Genomic analysis of Klebsiella pneumoniae causing community-acquired respiratory deaths among Zambian infants and children using targeted RNA-probe hybridization-capture metagenomics

该研究利用靶向 RNA 探针杂交捕获宏基因组测序技术,对赞比亚七名因社区获得性肺炎死亡的婴幼儿进行了基因组分析,揭示了导致死亡的肺炎克雷伯菌具有广泛的耐药性、特定的克隆传播特征以及耐药性与高毒力因子的潜在结合,警示该病原体在撒哈拉以南非洲社区中的流行病学负担正发生严重转变。

Lindstedt, K., Wheelock, A., Samutela, M. + 25 more2026-04-15🦠 microbiology

Baseline microbiomes of the pillar coral Dendrogyra cylindrus reveal novel taxa and regional differences

该研究在石珊瑚组织损失疾病(SCTLD)爆发前,对伯利兹和库拉索的柱状珊瑚(*Dendrogyra cylindrus*)进行了微生物组表征,揭示了其核心菌群中包含未分类细菌及特定共生属,并发现了显著的区域菌株差异,强调了这些独特微生物线作为珊瑚恢复生物指标的重要性。

Cauvin, A., Carne, L., Marhaver, K. L. + 5 more2026-04-14🦠 microbiology

Mixtures that Matter: Correlation Patterns in Antibacterial and Cytotoxic Activities of Five Hop Isolates

本研究利用二维棋盘法评估了五种啤酒花提取物(葎草酮、蛇麻酮、异葎草酮、黄腐酚和异黄腐酚)对两种细菌及鸡细胞的抗菌与细胞毒性相关性,发现葎草酮与蛇麻酮的组合在保持高效抗菌活性的同时具有最低的细胞毒性,为开发基于啤酒花提取物的植物源饲料添加剂提供了重要依据。

Kober, L., von Karger, L., Castiglione, K.2026-04-14🦠 microbiology

Structural determinants of endopilus assembly, stability and functional specificity in bacterial type II secretion

该研究通过整合 NMR、冷冻电镜及生物物理分析,揭示了植物病原菌*Dickeya dadantii*与人类病原菌*Klebsiella oxytoca*中尽管序列高度相似但生态位不同的 Type II 分泌系统,其内菌毛(endopilus)在组装、稳定性及底物分泌特异性方面的关键结构决定因素,阐明了保守纳米机器如何通过细微序列变异适应不同环境。

Lejeune, M., Ivashchenko, S., Dazzoni, R. + 9 more2026-04-12🦠 microbiology

Bacterial Signatures and Community Structure in the Phyllosphere of Eugenia uniflora: Developmental Dynamics and Core Microbiome in Myrtaceae

该研究通过 16S rRNA 基因扩增子测序,揭示了巴西桃金娘科植物红果仔(*Eugenia uniflora)叶表及内生细菌群落随发育阶段(幼树与成树)的显著动态变化,鉴定了包含 16 个属(其中 5 个属在所有样本中均存在)的桃金娘科核心微生物组,并发现其功能潜力随树龄从侧重防御转向次级代谢产物合成,凸显了该领域微生物资源的未开发潜力。

Cadavid Sanchez, I. C., Esquen, D., Margis, R. + 1 more2026-04-12🦠 microbiology

Microbiome-Dependent Protection Against Corynebacterium bovis-Associated Hyperkeratosis in Nude Mice (Mus musculus)

该研究证实无胸腺裸鼠中由棒状杆菌(Corynebacterium bovis)引起的角化过度症严重程度受宿主遗传背景及肠道菌群共同影响,其中特定供体的微生物群能有效预防疾病发生,而解脲棒状杆菌(C. amycolatum)虽非致病因子但能延缓病情进展。

Fodor, K. E., Ritter, A. C., Schmieley, R. A. + 3 more2026-04-12🦠 microbiology

Characterization of household microbiomes from three unique cities around the world

这项研究利用鸟枪法宏基因组学技术,对印度迈索尔、阿联酋迪拜和美国图森三个城市的家庭微生物组进行了表征,揭示了不同国家间及家庭内部不同位置的细菌多样性显著差异,并确定了由人类活动、文化习俗、气候及表面类型等因素驱动的全球家庭核心微生物群落特征。

Scranton, C., Obergh, V., Goforth, M. + 10 more2026-04-12🦠 microbiology

Regulator-derived growth and fitness costs of Salmonella SPI-2 expression are environment specific and T3SS independent

该研究表明,沙门氏菌 SPI-2 毒力岛的主调控因子 SsrB 的表达本身(而非其下游效应物)会在特定环境(如酸性营养限制条件)下导致生长缺陷和适应性成本,且这种代价依赖于 SsrB 的 DNA 结合活性而非磷酸化,从而解释了 SPI-2 异质性表达在进化上的优势。

Spratt, M., Stumpf, C., Vigil, M. + 2 more2026-04-11🦠 microbiology

Reconstructing plant beneficial bacterial consortia by integrating dilution-to-extinction microbiome perturbation with genome-resolved synthetic ecology

该研究通过整合稀释至灭绝扰动下的宏基因组分析、基因组解析培养及合成生态学方法,成功从抑病土壤中重构出由 11 种细菌组成的合成群落,证实了该群落能复现小麦对镰刀菌的抗病表型,并鉴定出一种由节杆菌产生且能显著抑制病原菌生长的新型非α-聚氨基酸作为关键抑菌因子。

Jing, J., Ossowicki, A., Tracanna, V. + 12 more2026-04-10🦠 microbiology

Assessment of the household antibiotic resistance gene, virulence factor genes, and pathogen profiles from three global cities

该研究通过对比印度迈苏鲁、阿联酋迪拜和美国图森三个全球城市的家庭样本,揭示了抗生素耐药基因和致病因子在地理分布及家庭内部位置上的显著差异,并发现不同城市在核心耐药基因、毒力因子谱系及病毒组多样性(特别是噬菌体与人类病原体的分布)方面存在明显特征。

Scranton, C., Obergh, V., Goforth, M. + 10 more2026-04-10🦠 microbiology