🧬 biologia

Single-Cell Multiplex Immune Biomarker Prediction from Histopathology Across Cancer Types and Clinical Endpoints

Este estudo apresenta o CellPlexer, um framework de aprendizado profundo que infere estados de biomarcadores de célula única a partir de imagens histopatológicas de rotina H&E para prever com precisão desfechos clínicos e mutações moleculares em múltiplos tipos de câncer, oferecendo uma alternativa escalável e não destrutiva ao perfilamento espacial multiplex caro.

Usman Afzaal, Usama Sajjad, Abdul Akbar, Tianyang Wang, Elshad Hasanov, Sachin Jhawar, Wei Chen, Zaibo Li, Muhammad Khal (…)2026-10-05
🧬 biologia

Deep Ensemble Learning with Graph Attention Mechanisms for Molecular Classification of HIV Inhibitors

Este estudo demonstra que uma abordagem híbrida combinando aprendizado de máquina baseado em impressões digitais, Redes de Atenção em Grafos e ensembles de empilhamento aborda efetivamente o desequilíbrio de classes para melhorar a classificação de inibidores de HIV, destacando o valor complementar de diversas representações moleculares para a descoberta de fármacos interpretável.

Abdul Ahad, Md Mahabube Alahi Atik, Mirza Farhan Shahriar, Md Rahik Redwan, Kazi Tanvir Akter2026-10-05
🧬 biologia

Quantitative super-resolution imaging with deep learning segmentation reveals early mitochondrial network remodeling and altered mitochondria-lysosome interactions in Pompe disease muscle

Ao combinar o imageamento de super-resolução com a segmentação por aprendizado profundo, este estudo revela que a doença de Pompe induz o remodelamento precoce da rede mitocondrial, específico para cada tipo de fibra, e aumentos progressivos e dependentes de região nos contatos entre mitocôndrias e lisossomos no músculo esquelético, fornecendo uma estrutura quantitativa para monitorar a patofisiologia e avaliar terapias.

Ibrahim Hassani, Johan Deniaud, Chantal Thorin, Tony Fiore, Laurence Dubreil, Karl Rouger, Marie-Anne Colle2026-10-05
🧬 biologia

Knobs-into-Holes Engineering Enables Assembly of Bispecific Anti-HER2/Anti-HER3 Antibodies in Transient Plant Expression System

Este estudo demonstra que a estratégia de engenharia Knobs-into-Holes combinada com a co-infiltração transiente em *Nicotiana benthamiana* permite a produção eficiente de anticorpos biespecíficos heterodiméricos funcionais visando tanto HER2 quanto HER3.

Keunbeom Youk, Hyunjoo Hwang, MinKue Kim, Yerin Kim, Waranyoo Phoolcharoen, Prabhat Shrestha, Simmyung Yook, Jeong Hwan (…)2026-10-05
🧬 biologia

Life-time radio tracking of periodical cicadas detects minimal dispersal from emergence sites

O rastreamento radioativo de vida inteira revela que as cigarras periódicas exibem uma dispersão mínima de seus locais de emergência natais, sugerindo que suas distribuições de ninhadas estáveis e não sobrepostas são mantidas por uma falta natural de movimento, em vez de mecanismos ativos de isolamento ambiental ou comportamental.

Martin Wikelski, Martin Bihrle-Johnson, Henry Horn, B. Rosemary Grant, Peter R. Grant, Chris Simon2026-10-05
🧬 biologia

Quantitative gene-level inference of tumor transcription from plasma epigenomes

Este estudo introduz o APEX, um framework de aprendizado de máquina que aproveita características epigenômicas plasmáticas, incluindo padrões de modificação de histonas e periodicidade de fragmentação de DNA, para inferir com precisão a transcrição de genes únicos em todo o genoma através de diversos tipos de câncer, permitindo, assim, o monitoramento de alvos terapêuticos e biomarcadores sem as limitações das abordagens existentes de alta fração ou de expressão global.

Matthew Freedman, Gunsagar Gulati, Damien Vasseur, Rashad Nawfal, Shahabeddin Sotudian, Karl Semaan, Marc Eid, Ji-Heui S (…)2026-10-05
🧬 biologia

Bifidobacterium longum Bianquejun 19 Suppresses Helicobacter pylori Motility and Colonization by Disrupting Energy Metabolism

Este estudo demonstra que *Bifidobacterium longum* Bianquejun 19 suprime o crescimento, a motilidade e a colonização de *Helicobacter pylori* ao interromper o metabolismo de carbono central e a função da cadeia respiratória, o que subsequentemente reduz a inflamação gástrica e a deposição de colágeno em camundongos infectados.

Yajie Zhang, Lijuan Kang, Yinqing Li, Liang Zhao, Yuanhong Xie, Hongxin Zhang, Ran Wang, Junhua Jin2026-10-05
🧬 biologia

No PCR or serologic evidence of exposure of Alaskan sled dogs to Bartonella spp. bacteria

Um estudo de 75 cães de trenó do Alasca não encontrou evidência de exposição a *Bartonella* spp. por PCR ou sorologia, sugerindo que as bactérias estão atualmente ausentes nesta população, apesar da necessidade de monitoramento contínuo devido a potenciais mudanças na distribuição impulsionadas pelo clima.

Cristina M Hansen, Tatianna Krueger, Rivers Leverett, Joanne E McCrea2026-10-05
🧬 biologia

Automated estimation of gadoid and flatfish abundance in stereo-BRUV footage using YOLO object detection

Este estudo apresenta um pipeline automatizado baseado em YOLO que detecta com sucesso gadoides e peixes planos em filmagens de BRUV estéreo de parques eólicos no Mar do Norte, introduzindo uma métrica personalizada para validar sua capacidade de estimar eficientemente a abundância de peixes e demonstrando que a combinação de perspectivas de câmera dupla aumenta a sensibilidade das estimativas de população em comparação com perspectivas únicas.

Mario Lambrette, Anthony W. J. Bicknell, Samuel Gierhart, Matthew J. Witt2026-10-05
🧬 biologia

Tuning the Cell-Microchip Interface to Control the Cellular Interaction of Silicon Oxide Microdevices

Este estudo demonstra que o ajuste sistemático da química de superfície de microchips de óxido de silício para controlar a carga e a molhabilidade modula significativamente sua eficiência de internalização celular por meio de mecanismos dependentes da reorganização da actina, mantendo uma alta citocompatibilidade, estabelecendo, assim, uma plataforma robusta para a otimização da entrega intracelular.

Pascual López-Algarra, Saman Bagherpour, Marta Duch, Juan Pablo Agusil, José Antonio Plaza, Sergio Martínez-Ruiz, Josefa (…)2026-10-05