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Este estudo demonstra que a triagem ultrarrápida de dehalogenases com substratos volumosos permite identificar mutações distantes que modulam a dinâmica conformacional e melhoram a eficiência catalítica, superando as limitações do desenho racional.
Os pesquisadores desenvolveram reagentes de oxaziridina enantioméricos para mapear a oxidação estereoespecífica de metionina em proteomas, demonstrando que a modificação quiral de um único átulo pode regular alostericamente a função proteica e amplificar alterações celulares sob estresse oxidativo.
Este estudo apresenta um modelo estrutural integrativo do complexo de remodelação de cromatina HDAC2:MIER1:MHAP1, demonstrando que a combinação de dados de cruzamento experimental com técnicas computacionais é essencial para elucidar as interações mediadas por regiões intrinsecamente desordenadas que métodos como o AlphaFold isolado não conseguem capturar.
Este estudo demonstra que modificações químicas nas posições R1 e R3 do antiviral PF74 resultam em compostos com maior potência, estabilidade e afinidade de ligação ao capsídeo do HIV-1, fornecendo insights cruciais para o desenvolvimento de novos fármacos clínicos.
Este estudo utiliza simulações de dinâmica molecular para investigar as diferenças nos modos de ligação da manose aos domínios de reconhecimento de carboidratos de DC-SIGN e MRC1, revelando como um estado de ligação específico no MRC1 explica sua maior afinidade e auxiliando no desenvolvimento de ligantes terapêuticos seletivos para o tratamento do retinoblastoma.
Este estudo apresenta uma estratégia de engenharia de enzimas multi-objetivo que resultou no desenvolvimento da Brnoteplase, uma nova protease trombolítica com seletividade aprimorada à fibrina, maior resistência à inibição e eficácia terapêutica superior, demonstrada por estudos in vivo com redução de complicações hemorrágicas.
O estudo identifica um novo motivo de interação proteica (DIP-box) que permite que a proteína FANCD2 atue como um hub central, recrutando diretamente fatores de reparo de DNA, modificação de histonas e processamento de RNA para coordenar a reparação de ligações cruzadas intercadeia.
Este estudo demonstra que, em garfos de replicação desacoplados, a degradação independente das fitas de DNA pela enzima EXO1 é essencial para a ativação do checkpoint ATR e para a contenção da progressão do garfo, sendo a fita tardia rapidamente degradada enquanto a fita líder permanece estável.
Este estudo utiliza microscopia crioeletrônica para elucidar a estrutura do receptor PATCHED1 ligado ao inibidor PAH, revelando que este se liga a uma cavidade hidrofóbica normalmente ocupada pelo colesterol, bloqueando assim a atividade de efluxo de drogas mediada por PTCH1 e oferecendo uma base estrutural para o desenvolvimento de novos agentes terapêuticos contra a quimiorresistência.
Este estudo revela que a ligação dinâmica entre a Argonaute-2 e a CK1α, desencadeada pelo pareamento suplementar do RNA alvo, induz mudanças conformacionais e fosforilação que promovem a liberação do alvo e a renovação eficiente do complexo RISC.
Este estudo demonstra que a molécula sinalizadora c-di-AMP inibe a atividade do antiportador CpaA em *Bacillus subtilis* ao se ligar ao seu domínio RCK, revelando uma camada adicional de complexidade na regulação bacteriana do potássio e da adaptação osmótica.
Os autores relatam a criação da primeira espécie de nitreto de Mn(V) de alta valência estável dentro de uma proteína de novo design, demonstrando que o ambiente proteico suprime a decomposição bimolecular e permite a transferência catalítica de átomos de nitrogênio para aziridinação enantioseletiva.
Este estudo demonstra que a presença de contra-íons amônio e alquilamônio em atmosferas locais ricas em aminas, como as geradas por poças de gás em rochas subterrâneas, melhora significativamente a polimerização de nucleotídeos cíclicos 2',3' em oligômeros de RNA, sugerindo um mecanismo plausível para a origem da vida.
Este estudo detalha a estrutura e função de quatro enzimas do tipo Est que conferem resistência a macrolídeos, revelando que a hidratação e a hidrólise, mediadas por uma "gaiola de água", ditam a especificidade do substrato através de ligação promíscua e posicionamento impreciso, oferecendo insights para o desenvolvimento de novos antibióticos.
Este estudo demonstra que, embora a clivagem do GPIbα mediada pela plasmina seja responsável pela desestabilização de aglutinados plaquetários induzidos por ristocetina, a sua contribuição para a ruptura de complexos plaqueta-VWF em condições patológicas in vivo, como na PTT, parece ser limitada.
Este estudo demonstra que a substituição do agente redutor DTT pelo TCEP na cristalização da aldedo oxidase humana (hAOX1) permite a obtenção de cristais ordenados sem inativar irreversivelmente a enzima, viabilizando futuros estudos de cristalografia temporal.
Este estudo demonstra que a S-palmitoilação reversível da glutamato desidrogenase (GDH) mitocôndrial inibe sua atividade enzimática e desestabiliza sua estrutura hexamérica, promovendo a dissociação em dímeros, um processo que pode ser revertido pelas tioesterases APT1 e ABHD10, estabelecendo assim um novo mecanismo de regulação que conecta o metabolismo lipídico ao controle enzimático central.
Este estudo estabelece uma triagem de alto rendimento em lisados celulares humanos que identifica a micotoxina NT-2 como um inibidor da síntese proteica que se liga ao centro de transferência peptidil da ribossomo humano, demonstrando a eficácia de plataformas livres de células para descobrir novos inibidores translacionais.
Este estudo demonstra que a proteína PIH1D1, através do complexo R2TP, reconhece e estabiliza a proteína p53 sem afetar seu domínio C-terminal, regulando assim o ciclo celular e oferecendo uma nova estratégia terapêutica para restaurar a função de p53 em células cancerígenas.
Este estudo demonstra que a proteína FoTO1 otimiza a biossíntese do Taxol atuando tanto como uma enzima catalisadora quanto como um organizador não catalítico de complexos enzimáticos entre o plastídio e o retículo endoplasmático, superando gargalos na produção biotecnológica e potencializando vias de diterpenos em geral.