🧬 Category

q-bio

1390 papers

🧬 biology

PathwayBench: a multi-criterion benchmark of pseudobulk pathway activity scoring methods reveals rank-window competition as a mechanism of biological signal loss in single-cell RNA-seq

PathwayBench introduceert een uitgebreide multi-criteria benchmark die onthult dat "rank-window competitie" leidt tot verlies van biologisch signaal en richtinginversie in op rangorde gebaseerde pathway-scoremethoden, waardoor het een evidence-based methode selectie voor pseudobulk single-cell RNA-seq analyses stuurt.

Fadhl M. Alakwaa¹, Ahmed Elbaz², Sara Al Azzam³, Tasnim Alshebani⁴2026-07-10
🧬 biology

Biochemical efficacy in the inhibition of oxidative stress mediated by Enterococcus faecium and Streptococcus bovis isolated from the intestinal microbiota

Deze studie toont aan dat specifieke isolaten van *Enterococcus faecium* en *Streptococcus bovis* uit de gezonde menselijke darmmicrobiota synergetische biofilmvorming en significante antioxidant-, ijzerchelerende en anti-lipideperoxidatieactiviteiten vertonen, wat hun potentieel als probiotica voor het verminderen van oxidatieve stress benadrukt.

Bachir Bourroubey2026-07-10
🧬 biology

Flagellar Oncogenicity in the Hypocomplement–Tumour Holobiont: A Five-Prediction Hypothesis Paper on Bacterial Flagella as Effectors of Virus-Driven and Coinfection-Driven Carcinogenesis

Dit hypothesepaper stelt voor dat bacteriële flagellen dienen als de primaire effectoren van virale en co-infectie-gedreven carcinogenese binnen het tumormicrobioom door bacteriële flagelbiologie, complementevasie en microbiële dominantie te koppelen, en schetst vijf toetsbare voorspellingen plus een zesde uitgebreide hypothese om toekomstig immuno-oncologisch onderzoek te begeleiden.

Shrish Chandra Srivastava2026-07-10
🧬 biology

The Aiko–Takeru (AT) Model: A Kidney-Level Flux–Balance Framework for Asymmetric PKD Progression

Het Aiko–Takeru (AT) Model stelt een flux-balansraamwerk op nieraangevuld niveau voor, afgeleid van een longitudinale studie bij katten met geïnduceerde drainageasymmetrie, wat suggereert dat de asymmetrische progressie van polycystische nierziekte wordt gedreven door nierspecifieke verschillen in drainage-efficiëntie in plaats van enkel door systemische vasopressine-blootstelling.

Naruhiko Nakanishi2026-07-10
🧬 biology

Modulation of layer II immature neurons in the neocortex of sheep kept in different environmental conditions

Deze studie toont aan dat zowel stressvolle isolatie als omgevingsverrijking het aantal immatore neuronen in de neocortex van schapen significant verminderen in vergelijking met de controlegroep, waarschijnlijk door hun rijping te versnellen, waardoor wordt onthuld dat levensstijlfactoren structurele plasticiteit in de bovenste lagen van gyrencefale hersenen kunnen induceren.

Luca Bonfanti2026-07-10
🧬 biology

Decoding Viral Signatures: Comparative Transcriptomics of SARS-CoV-2, Influenza A, and RSV Reveals Virus-Specific Host Responses

Deze studie maakt gebruik van vergelijkende transcriptomica van SARS-CoV-2-, Influenza A- en RSV-infecties in humane luchtwegepitheelcellen om te onthullen dat deze respiratoire virussen grotendeels onderscheidende, virusspecifieke gastheer-transcriptionele responsen oproepen met minimale gedeelde gen-signatures, wat wijst op een behoefte aan pathogeen-gerichte therapeutische en diagnostische strategieën.

Oluwadamilola Sadiku2026-07-10✓ Author reviewed ⓘ
🧬 biology

Dual targeting of BCL-XL and MCL-1 exposes a rapid and exploitable apoptotic vulnerability in non-small cell lung cancer

Deze studie toont aan dat het dubbel targeten van BCL-XL en MCL-1, in plaats van inhibitie van een enkel eiwit, een snelle, synergetische en p53-onafhankelijke mitochondriale apoptose induceert in de meerderheid van de niet-kleincellige longkankercellen, wat een coöperatief pro-overlevingsnetwerk onthult als een cruciale therapeutische kwetsbaarheid.

Liyang Wu, Baris Budak, Oihane Ofogo, Ali Jazaeri Jouneghani, Philippe JeanRichard, Daniel Bachmann, Thomas Kaufmann2026-07-10