q-bio papers | Gist.Science

Supervised Learning-Driven Prediction of Small-Molecule Modulator Bioactivity Against Protein-Protein Interactions

Deze studie presenteert een supervised learning-framework dat gebruikmaakt van Random Forest-modellen met RDKit-descriptors om de bioactiviteit van kleine moleculaire modulatoren tegen eiwit-eiwitinteracties effectief te voorspellen, waarbij sterke prestaties worden behaald op interne en blinde datasets terwijl de uitdagingen van het generaliseren naar structureel diverse externe verbindingen worden benadrukt.

Tanmoy Jana, Joy Karmakar, Raja Banerjee, Sudipto Saha2026-08-14

🧬 biology

Oscillatory Modulation of Tumor Microenvironment pH Enhances Simulated Therapeutic Response in Breast Cancer

Deze studie presenteert een hybride computationeel kader dat Gated Attention Multiple Instance Learning combineert met een reactie-diffusiemodel om aan te tonen dat oscillerende modulatie van de extracellulaire pH de gesimuleerde therapeutische respons en reductie van de tumorlast bij borstkanker significant verbetert vergeleken met alleen chemotherapie.

Josias Mauricio Marques Minghin2026-08-14

🧬 biology

An End-to-End Reproducible RNA-Seq Workflow from Raw Sequencing Reads to Differential Expression, Pathway Enrichment, and Biological Interpretation

Dit artikel presenteert een modulaire, versiebeheerde en volledig reproduceerbare end-to-end RNA-seq workflow die tools integreert van ruwe dataprocessing tot pathwayverrijking, waarbij de bruikbaarheid wordt aangetoond door middel van een borstkanker casestudy die onthult hoe ESR1-mutaties en BET-remmerbehandeling wederkerige transcriptionele veranderingen in belangrijke biologische pathways aansturen.

Fairuz Y. Nasir, Monira Obaid, SM Udden2026-08-14

🧬 biology

Brain as Language: Neuro-Semantic Modeling of Glioblastoma Radiogenomics

Dit artikel stelt een neuro-semantisch radiogenomisch raamwerk voor dat multiparametrische MRI-kenmerken vertaalt naar interpreteerbare, op bewijsvoering gebaseerde tokensequenties om de kenmerken van glioblastoom te modelleren, waarbij een hoge voorspellende nauwkeurigheid voor de MGMT-promotormethyleringsstatus wordt bereikt terwijl de kloof tussen kwantitatieve beeldvormingsgegevens en verifieerbare biomedische redenering wordt overbrugd.

Mariya Miteva, Mariya Nisheva-Pavlova2026-08-14

🧬 biology

Evidence for Reactivation of Embryonic Cytoskeletal Remodeling Programs, silenced decades earlier, in Amyotrophic Lateral Sclerosis

Deze studie toont aan dat amyotrofische laterale sclerose (ALS) wordt gekenmerkt door de gecoördineerde reactivatie van embryonale cytoskelet-remodelleringprogramma's, specifiek betrokken bij een opgereguleerde Arp2/3-gemedieerde actinadynamiek, MYH10-geassocieerde contractiliteit en ontwikkelingsgliale paden, wat suggereert dat deze uitgeschakelde mechanismen sleutel vormen tot de pathogenese van de ziekte en potentiële therapeutische doelwitten zijn.

Steven Lehrer2026-08-14

🧬 biology

Small molecules targeting HDAC6: indirect microtubule assembly modulators.

Deze studie identificeert zeven nieuwe, selectieve humane HDAC6-remmers via computationele screening en experimentele validatie, waarbij hun unieke zink-coördinerende bindingsmechanismen worden onthuld en hun potentieel voor cross-kingdom targeting van plantaire tubuline-deacetylases wordt aangetoond.

Mariia Stykhylias, Oksana Rybachuk, Alexey V Raevsky, Samofalova Dariya, Spivak Svetlana, Ozheredov Sergey, Platonov Mak (…)2026-08-14

🧬 biology

Integrated Pan-Cancer Multi-Omics Analysis Reveals TMEM45A Associated with DNA Hypomethylation, Immune Exclusion, and Drug Response

Deze geïntegreerde pan-cancer multi-omics studie onthult dat TMEM45A frequent overgeëxprimeerd is als gevolg van DNA-hypomethylatie, correleert met een slechte prognose en een immuun-exclusieve tumoromgeving, en dient als een potentiële biomarker voor het voorspellen van gevoeligheid voor vorinostat en resistentie tegen docetaxel.

Md. Shakawat Hossain2026-08-14

🧬 biology

DHTKD1 exon deletion associated with sporadic cerebellar ataxia

Deze studie identificeert een zeldzame heterozygote *DHTKD1*-exon-deletie als een potentiële oorzaak van sporadische cerebellaire ataxie en suggereert, door middel van een systematische review van bestaande gevallen, dat *DHTKD1*-varianten kunnen leiden tot diverse neurodegeneratieve fenotypes via gemeenschappelijke dominante mechanismen.

Junhui Zhu, Xuemeng Cui, Fei Li, Huixia Lin, Rong Chen, Zongjun Li2026-08-14

🧬 biology

Haptoglobin Gene Polymorphism and Association with Microalbumiuria among Type 2 Diabetic Patients With and without Microalbuminuria in Kano State, Nigeria

Deze studie, uitgevoerd in de staat Kano, Nigeria, vond dat onder type 2-diabetische patiënten het haptoglobine Hp2-2-genotype significant geassocieerd is met een verhoogd risico op microalbuminurie, terwijl de Hp1-1- en Hp2-1-genotypen dat niet zijn.

Jamilah Ibrahim Suleiman, Nasiba Babale, Ahmad Muhammad Bello, Fatima Adamu, Sarah Nuhu Kase, Christy Chinyere Fredrick (…)2026-08-14

🧬 biology

Regulation of schistosomiasis by the host gut microbiome

Deze studie toont aan dat het darmmicrobioom van de gastheer de uitkomsten van schistosomiasis significant beïnvloedt door immuunresponsen en pathologie te moduleren, waarbij specifieke bacteriële biomarkers en metabole paden worden geïdentificeerd die de microbiële samenstelling koppelen aan infectie Ernst en leverfibrose.

Thabo Mpotje, Martin Gael Oyono, Leonel Meyo Kamguia, Mireille Kameni, Leonel Javeres Mbah Ntepe, Moise Wokam, Bernard M (…)2026-08-14

← Vorige Volgende →