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Can Machine Learning Identify Meaningful Patterns in DNA Sequences? A Computational Study of DNA Motifs Associated with Transcription-Factor Binding

Este estudo computacional independente demonstra que classificadores de aprendizado de máquina, particularmente Random Forest, podem distinguir eficazmente sequências de DNA associadas ao CTCF de backgrounds de dinucleotídeos embaralhados usando características de frequência de k-mers curtos, estabelecendo assim um fluxo de trabalho transparente e reprodutível para integrar a biologia molecular com o aprendizado de máquina aplicado.

Hafsa Asmatullah2026-09-16

🧬 biologia

Metazoan-wide phylogenomics supports the emergence of recognisable canonical prostanoid-receptor family structure across the vertebrate transition

Este estudo filogenômico de amplo alcance em metazoários demonstra que a estrutura canônica de oito famílias dos receptores de prostanoides é uma inovação específica de vertebrados, revelando que os homólogos de não-vertebrados propostos anteriormente são, na verdade, linhagens de receptores distintas cuja semelhança aparente com os receptores EP4 de vertebrados decorre da proximidade filogenética e não de uma verdadeira ortologia.

Sebastiano Scibelli2026-09-16

🧬 biologia

Network pharmacology and experimental evidence implicate ERα-associated β-catenin regulation in the osteoprotective effects of sea buckthorn fruit extract

Este estudo demonstra que o extrato do fruto da espinheiro-marítimo exerce efeitos osteoprotetores em camundongos ovariectomizados, promovendo a formação óssea e suprimindo a reabsorção óssea através de uma regulação positiva da sinalização de β-catenina mediada por ERα.

Liangliang Wei, Yong Wang, Zhihao Xia, Lei An, Kai Zhou, Shaobo Wu, Jiajia Ji, Yuxing Ye, Leyi Zhao, Junming Liang, Dage (…)2026-09-16

🧬 biologia

Beyond aquatic and terrestrial: a multitaxon, large-scale perspective reveals the distinct biodiversity of non-perennial rivers

Através de uma análise multitáxon de grande escala utilizando DNA ambiental, este estudo demonstra que rios não perenes abrigam comunidades únicas e diversas, distintas tanto de rios perenes quanto de solos terrestres, desafiando a visão de que sejam meramente sistemas de transição e destacando seu papel crítico na biodiversidade global.

Naiara López-Rojo, Arnaud Foulquier, Romain Sarremejane, Daniel von Schiller, Klement Tockner, Rachel Stubbington, Aitor (…)2026-09-16

🧬 biologia

Beyond Taxonomic Profiles: An Evidence-Informed Framework for Interpreting Gut Microbiome Alterations in Sickle Cell Disease

Esta revisão sistemática sintetiza evidências humanas heterogêneas sobre o microbioma intestinal na anemia falciforme para propor um arcabouço baseado em evidências que vá além de perfis taxonômicos inconsistentes em direção a hipóteses testáveis relativas a alterações metabólicas funcionais.

Tarimoboere Agbalalah2026-09-16

🧬 biologia

Simulated Annealing Identifies Five Shared Drivers of T Cell Exhaustion Across Four Human Cancers

Ao aplicar uma nova estrutura de recozimento simulado (simulated annealing) a dados de RNA-seq de célula única de quatro cânceres humanos, este estudo identifica cinco drivers conservados de exaustão de células T e vinte novos genes candidatos, ao mesmo tempo em que revela assinaturas de exaustão teciduais que desafiam o papel universal de marcadores previamente relatados como o NR4A1.

alireza ebadi2026-09-16✓ Author reviewed ⓘ

🧬 biologia

Invasive lobular carcinoma is characterized by IL33-high differentiated endothelium and IL33 receptor-positive mast-cell enrichment

Este estudo revela que o carcinoma lobular invasivo é distinguido por um microambiente vascular-imune único, caracterizado por um endotélio diferenciado com altos níveis de IL33, redução do brotamento angiogênico e um enriquecimento de mastócitos que expressam IL1RL1, os quais coletivamente o diferenciam do carcinoma ductal invasivo.

Jules Cohen2026-09-16

🧬 biologia

ViroNEXT: A multilayer hybrid system for high-precision detection of known and divergent viruses in metagenomics

O ViroNEXT é um pipeline híbrido multicamadas, totalmente automatizado e de código aberto, que combina abordagens baseadas em referência e de aprendizado de máquina para alcançar a detecção de alta precisão de vírus conhecidos e altamente divergentes em dados metagenômicos, reduzindo significativamente as classificações de falsos positivos.

Markus Santhosh Braun, Gibran Horemheb Rubio Quintanares, Martin Machyna, Janice Durschang, Csaba Miskey, Xiang-Jun Lu (…)2026-09-16

🧬 biologia

Hybrid Deep Learning–Based Computer Vision Framework for Brain Organoid and Embryoid Body Segmentation

Este artigo apresenta uma estrutura de visão computacional híbrida baseada em aprendizado profundo que combina Filtragem de Mediana, Equalização de Histograma e o Algoritmo de Watershed para alcançar segmentação e extração de características superiores para imagens de organoides cerebrais e corpos embrioides.

S. Thangapriya, K. R. Ananthapadmanaban, M. Kannan2026-09-16

🧬 biologia

MXRA5 promotes extracellular matrix remodeling and predicts poor immunotherapy response in Lung Adenocarcinoma

Este estudo identifica a MXRA5 como um driver induzido por hipóxia da remodelação da matriz extracelular e da imunossupressão no adenocarcinoma pulmonar via via PI3K-AKT, vinculando sua superexpressão ao mau prognóstico e à resistência à imunoterapia.

Bin Zhao, Tong Lu, Yuye Li2026-09-16

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