🧬 Category

q-bio

1381 papers

🧬 biology

Investigating the Effect and Mechanism of Semantic Alignment in Fixed-Backbone Protein Sequence Design

Deze studie onderzoekt de overdraagbaarheid en de effecten op outputniveau van semantische uitlijning in eiwitsequentieontwerp door een aan AGSDD geïnspireerde benadering toe te passen op MapDiff, waarbij wordt vastgesteld dat hoewel het de perplexiteit verbetert en de semantische aandacht verhoogt, het primair fungeert als een distributionele regularisator zonder de biochemische gelijkenis of de mediaan van het herstel significant te verbeteren.

Ke Zhang2026-07-12
🧬 biology

Host Immune Endotype Determines IL-1β Dominance, Gut Barrier Failure, and Microbiota-Metabolite Circuit Rewiring During Combined Antibiotic and Colitis Injury: Implications for IBD Endotype-Tailored Therapy

Deze studie toont aan dat de immuunendotype van de gastheer het verloop van gecombineerde antibiotica- en colitis-schade bepaalt, waarbij Th1-georiënteerde immuniteit leidt tot IL-1β-gedomineerde inflammatie en metabole dysregulatie, terwijl Th2-georiënteerde immuniteit mucosale herstel bevordert via afzonderlijke anti-inflammatoire metabole circuits, wat de noodzaak voor endotype-specifieke therapieën bij IBD benadrukt.

Sohini Mukhopadhyay, Kartika Sahu, Debopriya Saha, Palok Aich2026-07-11
🧬 biology

Enhanced Cytotoxicity of Liposomal Daunorubicin in HCT116 Colorectal Cancer Cells: Modulation of Oxidative Stress and ERK1/2 gene expression

Deze studie toont aan dat liposomaal daunorubicine een superieure cytotoxiciteit vertoont tegen HCT116 colorectale kankercellen vergeleken met vrij daunorubicine door het oxidatieve stress aanzienlijk te verhogen, de ERK1/2-genexpressie te onderdrukken en apoptotische morfologische veranderingen te induceren.

Fariba Moharami, Zahra Pourjam, Batool Shiri, Saja Abd Ali Shahadha, Mehdi Ebrahimi2026-07-10
🧬 biology

A Sampling-Based Computational Frame-work for Evaluating Enterotype Assignment Stability in Clinical Microbiome Studies

Deze studie introduceert een resampling-framework dat aantoont dat enterotype-toewijzingen in klinische microbioomstudies vaak instabiel en cohortafhankelijk zijn, waarbij een subset van "variabele" individuen wordt geïdentificeerd wiens classificaties fluctueren op basis van de cohortcompositie terwijl "kern"-individuen stabiel blijven, waardoor praktische instrumenten worden geboden om te bepalen wanneer betrouwbare vier-enterotype stratificatie haalbaar is versus wanneer vereenvoudigde groepering noodzakelijk is.

Irene Creus-Martí, Jean-Daniel Zucker, Karine Clément, Edi Prifti, Eugeni Belda2026-07-10
🧬 biology

Multi-hit genetic lesions and a stress-imprinted immune transcriptome define the inflammatory pathology in ALS patients

Door het integreren van whole-genome sequencing en single-cell RNA sequencing onthult deze studie dat ALS-pathologie voortkomt uit een multi-hit genetische architectuur die convergeert op een door stress geïnduceerd, inflammatoir immuun transcriptoom dat wordt gekenmerkt door de activatie van innate lymfocytenpopulaties.

Ao Mei, Dipanarine Jewett, Anahid Jewett, Kawaljit Kaur, Subramaniam Malarkannan2026-07-10
🧬 biology

Resilience Beyond Diagnosis: Prospective Neural Correlates of Better-Than-Expected Outcomes in Depression

Deze prospectieve neuroimaging-studie met 1.804 deelnemers definieert veerkracht als betere dan verwachte depressieve uitkomsten relatief aan cumulatief risico en onthult dat hoewel er geen onmiddellijke structurele hersenverschillen werden gevonden, een hogere veerkracht een daaropvolgende afname voorspelt in het volume van de grijze stof in de linker inferieure orbitofrontale gyrus en de temporale pool, wat potentieel reflecteert dat het gaat om neurale efficiëntie of vertraagde biologische kosten.

Vincent Hammes, Katharina Brosch, Paula Usemann, Friederike David, Hannah Scherer, Christina Schmitter, Jochen Bauer, Ti (…)2026-07-10
🧬 biology

CD146⁺ endothelial and pericyte populations define a repair-associated neovascularization program in rheumatoid arthritis pannus

Deze studie identificeert onderscheidende CD146⁺ endotheel- en pericytenpopulaties die een herstel-geassocieerd neovascularisatieprogramma in reumatoïde artritis-pannus aansturen via specifieke transcriptionele signaturen en actieve intercellulaire communicatie.

Yoko Miura, Nadia Milad, Atsushi Usami, Shunichi Kosugi, Hideki Noguchi, Satoshi Kanazawa2026-07-10
🧬 biology

Nanomito enables amplification-free full-length analysis of mitochondrial DNA variants and deletions

De studie introduceert Nanomito, een amplificatievrije long-read nanopore sequencing-workflow die routinematige PCR-gebaseerde methoden overtreft door een nauwkeurige, volledige analyse van mitochondriaal DNA te bieden, wat betrouwbare kwantificering van heteroplasmie en precieze detectie van grootschalige deleties mogelijk maakt zonder amplificatiebias.

Valérie Desquiret-Dumas, Solène Duverger, Patrizia Amati-Bonneau, Xavier Dieu, Delphine Mirebeau-Prunier, Pascal Reynier (…)2026-07-10
🧬 biology

A Dynamical Systems Framework for Mapping Consciousness Models to Neuroelectromagnetic Field Dynamics

Dit artikel stelt een multidimensionaal dynamisch systeemframework voor dat bewuste toestanden representeert als vectoren bestaande uit fysieke, cognitieve en noëtische componenten om een gedeelde wiskundige taal te vestigen voor het in kaart brengen van neuro-elektromagnetische velddynamiek naar subjectieve ervaring en het empirisch vergelijken van concurrerende bewustzijnstheorieën.

William J. Bosl2026-07-10