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A genômica é o estudo que decifra o manual de instruções da vida, revelando como o DNA molda quem somos, desde a cor dos olhos até a suscetibilidade a certas doenças. Este campo avança rapidamente, transformando nossa compreensão da biologia e abrindo caminho para tratamentos personalizados que antes pareciam ficção científica.
No Gist.Science, rastreamos diariamente os novos pré-prints de genômica enviados ao bioRxiv para torná-los acessíveis a todos. Processamos cada trabalho recém-publicado, oferecendo tanto resumos técnicos detalhados quanto explicações em linguagem simples, garantindo que você entenda as descobertas mais recentes sem se perder no jargão complexo.
Abaixo, você encontrará a seleção mais atual de artigos nesta área, organizados para facilitar sua leitura e compreensão das últimas inovações.
O estudo apresenta o ChIANet, uma estrutura de aprendizado profundo multimodal que prevê com precisão a arquitetura 3D da cromatina mediada por proteínas em diversos contextos funcionais, revelando princípios organizacionais conservados e reconfigurações dependentes do contexto, além de identificar redes de interação associadas a ecDNA em genomas cancerígenos.
Este artigo descreve ferramentas escaláveis para anotação precisa de regiões UTR e medição do uso de sítios de splicing e poliadenilação em parasitas tripanossomatídeos, aplicando-as para anotar todos os genomas disponíveis dessas espécies com base em dados de sequenciamento de RNA de leituras curtas.
O artigo apresenta o Lorax, uma plataforma nativa da web e acelerada por GPU que permite a visualização e exploração interativa em tempo real de Grafos de Recombinação Ancestral (ARGs) em escala de biobancos.
Este estudo sequenciou os genomas completos das linhagens celulares felinas CRFK e PG-4 para inferir as características fenotípicas dos gatos doadores, revelando que a CRFK provém de um gato de pelo longo preto e a PG-4 de um gato bicolor branco e preto, ambos com olhos não azuis, fornecendo assim um novo contexto genético para pesquisas futuras com células felinas.
Este estudo apresenta uma abordagem escalável que combina dados experimentais e preditivos para reclassificar a maioria das variantes de significado incerto (VUS) em genes associados a doenças, permitindo a "pré-classificação" de variantes futuras e demonstrando como o uso sistemático de evidências calibradas pode impulsionar a medicina genômica.
Este trabalho apresenta um pipeline reprodutível e interpretável para previsão da idade epigenética que combina seleção de CpGs guiada por SHAP, anotação funcional e um ensemble de modelos de aprendizado de máquina, alcançando alta precisão e generalização entre tecidos sanguíneos e cerebrais.
Este estudo apresenta duas novas montagens de genoma de *Macrocystis pyrifera* da Austrália, que revelam uma significativa divergência genética e funcional em relação à população do Hemisfério Norte, fornecendo recursos essenciais para a conservação e restauração das florestas de kelp no Hemisfério Sul.
Este estudo valida a presença de um único transcrito do gene Nepl15 na linhagem Oregon-R de Drosophila melanogaster, identificando variações na sequência codificante em relação ao banco de dados FlyBase, embora sejam necessárias pesquisas adicionais para determinar o impacto fisiológico completo dessas alterações.
Este estudo estima as taxas de retrotransposição em cães, revelando que novos elementos SINEC e LINE-1 surgem a uma taxa de aproximadamente 1 em 22 e 1 em 184 nascimentos, respectivamente, indicando que a alta diversidade genética observada reflete principalmente variações antigas e de longa data.
Este estudo integra dados de acessibilidade da cromatina, molQTL e GWAS em músculo esquelético suíno para revelar que a dinâmica regulatória muda do desenvolvimento fetal para o pós-natal, identificando variantes regulatórias específicas de cada estágio que influenciam traços agronômicos importantes.