoustic telemetry array in a deep freshwater ecosystem

Deze studie evalueert een akoestische telemetrie-array voor positionering op fijnschaal in een diep zoetwatersysteem, waarbij wordt vastgesteld dat hoewel de detectie-efficiëntie varieert met het vermogen van de tag, de afstand tussen de ontvangers en de temperatuur, het systeem effectief blijft voor nauwkeurige positionering van dieren met ontvangers die op 400–800 meter afstand van elkaar geplaatst zijn.

Benjamin L. Hlina, Aaron T. Fisk, Dale M. Webber, Neil Rooney, Timothy B. Johnson2026-07-02
🧬 biology

Early-life stress shapes tissue-specific gut-brain metabolomic and microbial profiles in laying hens

Deze studie toont aan dat stress in de vroege levensfase bij leghennen een persistente, weefselspecifieke metabole en microbiële reorganisatie langs de darm-hersenas in de volwassenheid induceert, gekenmerkt door gelokaliseerde lipide- en redox-veranderingen in de ileum en de hersenen, terwijl de systemische plasmaprofielen grotendeels onveranderd blijven.

Annemarie J.W. Mens, Ingrid C. de Jong, Soumya K. Kar, René P. Kwakkel, Edoardo Zaccaria2026-07-02
🧬 biology

Comparative Ion Channel Transcriptomes of NK1R and Somatostatin Neurons in the preBötzinger Complex of the Ventrolateral Medulla

Deze studie maakt gebruik van single-nucleus RNA-sequencing om de afzonderlijke ionkanaal-transcriptomen van Tacr1+ en Sst+ neuronen in het preBötzinger Complex te karakteriseren, waarbij wordt onthuld dat Tacr1+ neuronen een unieke moleculaire signatuur bezitten die een gecoördineerde opregulatie van TRPC5, NALCN en specifieke neuromodulerende receptoren omvat die waarschijnlijk ten grondslag liggen aan hun cruciale rol bij het genereren van ademhalingsritmes.

Hemalatha Bhagavan, Aguan D. Wei, Luiz M. Oliveira, Jan-Marino Ramirez2026-07-02